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la relation enzyme – substrat.

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Academic year: 2022

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Texte intégral

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la relation enzyme – substrat.

Modèle : Quand une molécule d'enzyme rencontre une molécule de substrat, il se forme un complexe

« enzyme – substrat » puis l'enzyme se sépare du substrat transformé, et continue de se mouvoir au hasard.

Stratégie de résolution : la cinétique de la réaction peut nous permettre de rejeter cette hypothèse ou bien reste compatible avec notre modèle. La « cinétique » enzymatique est la vitesse de la catalyse enzymatique;

On l'étudie en mesurant l'apparition du produit (ou la disparition du substrat).

la réaction étudiée.

Sous l’action de la peroxydase (une enzyme présente dans les racines de radis noir), le gaïacol est oxydé par le peroxyde d’hydrogène (eau oxygénée) selon la formule suivante :

Peroxydase

Gaïacol réduit + H

2

O

2

gaïacol oxydé + 2 H

2

O (Incolore) (quinone brune)

Le Gaïacol réduit est incolore et brun quand il est oxydé en quinone. Il absorbe alors la lumière dans le bleu (à 470 nm).

Réglage du colorimètre

Uncolorimètre mesure le rapport entre la quantité de lumière qui entre et celle qui sort. Ceci est traduit par un un nombre : l'absorbance d'un milieu. Concrètement, il permet de suivre l'apparition de la couleur brune qui correspond au gaïacol oxydé.

Vérifier que l’interface ESAO soit allumée, puis régler le colorimètre sur 470 nm (Pourquoi ?)

 Lancer le programme « Logiciel Jeulin » / « Enzymo » et choisir le module colorimétrie.

 Il faut étalonner les capteurs : Remplir les petites « cuves à faces parallèles » d’eau distillée et les disposer dans le colorimètre chacune dans leur emplacement. Mettre le cache noir afin que la lumière de la salle n’influence pas les résultats.

 Dans la barre d’outils du logiciel aller dans « Réglage / Console ESSAO 3/Tester » puis «/Adaptateur/

Étalonner le colorimètre »

 Il faut également régler d’autre paramètres : Choisir d’afficher l’absorbance en fonction du temps. L’eau distillée étant transparente, l’absorbance doit être de 0%.

Suivi de l'apparition du gaïacol oxydé. Variation de [E]

Verser le contenu du tube n°1 dans les quatre cuves à face parallèles.

 Il ne faut ajouter l’enzyme que juste avant de débuter la mesure.

Observer le graphique obtenu par le logiciel et décrire l’évolution de l’absorbance dans les tubes.

Indiquer à côté de chaque tube sa couleur au bout de 5 min et l’interprétation que vous pouvez en faire.

Comment varie V en fonction de [E] ?

 3 gouttes de filtrat de radis noir

 2 gouttes de filtrat de radis noir

Schéma du protocole expérimental Tube à essais n°1 : 10 ml de

Tube n°1 Tube n°2

Tube n°3

Tube n°4

 1 goutte de filtrat de radis noir aucune goutte de

filtrat de radis noir

Substrat : H2O2 + gaïacol

(2)

Suivi de l'apparition du gaïacol oxydé. Variation de [S]

Réaliser la manipulation suivante : Verser 2,5 ml de contenu du tube n°2 dans quatre nouvelles « cuves à face parallèles » numérotées ou rincées correctement les précédentes. Suivre les consignes du logiciel.

Observer le graphique obtenu par le logiciel et décrire l’évolution de l’absorbance dans les tubes. Indiquer à côté de chaque tube sa couleur au bout de 5 min et l’interprétation que vous pouvez faire de celle-ci.

Comment varie V en fonction de [S] ? Tube à essais n°2 : 10 ml de

tampon pH =7 + 5ml de Gaïacol



de



de



de



de

1ml de la solution H2O2 à 3/100

1ml de la solution H2O2

à 1/500

1ml de la solution H2O2

à 1/100

1ml d'eau distillée  Il ne faut ajouter l’enzyme que juste avant de débuter la

mesure.

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