Les Eucaryotes unicellulaires
Aix-Marseille University
Mediterranean Institute of Oceanography (MIO) Licence SME - UE 12 Microbiologie
unicellulaires
Charles F.
Boudouresque
2
www.com.univ-mrs.fr/~boudouresque Charles F. Boudouresque
Email : charles.boudouresque@univ-amu.fr
2
Citation :
Boudouresque C.F., 2012. Les Eucaryotes unicellulaires.
Deuxième partie. www.com.univ-mrs.fr/~boudouresque
Diapositives 1-59.
1. Introduction
2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes
4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques
5. Quelques remarque nomenclaturales 5. Quelques remarque nomenclaturales
6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires
6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries
L’appareil cinétique
Opisthochontes
Amoebobiontes
Sens du déplacement
Bichontes
D'après Lecointre et Le Guyader (2006).
Modifié et complété (Boudouresque, 2011)
Opisthochontes + Amoebobiontes = Unichontes A noter : appareil cinétique perdu
secondairement chez les Rhodobiontes, les
Microsporidies et une grande partie des Fungi
Embryo- phytes Charo- phycées
Chlorophycées Prasinophycées
Rhodo- biontes
Glauco- cysto- biontes
Labyrinthulobiontes Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes
STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)
ALVÉOLÉS (=
ALVÉOLÉS (=
ALVEOLATA) ALVEOLATA)
RHIZARIA RHIZARIA Cen-
tro- heli-
da ? Actino-
phryda
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Chlorobiontes
Viridiplantae
Phytomyxea Haplo- sporidies
Streptobiontes Euglyphides
Retaria Cercobiontes
ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)
(= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Bicosoécidés Picobiliphytes ?
Katablépharides CRYPTO-
Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées
L’appareil cinétique : 3 cas
Lobosa Mycétobiontes
Chytridiomycètes
Fungi
Choanoflagellés
Para- basa-
lia Retorta-
mona- dines
Euglé- noïdes Kinéto- plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa)
Chromobiontes Oobiontes
AMOEBO- BIONTES (=
AMOEBOZOA) HAPTOBIONTES
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Eugléno- biontes Archamaeba
U n ic h o n te s
Diplo-
Oxymo- nadines
Bicosoécidés
Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes
Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES
LECA
L'appareil cinétique tient une grande place dans la taxonomie des Eucaryotes
Caractères ancestraux (= caractères partagés,
présents chez tous les Eucaryotes, hérités de LECA, l’ancêtre commun des Eucaryotes)
Comporte 5 parties (dont certaines peuvent être absentes) :
1. Cinétosomes Chloroplaste
Cytosquelette (actine, tubuline)
6 2. Undulipodiums
4. Centrosome 5. Stig-
ma.
Orga- nelle photo- sensi- ble (ca- rotènes)
3. Racines undulipodiaires
Insertion antérieure ou postérieure des undulipodiums Nombre d'undulipodiums
Undulipodiums identiques ou différents
L'appareil cinétique tient une grande place dans la taxonomie des Eucaryotes
Caractères dérivés (qui distinguent les
règnes et autres taxons : apparus au cours de l’évolution, postérieurement à LECA)
Undulipodiums identiques ou différents
Mastigonèmes (uni-, di- ou tripartites), écailles Haptonème
Liens avec le cytosquelette Stigma et position du stigma
Absence (secondaire ?) d'appareil cinétique
Embryo- phytes Charo- phycées
Chlorophycées Prasinophycées
Rhodo- biontes
Glauco- cysto- biontes
Labyrinthulobiontes Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes
STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)
ALVÉOLÉS (=
ALVÉOLÉS (=
ALVEOLATA) ALVEOLATA)
RHIZARIA RHIZARIA Cen-
tro- heli-
da ? Actino-
phryda
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Chlorobiontes
Viridiplantae
Phytomyxea Haplo- sporidies
Streptobiontes Euglyphides
Retaria Cercobiontes
ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)
(= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Bicosoécidés Picobiliphytes ?
Katablépharides CRYPTO-
Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées
L’appareil cinétique : 3 cas
Lobosa Mycétobiontes
Chytridiomycètes
Fungi
Choanoflagellés
Méta- zoaires (= ani- maux)
Para- basa-
lia Retorta-
mona- dines
Euglé- noïdes Kinéto- plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Percolobiontes
Chromobiontes Oobiontes
EXCAVATES
EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBO-
BIONTES (=
AMOEBOZOA)
OPISTHO- CHONTES
HAPTOBIONTES
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Eugléno- biontes Archamaeba
U n ic h o n te s
Diplo- mona- dines
Oxymo- nadines
Bicosoécidés
Eumétazoaires Placozoaires Spongiaires Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes
Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES
LECA
Impossible de traiter tous les caractères dérivés de chaque règne ou clade
- Appareil cinétique
- Appareil photosynthétique (quand il existe) - Paroi cellulaire
- Signatures chimiques
Impossible de traiter tous les règnes ou clades
Nous nous concentrerons sur quelques uns
1. Introduction
2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes
4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques
5. Quelques remarque nomenclaturales
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5. Quelques remarque nomenclaturales
6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastida
6.2.1. Les Centrohelida
Embryo- phytes Charo- phycées
Chlorophycées Prasinophycées
Rhodo- biontes
Glauco- cysto- biontes
Labyrinthulobiontes Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes
STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)
ALVÉOLÉS (=
ALVÉOLÉS (=
ALVEOLATA) ALVEOLATA)
RHIZARIA RHIZARIA Cen-
tro- heli-
da ? Actino-
phryda
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Chlorobiontes
Viridiplantae
Phytomyxea Haplo- sporidies
Streptobiontes Euglyphides
Retaria Cercobiontes
ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)
(= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Bicosoécidés Picobiliphytes ?
Katablépharides CRYPTO-
Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées
D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)
Les Centrohelida
Lobosa Mycétobiontes
Chytridiomycètes
Fungi
Choanoflagellés
Para- basa-
lia Retorta-
mona- dines
Euglé- noïdes Kinéto- plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa)
Chromobiontes Oobiontes
AMOEBO- BIONTES (=
AMOEBOZOA) HAPTOBIONTES
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Eugléno- biontes Archamaeba
U n ic h o n te s
Diplo-
Oxymo- nadines
Bicosoécidés
Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes
Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES
LECA
Labyrinthulobiontes STRAMÉNOPILES
ALVÉOLÉS ALVÉOLÉS
RHIZARIA RHIZARIA Centro-
helida ARCHAEPLASTIDA
ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE) (= PLANTAE)
Les Centrohelida se sont individualisés avant l’évènement fondateur du chloroplaste (endosymbiose primaire)
EXCAVATES
EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBOBIONTES
OPISTHOCHONTES
Haptobiontes Cryptobiontes
Axopode
Mitochondrie Ecaille siliceuse Ecaille siliceuse
Centroplaste
Schéma de la cellule de Centrohelida
Noyau
Microtubule
Centroplaste
Axopodes (fins) et spicules siliceux sur les axopodes
Unicellulaires, sphériques, 30-80 µm de diamètre. Pas de paroi
cellulaire. Plancton marin et d'eau douce
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Raphidiophrys pallida
1. Introduction
2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes
4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques
5. Quelques remarque nomenclaturales
6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastida
6.2.1. Les Centrohelida
6.2.2. Les Glaucocystobiontes
Embryo- phytes Charo- phycées
Chlorophycées Prasinophycées
Rhodo- biontes
Glauco- cysto- biontes
Labyrinthulobiontes Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes
STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)
ALVÉOLÉS (=
ALVÉOLÉS (=
ALVEOLATA) ALVEOLATA)
RHIZARIA RHIZARIA Cen-
tro- heli-
da ? Actino-
phryda
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Chlorobiontes
Viridiplantae
Phytomyxea Haplo- sporidies
Streptobiontes Euglyphides
Retaria Cercobiontes
ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)
(= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Bicosoécidés Picobiliphytes ?
Katablépharides CRYPTO-
Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées
D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)
Les Glaucocystobiontes
Lobosa Mycétobiontes
Chytridiomycètes
Fungi
Choanoflagellés
Méta- zoaires (= ani- maux)
Para- basa-
lia Retorta-
mona- dines
Euglé- noïdes Kinéto- plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Percolobiontes
Chromobiontes Oobiontes
EXCAVATES
EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBO-
BIONTES (=
AMOEBOZOA)
OPISTHO- CHONTES
HAPTOBIONTES
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Eugléno- biontes Archamaeba
U n ic h o n te s
Diplo- mona- dines
Oxymo- nadines
Bicosoécidés
Eumétazoaires Placozoaires Spongiaires Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes
Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES
LECA
Les Glaucocystobiontes (= Glaucophytes, Glaucocystophytes)
Le taxon le plus proche de l’endosymbiose primaire à l’origine du chloroplaste : dans le chloroplaste, la paroi cellulaire de la Cyanobactérie est conservée (= caractéristique)
Chloroplaste très proche des Cyanobactéries : chlorophylle a, phycobilines, thylakoïdes isolés
Mitochondries : crêtes en piles d’assiettes
Vivent dans les mares d’eau douce des régions tempérées et lacs acides des régions nordiques
Undulipodiums : différents (1 long et 1 court) avec
mastigonèmes unipartites (= caractéristique)
Noyau ADN
eucaryotique
Cyto-
Chloro- plaste
Thylakoïde (chlorophylle a) Phycobilisome contenant des
phycobilines
Alvéole
Centrosome
Cinétosome
Undulipodium long avec
mastigonèmes unipartites
Schéma de la cellule de Glaucocystobiontes
Paroi cellulaire : cellulose Plasma- lemme Cyto- plasme
Mitochon- drie
ADN procaryo- tique
Ribosome procaryo- tique 70S
Ribosome eucaryoti- que 80S
Polysaccharide
extraplastidial : amidon (polymère de a1-4 glucose)
Undulipodium court avec mastigonèmes unipartites
D’après Boudouresque (2011)
Les trois genres de
Les trois genres de
Glaucocystobiontes
1. Introduction
2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes
4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques
5. Quelques remarque nomenclaturales
6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries
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6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastida
6.2.1. Les Centrohelida
6.2.2. Les Glaucocystobiontes 6.3. Les Rhizaria
6.3.1. Les Radiolaires
Embryo- phytes Charo- phycées
Chlorophycées Prasinophycées
Rhodo- biontes
Glauco- cysto- biontes
Labyrinthulobiontes Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes
STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)
ALVÉOLÉS (=
ALVÉOLÉS (=
ALVEOLATA) ALVEOLATA)
RHIZARIA RHIZARIA Cen-
tro- heli-
da ? Actino-
phryda
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Chlorobiontes
Viridiplantae
Phytomyxea Haplo- sporidies
Streptobiontes Euglyphides
Retaria Cercobiontes
ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)
(= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Bicosoécidés Picobiliphytes ?
Katablépharides CRYPTO-
Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées
D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)
LE REGNE DES RHIZARIA : Radiolaires
Lobosa Mycétobiontes
Chytridiomycètes
Fungi
Choanoflagellés
Para- basa-
lia Retorta-
mona- dines
Euglé- noïdes Kinéto- plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa)
Chromobiontes Oobiontes
AMOEBO- BIONTES (=
AMOEBOZOA) HAPTOBIONTES
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Eugléno- biontes Archamaeba
U n ic h o n te s
Diplo-
Oxymo- nadines
Bicosoécidés
Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes
Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES
LECA
Le squelette siliceux de Coelodiceras spinosum (Phaeodaria, Radiolaires)
Plancton des eaux froides des deux hémisphères
22 200 µm
D’après Paterson et al., 2007.
Deep-Sea
Res. II, 54 :
1094-1102.
Radiolaires
Acanthofracta
Radiolaires Cyrtoidea
24 D’après Haeckel, 1904.
Kunstformen der Natur
Radiolaires Phaeodaria
Radiolaires
Unicellulaires
Squelette siliceux. Symétrie radiale, axiale ou asymétrique. Depuis 600 Ma. Se fossilisent bien
Pas de paroi cellulaire. Pseudopodes armés (axopodes) et non armés minces (filopodes)
Reproduction asexuée : division binaire. + conidies à deux undulipodiums lisses inégaux (anciens gamètes ?)
26
undulipodiums lisses inégaux (anciens gamètes ?)
Reproduction sexuée inconnue (perte secondaire ?).
Plancton marin. Prédateurs d’unicellulaires et de larves de
Métazoaires : lien trophique plancton photosynthétique unicellulaire (UPOs) méso-plancton
Rôle dans le transfert vertical de silice
1. Introduction
2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes
4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques
5. Quelques remarque nomenclaturales
6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastidia
6.2.1. Les Centrohelida
6.2.2. Les Glaucocystobiontes 6.3. Les Rhizaria
6.3.1. Les Radiolaires
6.3.2. Les Foraminifères
Embryo- phytes Charo- phycées
Chlorophycées Prasinophycées
Rhodo- biontes
Glauco- cysto- biontes
Labyrinthulobiontes Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes
STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)
ALVÉOLÉS (=
ALVÉOLÉS (=
ALVEOLATA) ALVEOLATA)
RHIZARIA RHIZARIA Cen-
tro- heli-
da ? Actino-
phryda
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Chlorobiontes
Viridiplantae
Phytomyxea Haplo- sporidies
Streptobiontes Euglyphides
Retaria Cercobiontes
ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)
(= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Bicosoécidés Picobiliphytes ?
Katablépharides CRYPTO-
Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées
D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)
LE REGNE DES RHIZARIA : Foraminifères
Lobosa Mycétobiontes
Chytridiomycètes
Fungi
Choanoflagellés
Méta- zoaires (= ani- maux)
Para- basa-
lia Retorta-
mona- dines
Euglé- noïdes Kinéto- plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Percolobiontes
Chromobiontes Oobiontes
EXCAVATES
EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBO-
BIONTES (=
AMOEBOZOA)
OPISTHO- CHONTES
HAPTOBIONTES
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Eugléno- biontes Archamaeba
U n ic h o n te s
Diplo- mona- dines
Oxymo- nadines
Bicosoécidés
Eumétazoaires Placozoaires Spongiaires Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes
Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES
LECA
Unicellulaires géants (20 µm à plusieurs centimètres de diamètre) Test perforé de trous (= caractéristique) : une à plusieurs loges Paroi : - absente (mais particules agglutinées)
- ou glycoprotéique
- ou carbonate de calcium (le plus fréquent) - ou siliceuse
Foraminifères
Cytoplasme avec cytosquelette très développé et pseudopodes fins (filopodes) très nombreux sortant par les trous du test et servant aux déplacements et à la prise de nourriture
Les gamètes possèdent deux undulipodiums et les spores 4.
Undulipodiums inégaux, lisses, avec un mastigonème terminal
(= caractéristique)
Les pseudopodes (filopodes) d'un Foraminifère
30
Pseudopodes
(filopodes)
Cycle
biologique
Gamétogène (n, uninucléé)
Gamètes mâles et femelles (n)
Zygote (2n)
Sporogène (2n,
32
Sporogène (2n, multinucléé) isomorphe ou
hétéromorphe par rapport au
gamétogène
Méiose spores (n) Conidies (n)
Cycle digénétique
haplo-diplophasique
Exclusivement marins, surtout benthiques, plus rarement planctoniques
Normalement prédateurs (Ciliés, Nématodes, larves de Crustacés, Organismes unicellulaires photosynthétiques UPOs) et/ou
détritivores (POM, DOC)
Parfois symbiotiques (endosymbiontes mutualistes) avec Parfois symbiotiques (endosymbiontes mutualistes) avec Dinobiontes, Chrysophycées, Bacillariophycées
Rôle géologique. Plus anciens fossiles : Cambrien (540 Ma) Certaines espèces kleptoplastes : récupération de
chloroplastes de diatomées (Chromobiontes, Straménopiles)
Une espèce benthique Méditerra- née
Habitats sciaphiles
1 mm
34
Miniacina
miniacea
Miniacina miniacea sur rhizome de Posidonia oceanica.
On distingue les filopodes
Corse : plages de sable rouge dû à Miniacina miniacea
36 Golfe d’Aiacciu (Ajaccio)
et Ruppione
Photo Frédéric André
1. Introduction
2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes
4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques
5. Quelques remarque nomenclaturales
6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastidia
6.2. Les Archaeplastidia
6.2.1. Les Centrohelida
6.2.2. Les Glaucocystobiontes 6.3. Les Rhizaria
6.3.1. Les Radiolaires
6.3.2. Les Foraminifères
6.3.3. Les Phytomyxea
Embryo- phytes Charo- phycées
Chlorophycées Prasinophycées
Rhodo- biontes
Glauco- cysto- biontes
Labyrinthulobiontes Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes
STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)
ALVÉOLÉS (=
ALVÉOLÉS (=
ALVEOLATA) ALVEOLATA)
RHIZARIA RHIZARIA Cen-
tro- heli-
da ? Actino-
phryda
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Chlorobiontes
Viridiplantae
Phytomyxea Haplo- sporidies
Streptobiontes Euglyphides
Retaria Cercobiontes
ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)
(= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Bicosoécidés Picobiliphytes ?
Katablépharides CRYPTO-
Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées
D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)
LE REGNE DES RHIZARIA : Phytomyxea
Lobosa Mycétobiontes
Chytridiomycètes
Fungi
Choanoflagellés
Méta- zoaires (= ani- maux)
Para- basa-
lia Retorta-
mona- dines
Euglé- noïdes Kinéto- plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Percolobiontes
Chromobiontes Oobiontes
EXCAVATES
EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBO-
BIONTES (=
AMOEBOZOA)
OPISTHO- CHONTES
HAPTOBIONTES
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Eugléno- biontes Archamaeba
U n ic h o n te s
Diplo- mona- dines
Oxymo- nadines
Bicosoécidés
Eumétazoaires Placozoaires Spongiaires Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes
Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES
LECA
Phytomyxea
Faisaient partie des ‘champignons ’ Syncytium
Deux undulipodiums lisses et inégaux Deux undulipodiums lisses et inégaux
Parasites intracellulaires d’Embryobiontes et
de diatomées (Straménopiles)
Plasmodiophora brassicae (Phytomyxea, Rhizaria)
Parasite intracellulaire du choux
Syncytiums (= plasmodes) plurinucléés
Provoque des protubérances sur les racines
Coupe de
www.dipbot.unict.it
40
Racines infectées
Coupe de
la racine,
montrant
des
groupes
de cellules
infectées
Gamétogène (n)
Le biocycle de Plasmodiophora
Formation de gamètes
Sporogène (2n) Méiose
Spores (n)
Gamie Zygote (2n)
Sporogène (2n)
Méiose
Phagomyxa odonthellae (Phytomyxea) parasitant la diatomée Odonthella sinensis
20 µm 42
20 µm
Détail d’un gamétocyste contenant de nombreux gamètes
D’après Schnepf et al., 2000.
Helgol. Mar. Res., 54 : 237-242.
1. Introduction
2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes
4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques
5. Quelques remarque nomenclaturales
6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastidia
6.2. Les Archaeplastidia 6.3. Les Rhizaria
6.4. Les Cryptophytes
Embryo- phytes Charo- phycées
Chlorophycées Prasinophycées
Rhodo- biontes
Glauco- cysto- biontes
Labyrinthulobiontes Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes
STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)
ALVÉOLÉS (=
ALVÉOLÉS (=
ALVEOLATA) ALVEOLATA)
RHIZARIA RHIZARIA Cen-
tro- heli-
da ? Actino-
phryda
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Chlorobiontes
Viridiplantae
Phytomyxea Haplo- sporidies
Streptobiontes Euglyphides
Retaria Cercobiontes
ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)
(= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Bicosoécidés Picobiliphytes ?
Katablépharides CRYPTO-
Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées
D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)
LES CRYPTOPHYTES
Lobosa Mycétobiontes
Chytridiomycètes
Fungi
Choanoflagellés
Méta- zoaires (= ani- maux)
Para- basa-
lia Retorta-
mona- dines
Euglé- noïdes Kinéto- plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Percolobiontes
Chromobiontes Oobiontes
EXCAVATES
EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBO-
BIONTES (=
AMOEBOZOA)
OPISTHO- CHONTES
HAPTOBIONTES
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Eugléno- biontes Archamaeba
U n ic h o n te s
Diplo- mona- dines
Oxymo- nadines
Bicosoécidés
Eumétazoaires Placozoaires Spongiaires Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes
Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES
LECA
Egalement nommés Cryptophytes, Cryptophycées, Cryptomonadines
Organismes unicellulaires, la plupart photosynthétiques
La position dans l'arbre du vivant reste incertaine : relations avec les Haptobiontes ? Les Straménopiles ?
Le chloroplaste provient d'une endosymbiose secondaire avec un Rhodobionte
Dans le chloroplaste, les thylakoïdes sont groupés par deux (lamelles) (= caractéristique)
Présence de phycobilines dans le lumen du thylakoïde (et non dans des Présence de phycobilines dans le lumen du thylakoïde (et non dans des phycobilisomes) (= caractéristique)
Rhizostyle dans le prolongement d’un cinétosome (= caractéristique) Présence d’un deuxième noyau (nucléomorphe), reste de
l’endosymbiose secondaire (= caractéristique)
Equipements pour la prédation (vestibule, éjectisomes) et corps
Plasma- lemme Noyau
ADN eucaryotique
Plaque du péri- plaste
Nucléomorphe avec ADN eucaryotique
Complexe nucléo- plastidial (CNP) Ribosome 80 S
périplastidial
Mitochondrie à crêtes en pile d’assiettes Chloroplaste
ADN procaryotique Ribosome 70 S
Thylakoïdes en lamelles de 2.
Chlorophylles a et c phycobilines dans le lumen
Stigma
Vacuole pulsatile
Undulipodium avec mastigonè-
Cinétosomes
D’après Boudoures- que, 2011
plaste
Corps de Maupas Ribosome 80 S
cytoplasmique Cyto-
plasme
Polysaccharide
périplastidial : rhodamylon Ecaille Ejecti-
some (tricho- cyste)
avec mastigonè- mes dipartites sur
2 rangées
Undulipodium avec mastigo- nèmes dipartites sur 1 rangée Centrosome
Rhizostyle Vestibule (sorte
de cytostome)
Les deux undulipodiums de Cryptomonas ovata
Deux rangées de mastigonèmes sur l’un des undulipodiums, une seule sur l’autre (= caractéristique)
D’après Hibberd et al., 1971.
Br. phycol. J., 6 (1) : 61-72.
Les Cryptobiontes sont des organismes aquatiques (milieu marin, eaux douces et eau intersticielle des sols
La plupart des
espèces sont auto- trophes ou mixotro- phes
Quelques espèces sont des parasites intestinaux de
Métazoaires (perte
48
Métazoaires (perte secondaire de la photosynthèse) Quelques espèces sont des endosym- biontes de Dino- biontes
Chilomonas
paramecium. Les
undulipodiums sont
présents mais non
visibles
1. Introduction
2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes
4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques
5. Quelques remarque nomenclaturales
6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastidia
6.2. Les Archaeplastidia
6.2.1. Les Centrohelida
6.2.2. Les Glaucocystobiontes 6.3. Les Rhizaria
6.4. Les Cryptobiontes
6.5. Les Haptobiontes
Embryo- phytes Charo- phycées
Chlorophycées Prasinophycées
Rhodo- biontes
Glauco- cysto- biontes
Labyrinthulobiontes Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes
STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)
ALVÉOLÉS (=
ALVÉOLÉS (=
ALVEOLATA) ALVEOLATA)
RHIZARIA RHIZARIA Cen-
tro- heli-
da ? Actino-
phryda
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Chlorobiontes
Viridiplantae
Phytomyxea Haplo- sporidies
Streptobiontes Euglyphides
Retaria Cercobiontes
ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)
(= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Bicosoécidés Picobiliphytes ?
Katablépharides CRYPTO-
Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées
D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)
Le règne des Haptobiontes
Lobosa Mycétobiontes
Chytridiomycètes
Fungi
Choanoflagellés
Méta- zoaires (= ani- maux)
Para- basa-
lia Retorta-
mona- dines
Euglé- noïdes Kinéto- plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Percolobiontes
Chromobiontes Oobiontes
EXCAVATES
EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBO-
BIONTES (=
AMOEBOZOA)
OPISTHO- CHONTES
HAPTOBIONTES
C h ro m a lv é o lé s C h ro m a lv é o lé s
Eugléno- biontes Archamaeba
U n ic h o n te s
Diplo- mona- dines
Oxymo- nadines
Bicosoécidés
Eumétazoaires Placozoaires Spongiaires Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes
Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES
LECA
Egalement nommées Haptophycées, Haptophytes, Prymnésiophycées, Prymnésiophytes, Coccolithophoridés
La position dans l'arbre du vivant reste incertaine.
Proches des Straménopiles ?
Sous le plasmalemme, une enveloppe de réticulum endoplasmique (caractéristique des Haptobiontes)
Toujours unicellulaires
Haptonème
Pas de paroi cellulaire des Haptobiontes)
Unduli- podium
Ecailles souvent énormes (cocolithes) (caractéristique)
Appareil cinétique : deux undulipodiums (structure 9 + 2) + un
haptonème (5-7 microfibrilles) (caractéristique). Rôle de l’haptonème :
détection obstacles, fixation, capture des proies, transfert des proies
Noyau ADN
eucaryotique
Cyto- plasme
Chloroplaste Complexe nucléo-
plastidial (CNP)
Thylakoïdes en lamelles de 3. Chlorophylles a et c
ADN procaryotique Ribosome 70 S Undulipodium avec
mastigonème non tubulaires Ecaille
(coccolithe)
Cellule de Haptobionte
D’après Boudoures-que, 2011