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ChlorobiontesViridiplantaeStreptobiontesRetariaCercobiontesFungiMéta-zoaires (= ani-maux)

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(1)

Les Eucaryotes unicellulaires

Aix-Marseille University

Mediterranean Institute of Oceanography (MIO) Licence SME - UE 12 Microbiologie

unicellulaires

Charles F.

Boudouresque

2

(2)

www.com.univ-mrs.fr/~boudouresque Charles F. Boudouresque

Email : charles.boudouresque@univ-amu.fr

2

Citation :

Boudouresque C.F., 2012. Les Eucaryotes unicellulaires.

Deuxième partie. www.com.univ-mrs.fr/~boudouresque

Diapositives 1-59.

(3)

1. Introduction

2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes

4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques

5. Quelques remarque nomenclaturales 5. Quelques remarque nomenclaturales

6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires

6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries

(4)

L’appareil cinétique

Opisthochontes

Amoebobiontes

Sens du déplacement

Bichontes

D'après Lecointre et Le Guyader (2006).

Modifié et complété (Boudouresque, 2011)

Opisthochontes + Amoebobiontes = Unichontes A noter : appareil cinétique perdu

secondairement chez les Rhodobiontes, les

Microsporidies et une grande partie des Fungi

(5)

Embryo- phytes Charo- phycées

Chlorophycées Prasinophycées

Rhodo- biontes

Glauco- cysto- biontes

Labyrinthulobiontes Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes

STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)

ALVÉOLÉS (=

ALVÉOLÉS (=

ALVEOLATA) ALVEOLATA)

RHIZARIA RHIZARIA Cen-

tro- heli-

da ? Actino-

phryda

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Chlorobiontes

Viridiplantae

Phytomyxea Haplo- sporidies

Streptobiontes Euglyphides

Retaria Cercobiontes

ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)

(= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Bicosoécidés Picobiliphytes ?

Katablépharides CRYPTO-

Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées

L’appareil cinétique : 3 cas

Lobosa Mycétobiontes

Chytridiomycètes

Fungi

Choanoflagellés

Para- basa-

lia Retorta-

mona- dines

Euglé- noïdes Kinéto- plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa)

Chromobiontes Oobiontes

AMOEBO- BIONTES (=

AMOEBOZOA) HAPTOBIONTES

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Eugléno- biontes Archamaeba

U n ic h o n te s

Diplo-

Oxymo- nadines

Bicosoécidés

Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes

Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES

LECA

(6)

L'appareil cinétique tient une grande place dans la taxonomie des Eucaryotes

Caractères ancestraux (= caractères partagés,

présents chez tous les Eucaryotes, hérités de LECA, l’ancêtre commun des Eucaryotes)

Comporte 5 parties (dont certaines peuvent être absentes) :

1. Cinétosomes Chloroplaste

Cytosquelette (actine, tubuline)

6 2. Undulipodiums

4. Centrosome 5. Stig-

ma.

Orga- nelle photo- sensi- ble (ca- rotènes)

3. Racines undulipodiaires

(7)

Insertion antérieure ou postérieure des undulipodiums Nombre d'undulipodiums

Undulipodiums identiques ou différents

L'appareil cinétique tient une grande place dans la taxonomie des Eucaryotes

Caractères dérivés (qui distinguent les

règnes et autres taxons : apparus au cours de l’évolution, postérieurement à LECA)

Undulipodiums identiques ou différents

Mastigonèmes (uni-, di- ou tripartites), écailles Haptonème

Liens avec le cytosquelette Stigma et position du stigma

Absence (secondaire ?) d'appareil cinétique

(8)

Embryo- phytes Charo- phycées

Chlorophycées Prasinophycées

Rhodo- biontes

Glauco- cysto- biontes

Labyrinthulobiontes Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes

STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)

ALVÉOLÉS (=

ALVÉOLÉS (=

ALVEOLATA) ALVEOLATA)

RHIZARIA RHIZARIA Cen-

tro- heli-

da ? Actino-

phryda

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Chlorobiontes

Viridiplantae

Phytomyxea Haplo- sporidies

Streptobiontes Euglyphides

Retaria Cercobiontes

ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)

(= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Bicosoécidés Picobiliphytes ?

Katablépharides CRYPTO-

Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées

L’appareil cinétique : 3 cas

Lobosa Mycétobiontes

Chytridiomycètes

Fungi

Choanoflagellés

Méta- zoaires (= ani- maux)

Para- basa-

lia Retorta-

mona- dines

Euglé- noïdes Kinéto- plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Percolobiontes

Chromobiontes Oobiontes

EXCAVATES

EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBO-

BIONTES (=

AMOEBOZOA)

OPISTHO- CHONTES

HAPTOBIONTES

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Eugléno- biontes Archamaeba

U n ic h o n te s

Diplo- mona- dines

Oxymo- nadines

Bicosoécidés

Eumétazoaires Placozoaires Spongiaires Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes

Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES

LECA

(9)

Impossible de traiter tous les caractères dérivés de chaque règne ou clade

- Appareil cinétique

- Appareil photosynthétique (quand il existe) - Paroi cellulaire

- Signatures chimiques

Impossible de traiter tous les règnes ou clades

Nous nous concentrerons sur quelques uns

(10)

1. Introduction

2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes

4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques

5. Quelques remarque nomenclaturales

10

5. Quelques remarque nomenclaturales

6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastida

6.2.1. Les Centrohelida

(11)

Embryo- phytes Charo- phycées

Chlorophycées Prasinophycées

Rhodo- biontes

Glauco- cysto- biontes

Labyrinthulobiontes Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes

STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)

ALVÉOLÉS (=

ALVÉOLÉS (=

ALVEOLATA) ALVEOLATA)

RHIZARIA RHIZARIA Cen-

tro- heli-

da ? Actino-

phryda

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Chlorobiontes

Viridiplantae

Phytomyxea Haplo- sporidies

Streptobiontes Euglyphides

Retaria Cercobiontes

ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)

(= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Bicosoécidés Picobiliphytes ?

Katablépharides CRYPTO-

Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées

D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)

Les Centrohelida

Lobosa Mycétobiontes

Chytridiomycètes

Fungi

Choanoflagellés

Para- basa-

lia Retorta-

mona- dines

Euglé- noïdes Kinéto- plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa)

Chromobiontes Oobiontes

AMOEBO- BIONTES (=

AMOEBOZOA) HAPTOBIONTES

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Eugléno- biontes Archamaeba

U n ic h o n te s

Diplo-

Oxymo- nadines

Bicosoécidés

Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes

Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES

LECA

(12)

Labyrinthulobiontes STRAMÉNOPILES

ALVÉOLÉS ALVÉOLÉS

RHIZARIA RHIZARIA Centro-

helida ARCHAEPLASTIDA

ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE) (= PLANTAE)

Les Centrohelida se sont individualisés avant l’évènement fondateur du chloroplaste (endosymbiose primaire)

EXCAVATES

EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBOBIONTES

OPISTHOCHONTES

Haptobiontes Cryptobiontes

(13)

Axopode

Mitochondrie Ecaille siliceuse Ecaille siliceuse

Centroplaste

Schéma de la cellule de Centrohelida

Noyau

Microtubule

Centroplaste

(14)

Axopodes (fins) et spicules siliceux sur les axopodes

Unicellulaires, sphériques, 30-80 µm de diamètre. Pas de paroi

cellulaire. Plancton marin et d'eau douce

14

Raphidiophrys pallida

(15)

1. Introduction

2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes

4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques

5. Quelques remarque nomenclaturales

6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastida

6.2.1. Les Centrohelida

6.2.2. Les Glaucocystobiontes

(16)

Embryo- phytes Charo- phycées

Chlorophycées Prasinophycées

Rhodo- biontes

Glauco- cysto- biontes

Labyrinthulobiontes Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes

STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)

ALVÉOLÉS (=

ALVÉOLÉS (=

ALVEOLATA) ALVEOLATA)

RHIZARIA RHIZARIA Cen-

tro- heli-

da ? Actino-

phryda

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Chlorobiontes

Viridiplantae

Phytomyxea Haplo- sporidies

Streptobiontes Euglyphides

Retaria Cercobiontes

ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)

(= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Bicosoécidés Picobiliphytes ?

Katablépharides CRYPTO-

Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées

D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)

Les Glaucocystobiontes

Lobosa Mycétobiontes

Chytridiomycètes

Fungi

Choanoflagellés

Méta- zoaires (= ani- maux)

Para- basa-

lia Retorta-

mona- dines

Euglé- noïdes Kinéto- plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Percolobiontes

Chromobiontes Oobiontes

EXCAVATES

EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBO-

BIONTES (=

AMOEBOZOA)

OPISTHO- CHONTES

HAPTOBIONTES

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Eugléno- biontes Archamaeba

U n ic h o n te s

Diplo- mona- dines

Oxymo- nadines

Bicosoécidés

Eumétazoaires Placozoaires Spongiaires Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes

Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES

LECA

(17)

Les Glaucocystobiontes (= Glaucophytes, Glaucocystophytes)

Le taxon le plus proche de l’endosymbiose primaire à l’origine du chloroplaste : dans le chloroplaste, la paroi cellulaire de la Cyanobactérie est conservée (= caractéristique)

Chloroplaste très proche des Cyanobactéries : chlorophylle a, phycobilines, thylakoïdes isolés

Mitochondries : crêtes en piles d’assiettes

Vivent dans les mares d’eau douce des régions tempérées et lacs acides des régions nordiques

Undulipodiums : différents (1 long et 1 court) avec

mastigonèmes unipartites (= caractéristique)

(18)

Noyau ADN

eucaryotique

Cyto-

Chloro- plaste

Thylakoïde (chlorophylle a) Phycobilisome contenant des

phycobilines

Alvéole

Centrosome

Cinétosome

Undulipodium long avec

mastigonèmes unipartites

Schéma de la cellule de Glaucocystobiontes

Paroi cellulaire : cellulose Plasma- lemme Cyto- plasme

Mitochon- drie

ADN procaryo- tique

Ribosome procaryo- tique 70S

Ribosome eucaryoti- que 80S

Polysaccharide

extraplastidial : amidon (polymère de a1-4 glucose)

Undulipodium court avec mastigonèmes unipartites

D’après Boudouresque (2011)

(19)

Les trois genres de

Les trois genres de

Glaucocystobiontes

(20)

1. Introduction

2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes

4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques

5. Quelques remarque nomenclaturales

6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries

20

6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastida

6.2.1. Les Centrohelida

6.2.2. Les Glaucocystobiontes 6.3. Les Rhizaria

6.3.1. Les Radiolaires

(21)

Embryo- phytes Charo- phycées

Chlorophycées Prasinophycées

Rhodo- biontes

Glauco- cysto- biontes

Labyrinthulobiontes Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes

STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)

ALVÉOLÉS (=

ALVÉOLÉS (=

ALVEOLATA) ALVEOLATA)

RHIZARIA RHIZARIA Cen-

tro- heli-

da ? Actino-

phryda

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Chlorobiontes

Viridiplantae

Phytomyxea Haplo- sporidies

Streptobiontes Euglyphides

Retaria Cercobiontes

ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)

(= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Bicosoécidés Picobiliphytes ?

Katablépharides CRYPTO-

Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées

D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)

LE REGNE DES RHIZARIA : Radiolaires

Lobosa Mycétobiontes

Chytridiomycètes

Fungi

Choanoflagellés

Para- basa-

lia Retorta-

mona- dines

Euglé- noïdes Kinéto- plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa)

Chromobiontes Oobiontes

AMOEBO- BIONTES (=

AMOEBOZOA) HAPTOBIONTES

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Eugléno- biontes Archamaeba

U n ic h o n te s

Diplo-

Oxymo- nadines

Bicosoécidés

Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes

Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES

LECA

(22)

Le squelette siliceux de Coelodiceras spinosum (Phaeodaria, Radiolaires)

Plancton des eaux froides des deux hémisphères

22 200 µm

D’après Paterson et al., 2007.

Deep-Sea

Res. II, 54 :

1094-1102.

(23)

Radiolaires

Acanthofracta

(24)

Radiolaires Cyrtoidea

24 D’après Haeckel, 1904.

Kunstformen der Natur

(25)

Radiolaires Phaeodaria

(26)

Radiolaires

Unicellulaires

Squelette siliceux. Symétrie radiale, axiale ou asymétrique. Depuis 600 Ma. Se fossilisent bien

Pas de paroi cellulaire. Pseudopodes armés (axopodes) et non armés minces (filopodes)

Reproduction asexuée : division binaire. + conidies à deux undulipodiums lisses inégaux (anciens gamètes ?)

26

undulipodiums lisses inégaux (anciens gamètes ?)

Reproduction sexuée inconnue (perte secondaire ?).

Plancton marin. Prédateurs d’unicellulaires et de larves de

Métazoaires : lien trophique plancton photosynthétique unicellulaire (UPOs) méso-plancton

Rôle dans le transfert vertical de silice

(27)

1. Introduction

2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes

4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques

5. Quelques remarque nomenclaturales

6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastidia

6.2.1. Les Centrohelida

6.2.2. Les Glaucocystobiontes 6.3. Les Rhizaria

6.3.1. Les Radiolaires

6.3.2. Les Foraminifères

(28)

Embryo- phytes Charo- phycées

Chlorophycées Prasinophycées

Rhodo- biontes

Glauco- cysto- biontes

Labyrinthulobiontes Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes

STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)

ALVÉOLÉS (=

ALVÉOLÉS (=

ALVEOLATA) ALVEOLATA)

RHIZARIA RHIZARIA Cen-

tro- heli-

da ? Actino-

phryda

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Chlorobiontes

Viridiplantae

Phytomyxea Haplo- sporidies

Streptobiontes Euglyphides

Retaria Cercobiontes

ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)

(= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Bicosoécidés Picobiliphytes ?

Katablépharides CRYPTO-

Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées

D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)

LE REGNE DES RHIZARIA : Foraminifères

Lobosa Mycétobiontes

Chytridiomycètes

Fungi

Choanoflagellés

Méta- zoaires (= ani- maux)

Para- basa-

lia Retorta-

mona- dines

Euglé- noïdes Kinéto- plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Percolobiontes

Chromobiontes Oobiontes

EXCAVATES

EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBO-

BIONTES (=

AMOEBOZOA)

OPISTHO- CHONTES

HAPTOBIONTES

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Eugléno- biontes Archamaeba

U n ic h o n te s

Diplo- mona- dines

Oxymo- nadines

Bicosoécidés

Eumétazoaires Placozoaires Spongiaires Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes

Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES

LECA

(29)

Unicellulaires géants (20 µm à plusieurs centimètres de diamètre) Test perforé de trous (= caractéristique) : une à plusieurs loges Paroi : - absente (mais particules agglutinées)

- ou glycoprotéique

- ou carbonate de calcium (le plus fréquent) - ou siliceuse

Foraminifères

Cytoplasme avec cytosquelette très développé et pseudopodes fins (filopodes) très nombreux sortant par les trous du test et servant aux déplacements et à la prise de nourriture

Les gamètes possèdent deux undulipodiums et les spores 4.

Undulipodiums inégaux, lisses, avec un mastigonème terminal

(= caractéristique)

(30)

Les pseudopodes (filopodes) d'un Foraminifère

30

(31)

Pseudopodes

(filopodes)

(32)

Cycle

biologique

Gamétogène (n, uninucléé)

Gamètes mâles et femelles (n)

Zygote (2n)

Sporogène (2n,

32

Sporogène (2n, multinucléé) isomorphe ou

hétéromorphe par rapport au

gamétogène

Méiose spores (n) Conidies (n)

Cycle digénétique

haplo-diplophasique

(33)

Exclusivement marins, surtout benthiques, plus rarement planctoniques

Normalement prédateurs (Ciliés, Nématodes, larves de Crustacés, Organismes unicellulaires photosynthétiques UPOs) et/ou

détritivores (POM, DOC)

Parfois symbiotiques (endosymbiontes mutualistes) avec Parfois symbiotiques (endosymbiontes mutualistes) avec Dinobiontes, Chrysophycées, Bacillariophycées

Rôle géologique. Plus anciens fossiles : Cambrien (540 Ma) Certaines espèces kleptoplastes : récupération de

chloroplastes de diatomées (Chromobiontes, Straménopiles)

(34)

Une espèce benthique Méditerra- née

Habitats sciaphiles

1 mm

34

Miniacina

miniacea

(35)

Miniacina miniacea sur rhizome de Posidonia oceanica.

On distingue les filopodes

(36)

Corse : plages de sable rouge dû à Miniacina miniacea

36 Golfe d’Aiacciu (Ajaccio)

et Ruppione

Photo Frédéric André

(37)

1. Introduction

2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes

4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques

5. Quelques remarque nomenclaturales

6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastidia

6.2. Les Archaeplastidia

6.2.1. Les Centrohelida

6.2.2. Les Glaucocystobiontes 6.3. Les Rhizaria

6.3.1. Les Radiolaires

6.3.2. Les Foraminifères

6.3.3. Les Phytomyxea

(38)

Embryo- phytes Charo- phycées

Chlorophycées Prasinophycées

Rhodo- biontes

Glauco- cysto- biontes

Labyrinthulobiontes Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes

STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)

ALVÉOLÉS (=

ALVÉOLÉS (=

ALVEOLATA) ALVEOLATA)

RHIZARIA RHIZARIA Cen-

tro- heli-

da ? Actino-

phryda

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Chlorobiontes

Viridiplantae

Phytomyxea Haplo- sporidies

Streptobiontes Euglyphides

Retaria Cercobiontes

ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)

(= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Bicosoécidés Picobiliphytes ?

Katablépharides CRYPTO-

Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées

D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)

LE REGNE DES RHIZARIA : Phytomyxea

Lobosa Mycétobiontes

Chytridiomycètes

Fungi

Choanoflagellés

Méta- zoaires (= ani- maux)

Para- basa-

lia Retorta-

mona- dines

Euglé- noïdes Kinéto- plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Percolobiontes

Chromobiontes Oobiontes

EXCAVATES

EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBO-

BIONTES (=

AMOEBOZOA)

OPISTHO- CHONTES

HAPTOBIONTES

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Eugléno- biontes Archamaeba

U n ic h o n te s

Diplo- mona- dines

Oxymo- nadines

Bicosoécidés

Eumétazoaires Placozoaires Spongiaires Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes

Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES

LECA

(39)

Phytomyxea

Faisaient partie des ‘champignons ’ Syncytium

Deux undulipodiums lisses et inégaux Deux undulipodiums lisses et inégaux

Parasites intracellulaires d’Embryobiontes et

de diatomées (Straménopiles)

(40)

Plasmodiophora brassicae (Phytomyxea, Rhizaria)

Parasite intracellulaire du choux

Syncytiums (= plasmodes) plurinucléés

Provoque des protubérances sur les racines

Coupe de

www.dipbot.unict.it

40

  

Racines infectées

Coupe de

la racine,

montrant

des

groupes

de cellules

infectées

(41)

Gamétogène (n)

Le biocycle de Plasmodiophora

Formation de gamètes

Sporogène (2n) Méiose

Spores (n)

Gamie Zygote (2n)

Sporogène (2n)

Méiose

(42)

Phagomyxa odonthellae (Phytomyxea) parasitant la diatomée Odonthella sinensis

20 µm 42

20 µm

Détail d’un gamétocyste contenant de nombreux gamètes

D’après Schnepf et al., 2000.

Helgol. Mar. Res., 54 : 237-242.

(43)

1. Introduction

2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes

4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques

5. Quelques remarque nomenclaturales

6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastidia

6.2. Les Archaeplastidia 6.3. Les Rhizaria

6.4. Les Cryptophytes

(44)

Embryo- phytes Charo- phycées

Chlorophycées Prasinophycées

Rhodo- biontes

Glauco- cysto- biontes

Labyrinthulobiontes Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes

STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)

ALVÉOLÉS (=

ALVÉOLÉS (=

ALVEOLATA) ALVEOLATA)

RHIZARIA RHIZARIA Cen-

tro- heli-

da ? Actino-

phryda

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Chlorobiontes

Viridiplantae

Phytomyxea Haplo- sporidies

Streptobiontes Euglyphides

Retaria Cercobiontes

ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)

(= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Bicosoécidés Picobiliphytes ?

Katablépharides CRYPTO-

Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées

D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)

LES CRYPTOPHYTES

Lobosa Mycétobiontes

Chytridiomycètes

Fungi

Choanoflagellés

Méta- zoaires (= ani- maux)

Para- basa-

lia Retorta-

mona- dines

Euglé- noïdes Kinéto- plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Percolobiontes

Chromobiontes Oobiontes

EXCAVATES

EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBO-

BIONTES (=

AMOEBOZOA)

OPISTHO- CHONTES

HAPTOBIONTES

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Eugléno- biontes Archamaeba

U n ic h o n te s

Diplo- mona- dines

Oxymo- nadines

Bicosoécidés

Eumétazoaires Placozoaires Spongiaires Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes

Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES

LECA

(45)

Egalement nommés Cryptophytes, Cryptophycées, Cryptomonadines

Organismes unicellulaires, la plupart photosynthétiques

La position dans l'arbre du vivant reste incertaine : relations avec les Haptobiontes ? Les Straménopiles ?

Le chloroplaste provient d'une endosymbiose secondaire avec un Rhodobionte

Dans le chloroplaste, les thylakoïdes sont groupés par deux (lamelles) (= caractéristique)

Présence de phycobilines dans le lumen du thylakoïde (et non dans des Présence de phycobilines dans le lumen du thylakoïde (et non dans des phycobilisomes) (= caractéristique)

Rhizostyle dans le prolongement d’un cinétosome (= caractéristique) Présence d’un deuxième noyau (nucléomorphe), reste de

l’endosymbiose secondaire (= caractéristique)

Equipements pour la prédation (vestibule, éjectisomes) et corps

(46)

Plasma- lemme Noyau

ADN eucaryotique

Plaque du péri- plaste

Nucléomorphe avec ADN eucaryotique

Complexe nucléo- plastidial (CNP) Ribosome 80 S

périplastidial

Mitochondrie à crêtes en pile d’assiettes Chloroplaste

ADN procaryotique Ribosome 70 S

Thylakoïdes en lamelles de 2.

Chlorophylles a et c phycobilines dans le lumen

Stigma

Vacuole pulsatile

Undulipodium avec mastigonè-

Cinétosomes

D’après Boudoures- que, 2011

plaste

Corps de Maupas Ribosome 80 S

cytoplasmique Cyto-

plasme

Polysaccharide

périplastidial : rhodamylon Ecaille Ejecti-

some (tricho- cyste)

avec mastigonè- mes dipartites sur

2 rangées

Undulipodium avec mastigo- nèmes dipartites sur 1 rangée Centrosome

Rhizostyle Vestibule (sorte

de cytostome)

(47)

Les deux undulipodiums de Cryptomonas ovata

Deux rangées de mastigonèmes sur l’un des undulipodiums, une seule sur l’autre (= caractéristique)

D’après Hibberd et al., 1971.

Br. phycol. J., 6 (1) : 61-72.

(48)

Les Cryptobiontes sont des organismes aquatiques (milieu marin, eaux douces et eau intersticielle des sols

La plupart des

espèces sont auto- trophes ou mixotro- phes

Quelques espèces sont des parasites intestinaux de

Métazoaires (perte

48

Métazoaires (perte secondaire de la photosynthèse) Quelques espèces sont des endosym- biontes de Dino- biontes

Chilomonas

paramecium. Les

undulipodiums sont

présents mais non

visibles

(49)

1. Introduction

2. Unicellulaire vs pluricellulaire 3. L’arbre des Eucaryotes

4. Eucaryotes photosynthétiques vs non photosynthétiques

5. Quelques remarque nomenclaturales

6. Les principaux taxons d’Eucaryotes unicellulaires 6.1. L’appareil cinétique et les mitochondries 6.2. Les Archaeplastidia

6.2. Les Archaeplastidia

6.2.1. Les Centrohelida

6.2.2. Les Glaucocystobiontes 6.3. Les Rhizaria

6.4. Les Cryptobiontes

6.5. Les Haptobiontes

(50)

Embryo- phytes Charo- phycées

Chlorophycées Prasinophycées

Rhodo- biontes

Glauco- cysto- biontes

Labyrinthulobiontes Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio- laires Forami- nifères Chlorarach- niobiontes

STRAMÉNOPILES (= HÉTÉROCHONTES)

ALVÉOLÉS (=

ALVÉOLÉS (=

ALVEOLATA) ALVEOLATA)

RHIZARIA RHIZARIA Cen-

tro- heli-

da ? Actino-

phryda

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Chlorobiontes

Viridiplantae

Phytomyxea Haplo- sporidies

Streptobiontes Euglyphides

Retaria Cercobiontes

ARCHAEPLASTIDA ARCHAEPLASTIDA (= PLANTAE)

(= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Bicosoécidés Picobiliphytes ?

Katablépharides CRYPTO-

Trentepolio- phycées Ulvophycées Zygnémato- phycées

D'après Baldauf (2003, 2008), Boudouresque et al. (2006) et Boudouresque (2011)

Le règne des Haptobiontes

Lobosa Mycétobiontes

Chytridiomycètes

Fungi

Choanoflagellés

Méta- zoaires (= ani- maux)

Para- basa-

lia Retorta-

mona- dines

Euglé- noïdes Kinéto- plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa) Percolobiontes

Chromobiontes Oobiontes

EXCAVATES

EXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES AMOEBO-

BIONTES (=

AMOEBOZOA)

OPISTHO- CHONTES

HAPTOBIONTES

C h ro m a lv é o s C h ro m a lv é o s

Eugléno- biontes Archamaeba

U n ic h o n te s

Diplo- mona- dines

Oxymo- nadines

Bicosoécidés

Eumétazoaires Placozoaires Spongiaires Microsporidies Basidiomycètes Ascomycètes

Mésomycétozoaires Katablépharides Cryptophytes BIONTES

LECA

(51)

Egalement nommées Haptophycées, Haptophytes, Prymnésiophycées, Prymnésiophytes, Coccolithophoridés

La position dans l'arbre du vivant reste incertaine.

Proches des Straménopiles ?

Sous le plasmalemme, une enveloppe de réticulum endoplasmique (caractéristique des Haptobiontes)

Toujours unicellulaires

Haptonème

Pas de paroi cellulaire des Haptobiontes)

Unduli- podium

Ecailles souvent énormes (cocolithes) (caractéristique)

Appareil cinétique : deux undulipodiums (structure 9 + 2) + un

haptonème (5-7 microfibrilles) (caractéristique). Rôle de l’haptonème :

détection obstacles, fixation, capture des proies, transfert des proies

(52)

Noyau ADN

eucaryotique

Cyto- plasme

Chloroplaste Complexe nucléo-

plastidial (CNP)

Thylakoïdes en lamelles de 3. Chlorophylles a et c

ADN procaryotique Ribosome 70 S Undulipodium avec

mastigonème non tubulaires Ecaille

(coccolithe)

Cellule de Haptobionte

D’après Boudoures-

que, 2011

Plasma- lemme Mitochon- drie à crêtes tubulaires Ribosome 80 S

Stigma

Centrosome Cinétosomes

Undulipodium lisse

Polysaccharide extraplastidial : laminarine Réticulum endo-

plasmique péri- phérique (REP)

Hapto-

nème

(53)

Ecailles calcaires (les coccolithes)

L'Haptobionte tropical

Scyphospahaera apsteeinii, 10 µm

10 µm

(54)

Crystallolithus

rigidus

Gliscolithus amitakarenae

Les Haptobiontes vivent dans le plancton marin. A leur mort, les écail-

54 Calyptrolithina gaarderae

D'après Norris (1985)

Syracolithus quadriperfo- ratus (de face et de profil)

leur mort, les écail- les (coccolithes) sédimentent et peu- vent donner nais- sance à des roches calcaires (temps géologiques). Les craies du Crétacé en

sont formées. puits de

carbone dans l'océan

(55)

Chrysoculter rhomboideus Unduli-

podium : structure 9 + 2

Haptonème : 5 microfibril- les (chez cette espèce) +

0.2 µm

les (chez cette espèce) + réticulum endoplasmique

Ecailles (non calci- fiées chez cette espèce

D'après

(56)

Prymnesium parvum

Plancton marin de nombreuses régions du monde

Produit des toxines (effet hémolytique, ichtyotoxique, cytotoxique) allélopathie

Inhibition Cyanobactéries et Dinobiontes

Élimination diatomées (compétiteurs) et Ciliés (prédateurs)

Contrôle de la communauté planctonique

Fistarol et al. (2003)

56

Les Haptobiontes (e.g. Emiliania huxleyi, Phaeocystis antarctica)

DMSP (diméthyl-sulfonio-propionate) DMS (diméthyl-sulphide)

20% (15-30 Tg/a) des composés soufrés émis dans l'atmosphère (naturels ou Homme, océans et continents)

Nucléus pour la condensation des nuages)

Treguer (2002)

Contrôle de la communauté planctonique

Fistarol et al. (2003)

(57)

Haptobionts, Dinobionts (and some Chromobionts) have a key role in DMSP (dimethyl-sulfonio-propionate) production, thereby helping to regulate the Earth’s climate

(Cloud formation)

From

Merzouk et al., 2008.

Mar. Ecol.

Progr. Ser., 269 : 1-11 (modified)

Haptobionts and

Dinobionts

(58)

Blooms planctoniques

Emiliania huxleyi. 12 Juin 2003. Photo du satellite Seawifs 58

(59)

Les falaises d’Etretat

La craie du tableau noir

Des Haptobiontes

(Coccolithopho-

ridés)

Références

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