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Submitted on 8 Feb 2018
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Conception et exploitation d’un dispositif expérimental instrumenté pour la prévision de la dégradation de la
qualité nutritionnelle et de l’inactivation
microorganismes dans les fruits et légumes transformés
Nizar Al Fata
To cite this version:
Nizar Al Fata. Conception et exploitation d’un dispositif expérimental instrumenté pour la prévision
de la dégradation de la qualité nutritionnelle et de l’inactivation microorganismes dans les fruits
et légumes transformés. Alimentation et Nutrition. Université d’Avignon, 2017. Français. �NNT :
2017AVIG0265�. �tel-01704619�
ACADEMIE D’AIX-MARSEILLES
UNIVERSITE D’AVIGNON ET DES PAYS DE VAUCLUSE
THESE
Préparée pour obtenir le grade de Docteur en Sciences de l’Université d’Avignon et des Pays de Vaucluse
Conception et exploitation d’un dispositif expérimental instrumenté pour la prévision de la dégradation de la qualité nutritionnelle et de l’inactivation microorganismes dans les fruits et légumes
transformés
par Nizar AL FATA
soutenue le 2017 devant un jury composé de
M. Martinus VAN BOEKEL Professeur, Wageningen (Pays-Bas) Rapporteur M. Manuel DORNIER Professeur, Montpellier Rapporteur Mme Stéphanie ROUX Docteur, Massy Examinateur
M. Olivier DANGLES Professeur, Avignon Examinateur
Mme Catherine RENARD Directeur de recherche, Avignon Directeur de thèse
M. Stéphane GEORGE Chef de projet Encadrant industriel
Ecole doctorale 536 : Sciences et Agrosciences
Industriel : Centre Technique de la Conservation des Produits Agricoles
Laboratoire INRA : Sécurité et Qualité des Produits d’Origine Végétale
Remerciements
Ce travail de recherche doctorale s’est déroulé dans le cadre d’une convention CIFRE entre le CTCPA
et le laboratoire SQPOV de l’INRA d’Avignon.
Mes premiers remerciements sont évidemment adressés au Docteur Catherine Renard, ma directrice de thèse, et à Monsieur Stéphane Georgé, mon encadrant au CTCPA. Je vous remercie de m’avoir accueilli au sein du CTCPA et de l’INRA pour mener à bien ce projet. Un grand merci à vous pour tout ce que vous avez fait pour moi, tant sur le plan professionnel que personnel.
Madame Renard, vous êtes une personne formidable, avec qui j’ai énormément appris. Votre encadrement exemplaire, vos compétences, votre disponibilité et vos qualités humaines incomparables ont fortement contribué à la réussite de ce projet. Je ne peux que vous remercier et vous souhaiter bonne continuation pour la suite.
Stéphane (mon bonheur) ! Il est vrai que je l'ai souvent cherché ce bonheur...! Un grand merci ! Dès le départ le courant est bien passé entre vous et moi, et nous nous sommes tout de suite entendus. Merci d’avoir été disponible dans les moments difficiles et d’avoir fait preuve d’un encadrement exemplaire. Vous êtes une personne avec un grand cœur et vous allez me manquer. Je vous souhaite une bonne continuation, et une multitude de projets !
Je remercie tous les membres du jury, le Professeur Martinus Von Boekel de l’Université de Wageningen, le Professeur Manuel Dornier de SupAgro Montpellier, le Docteur Stéphanie Roux d’AgroParisTech Massy, et le Professeur Olivier Dangles de l’Université d’Avignon, responsable de l’Ecole Doctorale 536, d’avoir accepté de juger ce travail.
Je remercie tous les membres de mon comité de thèse, le Professeur Catherine Bonazzi d’AgroParisTech de Massy, le Docteur Frédéric Carlin de l’INRA d’Avignon, le Docteur Raphaël Plasson de l’Université d’Avignon, le Docteur Stéphane André du CTCPA, d’avoir suivi ce projet et apporté des visions et des approches différentes pour le mener à bien.
Un grand merci au Professeur Catherine Bonazzi, au Docteur Stéphanie Roux, au Professeur Francis Courtois d’AgroParisTech de Massy et au Docteur Raphaël Plasson pour leur aide précieuse en matière d’approche et de modélisation des données.
Je tiens à remercier Madame Sarah Gervais et le Docteur Stella Planchon du CTCPA, deux femmes extraordinaires, toujours à l’écoute, à qui il fait bon parler et se confier dans les moments difficiles. Bonne continuation à vous deux !
Un énorme merci à Madame Naïma Dlalah du CTCPA. Que dire de Naïma... Elle est sans doute une
des personnes les plus compétentes et rigoureuses que j’ai pu voir dans un laboratoire. Merci à toi pour tout
ce que tu m’as appris au niveau analytique et HPLC. Tu as été d’une grande aide. Je te souhaite le meilleur
pour la suite.
Merci aussi au Docteur François Zuber du CTCPA, pour ses conseils avisés tout au long de ces 3 ans, et son aide précieuse en cette fin de thèse. François, tu as le droit à un bisou du maronite !
Je remercie le Docteur Stella Planchon et le Docteur Stéphane André pour m’avoir permis de découvrir la microbiologie et pour leurs conseils avertis dans ce domaine.
Merci également à l’ensemble des techniciens du laboratoire de microbiologie du CTCPA qui m’ont également appris énormément dans ce domaine. Je remercie en particulier Benoît Budzeszewski et Eddy Montagné pour m’avoir initié aux techniques de la microbiologie.
J’ai eu la chance d’aller faire quelques tours dans la halle technologique du CTCPA, et j’y ai passé d’excellents moments. Merci à Eric Nibouche, Willy Dussouchaut, Jean-Marc Malinge et Thibaut Manin pour ces délires inoubliables, et surtout pour ces tonnes de purées OPTIFEL qu’on a élaboré. Quand j’y pense, on était vraiment épais ! Bonne continuation à vous.
Je remercie Madame Bénédicte Larinier pour l’aide qu’elle a pu m’apporter dans la commande d’articles ou de livres, et également pour le temps qu’elle a passé à relire ce manuscrit.
D'une façon générale, je remercie l’ensemble du personnel du CTCPA : j’ai, d’une manière ou d’une autre, appris de chacun d’entre vous. Je vous souhaite à toutes et tous le meilleur pour la suite.
Je remercie Madame Line Touloumet et le Docteur Jean-François Maingonnat de l’INRA d’Avignon pour leur aide dans la réalisation des expériences de granulométrie et de rhéométrie.
Du fond du cœur, je veux adresser un énorme remerciement à Tiffany Malleck, doctorante en microbiologie au CTCPA, ma consœur de bureau mais surtout, mon amie. Tiffany, merci mille fois d’avoir été présente à mes côtés dans les moments les plus difficiles. Cela m’a fait le plus grand bien. Ton grand cœur et ta générosité sont sans limites ; tu as été d’un grand soutien, et je ne saurais exprimer à quel point tu vas me manquer. Je te souhaite de réussir ta thèse avec succès, ce dont je ne doute absolument pas. Sache que je ne t’oublierai jamais Tiffany, tu seras toujours ma marmotte !
Je remercie également l’ensemble des doctorants (pour certains maintenant docteurs) que j’ai rencontré durant ces 3 ans. Je ne peux citer tout le monde tellement vous êtes nombreux. Je vous souhaite à toutes et tous une belle réussite dans vos projets.
Merci au Docteur Loïc Durand, mon Lose, pour ces bons moments passés au CTCPA et pour m’avoir épaulé dans les moments difficiles. Je t’aime mon chameau !
J’ai eu la chance d’encadrer deux stagiaires, Anne-Sophie Pallaruelo et Coralie Adaoust. Ce fut un immense plaisir de travailler avec vous et je vous remercie pour la contribution que vous avez apportée à ce travail.
Merci à Adeline Catillon pour le dessin de Bob l’éponge et Coralie Adaoust pour le dessin de la fusée.
Je vais vraiment les mettre dans ma thèse ! Vous êtes adorables.
Un grand merci à mon frère Steven. Il a été d’une grande aide financière et psychologique durant ces 3
ans. Je t’aime mon frère.
Je ne peux oublier également mon oncle Antoine Azar et mon ami Arnaud Parthiot pour m’avoir aidé financièrement au moment de m’installer en Avignon. Je vous en remercie !
Enfin, je veux remercier la meilleure, ma maman Linda, une femme débordante de générosité, avec un cœur énorme. Je veux lui dire à quel point je lui suis reconnaissant de s'être sacrifiée pour prendre soin de mes enfants et de moi-même ces deux dernières années. Elle a été essentielle à la réussite de ce travail et à ce que je suis aujourd'hui. Maman, je ne te le dis jamais, mais sache que je t’aime et que je n’oublierai jamais ce que tu as fait pour nous.
Je remercie aussi mon papa Samir de l'aide qu’il m’a également apportée pour mes enfants.
Pour finir, sachez que grâce à vous tous, cette expérience humaine a été formidable. J’ai été ravi
de rencontrer chacun d’entre vous. D’une certaine manière, je sors de ces 3 ans d’expériences encore
plus fort, plus mûr, plus grand…
« Si les découvertes scientifiques ont à la fois donné à l’humanité le pouvoir de créer et le pouvoir de détruire, alors elles sont en même temps un énorme défi et une grande épreuve. »
John Fitzgerald Kennedy (1917-1963)
A mes enfants,
A mes parents,
A mes frères.
Table des matières
Table des matières………1
Liste des figures………5
Liste des tableaux………...……17
Liste des abréviations………19
Liste des sigles………20
Chapitre I : Introduction générale………...23
1 Contexte industriel et enjeux du projet PREDINUT ... 23
2 Objectifs ... 23
3 Programme de recherche ... 24
4 Le CTCPA ... 25
4.1 Présentation générale ... 25
4.2 Missions du CTCPA ... 26
4.3 Le CTCPA d’Avignon ... 26
5 L’UMR SQPOV ... 27
6 L’Unité Mixte Technologique « Qualiveg » ... 28
Chapitre II : Etat de l'art………...…...33
1 La boîte de conserve, ou l’art de conserver les aliments ... 33
1.1 Historique ... 33
1.2 Production des conserves alimentaires en France ... 34
1.3 Procédé de fabrication : de l’aliment frais à la boîte de conserve ... 36
1.4 Principe du traitement thermique discontinu en autoclave ... 39
1.5 Prise en compte de la contamination initiale pour le choix de la valeur stérilisatrice ou pasteurisatrice... 41
1.6 Caractéristiques du produit influençant le choix du traitement thermique ... 42
2 Les approches de modélisation en thermobactériologie et cinétique chimique ... 44
2.1 Réactions d’ordres classiques ... 44
2.2 Loi d’Arrhenius ... 47
2.3 Modèle d’Eyring : théorie du complexe activé ... 48
2.4 Notion de thermobactériologie... 49
2.5 Modèle de Bigelow (log-linéaire) ... 52
2.6 Modèle de Weibull ... 52
2.7 Modèle de Mafart et Leguérinel prenant en compte la température et le pH ... 53
3 La vitamine C ... 54
3.1 Généralités ... 54
3.2 Sources alimentaires de vitamine C ... 55
3.3 Structure de la vitamine C ... 56
3.4 Propriétés physico-chimiques ... 57
3.5 Biosynthèse de la vitamine C ... 59
3.6 Synthèse chimique de l’acide ascorbique ... 62
3.7 Dégradation de la vitamine C ... 64
3.8 Cinétique de dégradation de la vitamine C ... 87
3.9 Impact des traitements à températures supérieures à 100 °C sur la vitamine C ... 95
3.10 Impact des autres procédés industriels sur la rétention de la vitamine C ... 97
3.11 Conclusion ... 106
4 Les bactéries d’altération ... 107
4.1 Bacillus coagulans ... 107
4.2 Geobacillus stearothermophilus ... 113
4.3 Moorella thermoacetica/thermoautotrophica ... 118
4.4 Conclusions ... 120
Chapitre III : Démarche d'étude………...123
1 Hypothèses ... 123
2 Dispositif expérimental ... 123
3 Démarche expérimentale ... 124
3.1 En solution modèle... 125
3.2 En matrice alimentaire ... 125
3.3 Méthodes d’interprétation et approches ... 126
Chapitre IV : Matériels et Méthodes………...129
1 Matériels ... 129
1.1 Thermorésistomètre Mastia
®... 129
1.2 Consistomètre de Bostwick ... 132
1.3 Sonde à oxygène PreSens ... 132
1.4 Produits chimiques ... 132
1.5 Solution modèle ... 132
1.6 Matrices alimentaires ... 133
2 Méthodes ... 134
2.1 Solution d’acide ascorbique ... 134
2.2 Gamme étalon d’acide ascorbique ... 134
2.3 Gamme étalon des produits de dégradation ... 135
2.4 Conditions d’exploitation du thermorésistomètre ... 136
2.5 Dégradation de l’acide ascorbique en solution modèle ... 138
2.6 Dégradation de l’acide ascorbique en matrice alimentaire ... 139
2.7 Analyses HPLC ... 140
2.8 Granulométrie ... 141
2.9 Rhéologie ... 141
2.10 Protocole de dosage des polyphénols totaux... 142
3 Modélisation des données ... 143
3.1 Réaction d’ordre général n ... 143
3.2 Incertitudes et statistiques ... 144
Chapitre V : Etude de la dégradation de l'acide ascorbique en solution synthétique………...149
1 En conditions anaérobies ... 149
1.1 Influence de la température ... 149
1.2 Influence du pH ... 159
1.3 Etude du furfural ... 166
2 En conditions aérobies ... 168
2.1 Pression partielle d’oxygène à 30 kPa ... 168
2.2 Pression partielle d’oxygène à 63 kPa ... 171
2.3 Pression partielle d’oxygène à 100 kPa ... 173
2.4 Dégradation de l’acide ascorbique en conditions aérobies ... 175
2.5 Implication de l’oxygène ... 178
2.6 Etude des composés de dégradation ... 185
3 Comparaison des résultats avec ceux du projet OPTIFEL ... 191
4 Conclusions ... 192
Chapitre VI : Etude de la dégradation de l'acide ascorbique en matrice alimentaire………...197
1 Caractérisation rhéologique et granulométrique des matrices ... 197
2 Etablissement du protocole pour l’étude de la dégradation de l’acide ascorbique en matrice alimentaire ... 198
3 Dégradation de l’acide ascorbique dans la purée de pomme ... 199
4 Dégradation de l’acide ascorbique dans la purée de carotte ... 204
5 Dégradation de l’acide ascorbique dans le jus de carotte ... 207
6 Devenir de l’oxygène au cours des cinétiques ... 209
7 Conclusions ... 212
Chapitre VI : Approche couplée bénéfice/risque………...217
1 Modèle choisi ... 217
2 Choix des entités ... 217
3 Paramètres du modèle et approximations ... 217
4 Interface du modèle de prédiction ... 219
Conclusions et perspectives ……….………...223
Références bibliographiques………...……….………...229
Sites internet consultés ……….………...240
Valorisations et transferts ………...….………...242
Articles scientifiques……….………...247
Annexes ……….………...293
Annexe 1 : Chromatogrammes de l’acide ascorbique, du 3-hydroxy-2-pyrone, de l’acide furoïque et du furfural, ainsi que leurs temps de rétention……….293
Annexe 2 : Données expérimentales de la préparation des gammes étalons des produits de dégradation...295
Annexe 3 : Rhéogrammes des différentes matrices alimentaires étudiées ………..………....296
Annexe 4 : Poster présenté au 2
ndEuro-Mediterranean Symposium on Fruit and Vegetable Processing....297
Annexe 5 : Poster présenté au 18
thIUFoST World Congress of Food Science and Technology …………298
Annexe 6 : Article inclus dans les Proceedings du 29
thEFFoST International Conference ………299
Liste des figures
Chapitre I : Introduction générale
Figure I – 1 : Répartition des centres du CTCPA à l’échelle nationale………...26 Chapitre II : Etat de l’art
Figure II - 1 : Timbre-poste à l’effigie de Nicolas Appert imprimé en 1955 (www.philateliefrancaise.fr)...33 Figure II - 2 : Photographie des premières boîtes de conserve inventées en 1810 (boîte à trou à gauche et boîte à bouchon à droite) (http://www.azaquar.com)...34 Figure II - 3 : Diagramme de production d’une boîte de conserve de légumes (source : GBPH Fruits et légumes en conserves appertisées - CTCPA – 2015)...37 Figure II - 4 : Evolution des températures et de la Valeur Stérilisatrice durant un cycle d’appertisation en autoclave………..39 Figure II - 5 : Variation de la concentration du réactif A en fonction du temps pour une cinétique d’ordre 0. ……….45 Figure II - 6 : Variation de la concentration du réactif A en fonction du temps pour une cinétique d’ordre 1 sous forme (A) exponentielle et (B) linéaire……….46 Figure II - 7 : Variation de la concentration du réactif A en fonction du temps pour une cinétique d’ordre 2 sous forme (A) classique et (B) linéaire………47 Figure II - 8 : Graph d’Arrhenius représentant la variation de ln(k) en fonction de 1/T……….48 Figure II - 9 : Variation de l’énergie potentielle d’un système au cours du trajet réactionnel………48 Figure II - 10 : Cinétique d’ordre 1 de destruction thermique des microorganismes à température constante………..50 Figure II - 11 : Effet de la température sur la vitesse de destruction thermique……….51 Figure II - 12 : Schéma réactionnel de la synthèse de la 4-hydroxyproline, (http://biochimej.univ- angers.fr/Page2/COURS/7RelStructFonction/2Biochimie/2ModifPOSTtraduc/9Hydroxylation/1Hydroxyl ation.htm) ………54 Figure II - 13 : Structures chimiques des différents stéréoisomères de l’acide ascorbique, avec en (a) l’acide
L