Etude de l'activité des antibiotiques sur propionibacterium acnes impliqué dans les infections neuro-méningées

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Etude de l’activité des antibiotiques sur

propionibacterium acnes impliqué dans les infections

neuro-méningées

Sébastien Fougnot

To cite this version:

Sébastien Fougnot. Etude de l’activité des antibiotiques sur propionibacterium acnes impliqué dans les infections neuro-méningées. Sciences du Vivant [q-bio]. 2003. �hal-01732804�

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UNIVERSITE HENRI POINCARE,NANCY1 FACULTEDEMEDECINE DENANCY

2003 N" )

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MEMOIRE

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-DU DIPLOME D'ETUDES SPECIALISEES DE

BIOLOGIE MEDICALE

Présenté et soutenupubliquemen t le Vendredi 17 Octobre 2003

par SébastienFOUGNOT né le02 AoOt 1975à Laxou

ETUDE DE L'ACTIVITE DES ANTIBIOTIQUES

SUR

PROPIONIBACTERIUM ACNES

IMPLIQUE

DANS LES INFECTIONS NEURO-MENINGEES

Conformémentauxdispositionsdu décret n" 90-810du 10septembre 1990, ce

mémoire tient lieu de

THESE

POUR LE DIPLOME D

'ETAT

DE

DOCTEUR EN MEDECINE

Président:

Juges :

M.A.LOZNIEWSKI, Professeur

Mme

J

.

SCHWARTZBROD,Professeur M.Ch.RABAUD,Professeur

Mme F.MORY, Maitre de Conférences

UNIVERSITE HENRIPOINCARE,NANCY1 2003

MEMOIRE

DU DIPLOME D'ETUDES SPEC

IALISEES

DE

BIOLOGIE MEDICALE

Présenté et soutenu publiquement le Vendredi 17 Octobre2003

par Sébastien FOUGNOT néle02 Août 1975à Laxou

ETUDE DE L'ACTIV

ITE

DES ANTIBIOTIQUES

SUR PROPIONIBACTERIUM ACNES IMPLIQUE

DANS LES INFECTIONS NE

URO-MENINGEES

Confonnémentauxdispositionsdu décret n" 90-810du 10 septembre 1990, ce

mém oiretient lieu de

THESE

POUR LE DIPLOME

D'ETAT DE

DOCTEUR EN

MEDECINE

Présid en t :

Juges :

M.A.LOZNIEWSKI,Professeur

Mme

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.

SCHWA RTZBROD, Professeur

M. Ch.RABAUD,Professeur

Mme F.MORY,Maîtrede Conférences

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NANCY

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FACULTÉ DE MÉ

DECINE

DE NANCY

Président det'Unlversnê: Professeur Claude BURLET Doyen dela Facultéde Médeci ne:Professeur Patrick NETTER

Vice-nO)'CIIdela FacultédeMéd ecine: Professeu rlIenr y COUIl ANE

Assesseurs du l"Cycle :

du2t"'"Cycl e:

du3~"'"Cycle: dela Vic Pncuhnirc :

MmeleDocteurChantal KOIILER

I\Irle Professeu r Jean-PIer r e llRONOW ICKI

Mrle Professeur HervéVESI' IGNANI

MrleProfesseurBrunoLElŒUP

DOYENSHONOR AIIm S

ProfesseurAdrienDUPREZ- Professeur Jean-Bern ardDUREUX

ProfesseurGeorgesGRIGNON- ProfesseurJacques ROLAND

!'ROFESSEURS IIONOIlA IIŒS

Louis l'IERQ UIN - EtienneLEG AIT- JeanLQCHA RD- RenéIJERDEUVAL- GabrielFAIVRE- Jean-Marie FOUGUET

GuyRAU BER- Paul SADOU L- RaoulSENA ULT- Marcel RIBON

JacquesLACOSTE - JeanBEUREY - JeanSOMMELET- PierreHARlEMA NN- EmiledeLAVERGNE AugustaTREiJEUX- MichelMA NCIAUX- Paul GUILLEMIN- PierrePAYSANT

Jean-ClaudeBURDIN- Claude CHARDOT- Jean-BernardDUREUX- Jean DUIIEIL LE- Jean-PierreGRILUAT

PierreLA MY- Jeaa-MarieCIL CENKIlANTZ- Simone GlLG ENK RANTZ Pierre ALEXA ~[l!Œ- R,:,tw.:~!FR!SCH- ~'!~':!~e! P!ERSON- JacquesROBERT

GérardDEBRY- GeorgesGRIGNON - NerreTRJP0N- Mit:h~!wAYOFF- FrançoisCHERR IER- Oliéro GUERCI

Gilbert PERCEBOIS- ClaudePERRIN- JeanPREVOT - JeanFLOQU ET

AlainGAUCIIER - MichelLA XENAIRE- MichelBO ULANG E- MichelDUC- ClaudeHURIET- Pierre LA ND ES Alain LA RCA N - GérardVAILLANT- DanielANTHOINE- PierreGAUCHER- René-JeanROYER

Hubert UFFII OLTZ- JacquesLECLER E- FrancineNABET- JacquesBORRELLY

MichelRENARD- Jean-PierreDESCIIAMPS- PierreNABET- Marie-ClaireLAXENAIR E- AdrienDUPREZ- PaulVERT

Philippe CANTON- ilenri HEPNER- Bernard LEGRAS- PierreMATH IEU- Jean-MariePOLU

Antoine RASPILLER- GilbertTI IIBAUT- MichelWEB ER

PROFESSE URSilES UNIVERSITÉS. PRATICIENS HOSPITALIERS (DisciplinesduConseilNationaldesUniversités)

-12' -Section:1\I0RI' II0LOG IE ETMOnPHOGENÈSE

Iêresous-section:(A"atomi~)

ProfesseurJacquesROLAND - ProfesseurGillesGROSD IDIER

Professeur PierreLASCOMBES- ProfesseurMarcBRA UN

2' "Nsous-section:(CytologitttIlisi% git)

Professeur BernardFOUGUET

J- snus-sectlnn:(AI/atomit ttcytologitpa(/lOlogiquts)

44n..Section :BIOCHI M IE,BIOLOGIECEL L ULA IR EET MOLÉ CULAIRE, PHYSIOLOGIE ET NUTRITION JI.. sous-sectlcnt(Biochimie elbiologiemoléculaire}

ProfesseurJean-Pierre NICOLAS

ProfesseurJean-LouisGU~ANT- ProfesseurJean-LucOLIVIER 2- sous-section :(PI/ysiologie)

ProfesseurJean-PierreCRANCE- ProfesseurJean-PierreMALLJE

Professeur Fran~isMARCHAL - ProfesseurPhilippeHAOUZI ) sous-s ection:(Biologie etlluloire)

Profe sseurClaudeDURLET 41-sous-section :(Nutritiol/) ProfesseurOlivierZIEGLER

45·~"Section:1\lICnOBIOLOGIE,MALAIHESTnANSMISS IllLES ETHYG IÈ NE 1"· sous-sec tion :ill octérioiogie- virologie,'hygièllehospita lière)

Professeur Alain LE FAOU - Professeur Alain LOZNIEWSKI

2- sous-sect ion:(ParasitorogietllnJ'eologie) Professeur Bernard FO RllER

)- sous-sectlonr(Mo/adies illfectiellstS;maladiestropicales) ProfesseurThierryMAy - Professeur Christian RABAU D

46' - Sect ion:SANTÉPUBLIQ UE, ENV IRONN EMENT ETSOCIÉTÉ 1'"sous -secrionr(Épidtlllio logit,ieol/omit delasaillitl prb 'el/tio,,) Professeur Philippe HARleMAN N- ProfesseurSerge BRIANÇON

Professeur FrancisGUILLEMI N - Professeur DenisZMIROU 2·...sous-s ection :(Médecine et santé 011tra vail}

ProfesseurGuyPETlET- Professeur Christo phePA RIS

).- sc us-secttc n:(MMe cilleUgale et droit delasailli) ProfesseurHen ry CO UDA NE

4- snus-se ctin n:(fliostatütiqlles,ill/ormaliqllelIIidicoleetlt'd",ologi~sdt commnuicatian] ProfesseurFrançois KOHLER- ProfesseurÉlianeALBUISSON

47- Sccrlc n:CANC(mO LOG IE,GI~NI~TIQ UE,II Él\IATOLOGm,IMMUNOLOGIE 1'" sous-section :(lUlllatologi~;/rmlS/IISÎolI)

ProfesseurChristianJANOT- ProfesseurThomaslECOMPTE- ProfesseurPierr eBO RDI G ONI

ProfesseurPierreLEDERLI N- ProfesseurJean-FrançoisSTO LTZ 2·...sous-section:(Col/eir ologie;/"O(/iothirapic)

Pro fesseurFrançoisGUILLEMIN- ProfesseurThierry CONROY ProfesseurPierreBEY- Professeu rDidierPEIFFERT

) - snus-sectien :(/II/11/flllologit)

ProfesseurGilbertFA URE - ProfesseurMarie-Christ ine BENE 4- sous-secuo »:(Géllttique)

ProfesseurPhilippeJONVEA UX- ProfesseurBrunoLEliEUP

48'- Section :ANESTHÉSIO LOG IE,RÉA NIM ATIO N,M(m ECI NE n'URGENC E,

l'HARMACOLOGI EETTII É RAI'EUT IQUE

I~'sous-section:(Allesthésiologie el réal/imorioll cllirurgicalt )

ProfesseurClaudeMEI5TELMAN- ProfesseurDanLONGROIS - Professeur HervéllOUAZIZ ProfesseurPaul-M ichelMERTES

2- sous-section:(Ri al/imotio ll lllidi€ale)

ProfesseurHenriLA t-.I BERT - Professeur AlainGERARD ProfesseurPierre-Edouard BOLLAE RT- ProfesseurBrunoL~VY J'-snus-secuun :(Fhonnac otogie/ol/damel/(o/t ;pharmacologie clinique)

ProfesseurPatrick NErrER- ProfesseurPierre GILLET 4;- sous-section:(Thérapeutique)

49--Section:rATIlOLOGIE NERVE US E ET MUSCULA IRE, I·ATH OLOGIEMENTA LE, IlANDICAI) elRÉÉDUCATIO N

r-

sous-scellon :(Nel/r% gie)

ProfesseurGérardBARROCHE- ProfesseurHervéVESPIGNAN I ProfesseurXavier DUCROC Q

2- sous-sectionr(Neuroclliru rgie)

Professeu rJean-ClaudeMARCHAL- ProfesseurJea nAUQUE ProfesseurThieny CIVIT

)- sous-secticnr(Psycilia(rled'adu/tes)

ProfesseurJean -PierreKAH N 4- sous-section :(Pidops)'c1liatrie)

Pro fesseur ColetteVIDAIU IET- ProfesseurDanielSIDERTIN-DLANC 5;- sous-sectlun t(MMeCÎl/tpllpiqlle elderéadaplation)

ProfesseurJean-MarieANDRE

50' -Sect ion: l'ATIIOLOGIE OST(W -ARTJCUI.A IRE,l>ERMATOl.OGIEel CIIiRU RG IE rLASTIQU E r'-sous-seetlo n:(RIIlI",al" f"gir)

ProfesseurJ••cquesl'OUREL- Professeur Isabelle VAL CKENAER E 2'-SOIIS-Hl't iun:(Chirurgieorlhopédique et (ramllolo(ogique)

Professeur Danie lSCIIMrn - ProfesseurJeun -PierreDELAGOUn 'E- ProfesseurDanielMOLE ProfesseurDidierMAINARD

3;- sous-section:(Derlllolo_vélléréologie)

ProfesseurJean-LucSCHMUTZ- ProfesseurAnnick BARBA UD 4- sous-section :(Chirurgie pfastique,rtcOllstructrice etestllétique)

ProfesseurFrançoisDAP

51""'"Scctlcu:l'AT I IO LO G IECA IUlIOI ŒSPIR AT O In EelVASCUI,AIRE 1;" so us-section :(rl/elllllologie)

Pro fe sseur YvesMARTINET-ProfesseurJean-FrançoisCHA BOT j,:....sous-scc ncn :«(.ordiologie)

Professe ur Etien neÂLiûï - Professeur-1-ves jUILLIERE - Professe urNicolas SADO U L-ProfesseurChristian deCHILLOU

]- sous-section:(Cllin trgitthoraciqueetcardiorasc ulaire] ProfesseurJean-PierreVILLEMOT

Pro fesseurJean-Pierre CARTEAUX- ProfesseurLoïcMACE 4" Nsnll.~-Sl'c1i(lll: (Chirurgie l'a.~CIfI(l irejmédecinel'flsCldaire)

ProfesseurGérardrIEVE

52' -Sect io n: ~IALi\I)J ESurs APPA REILS mGES TIFcfURINAIRE 1'" sous-section:(Gastroella rologie ;hépatologie)

ProfesseurMarc-And réBlGARD Pro fesseurJean-PierreBRONO WICKI

2'"Nsnus-s ectlon :(ClIifllrgie digestive] .1'- sous-section:(Ntpltrologie)

ProfesseurMich èleKESSLER- Professeur DominiqueIIESTIN(Mme) 4' -sous-sectio n :(Urologie)

Professeur PhilippeMANGIN - Professeur JacquesHUBERT- Pro fesseur LucCOR MIER

53'fl'"Section:MÉD ECINE INT ERNE,GÉRIATRIEetCIII HU RG IEGI~:NÉRA I,E l'" sous-sccuon:(AUdeCÎ/leil/terne)

ProfesseurFrancis PENIN- ProfesseurDeniseMONERET-VAUTRIN- Professe urDenisWAHL Professeur Jean -DominiqueDE KORWIN- ProfesseurPierre KA MINSKY

54- Section , DÉVELOPPEMENTETPATHOLOGIEDE L'ENFANT,GYNÉCOLOGIE-ûIlSTÉTRIQUE, ENDOCRINOLOGIE ET REPROD UCTION

linscus-secne n:(Pidiatrit)

ProfesseurDanièle SOMMELET- Professeur MichelVIDAILHET- ProfesseurPierreMONIN ProfesseurJean-MichelHASCOET- Professeur PascalCHASTAGNER- Professeur FrançoisFEILLET

2'- sous-section:(Cll irllrgieill/ al/tilt)

ProfesseurMichel SCHMITI- Professeur GillesDA UTEL- Profe sseurPierreJOURN EAU

3'- sons-secnun:(GYII!co/Qgie. obstétriqllt; gyl/écologiemldicale)

ProfesseurMichel SCHWEITZER- ProfesseurJean-Lou isBOUTROY Professeur Philippe JUDLIN - Professeur Patricia BARBARINO

4'- sous-sec ucn :(Elldocrillologied IIIaladies",ltaboIiqllt s)

ProfesseurGeorgesWERYHA- ProfesseurMarcKLEI N - Professeur BrunoGUERCI 5--sous-section:(Biologieetmi du ;lItdudi rtlopp tm tllt ttdtlartproductioll)

Professeur HubertGERARD

55""'"Section :PATHOLOGIEDELATÊTE ETnuCO U

)1..sous-sectlon: [Ota-rhino -laryngologieï

Professeur ClaudeSIMON- ProfesseurRoger JAN KQWS KI

2- seus-sec non : (Op Molmologit)

Profe sseurJean-LucGEORGE- ProfesseurJean-Paul BERROD - Professeur Karine ANGIOI-DUPREZ 3--sous-section:(Cld rl/rgie moxillq.fod al e etstomatologie)

ProfesseurMichel STRICKER- ProfesseurJean -FrançoisCHASSAGNE

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=======

l'nOFESSEuns UES UNIVERSITÉS

(,-1<-Section :UfOCIIIJ\lIE ET UIOLO G IE~IO Ll~CUI.AIRE

ProfesseurDaniel BURNEL

==========

MAÎTnE...s nECONFÎm ENCES DESUNIVERSIT I::S -l' RATlCIE NS1I0SPITALIEHS

42<-Se ct ion:J\lORI'1I0 LOGIE ET MOIH'1I0GENi.:sE

Iêr e sous-section:(Allatomit)

DocteurBrunoGRIGNON - Doct eurJean-PascalFYAD 2'- sous-section:(C)'tologiettI,istologie)

Doct eurEdouard BARRAl'- DocteurJean-Claude GUEDENET Docteur FrançoiseTO UAT!- Docteur Chan tal KOHLER

J'- scus-secuo u :(Alla/omieetcytologie!JalllOlogiqrll?s)

DocteurYvesGRIGNON- DocteurBéatrice MARIE Doc teur burentANTUNES

43- Sectio n :U10PIIYSIQUEET IMAG ERI E MÉDICALE

Jo..SOUS-l't'clion:(Biopllysiqueetm/dtC'ÎIlenucléaire]

DocteurMarie -HélèneLAURENS- Docteur Jean-ClaudeMAYER

44~-Section : BIOCHIMIE,DlOLOGIE CELLULAIRE ET MOLÉCULAIR E,PHYSIOLOGIE ETNUTRITION 1....sous-section:(llioehim ie et biologieII/oléel/ faire)

DocteurXavierHERBEUVAL- Docteur JeanSTRACZEK- Docteur SophiePRBMONT DocteurIsabelleGASTIN- DocteurBernard NAMOUR- DocteurMarcMERTBN

2- sous-section:(Pllysiologie)

DocteurGérardBTHEVENOT- Docteur NicoleLEMAUdeTALANCE- Docteur ChristianBEYAERT 4'- sous-sectlon:(Nu./ritioll)

DocteurDidierQUiLLIOT

45·....Section :MIC n.Om O LOGIE, l\I ALADIES TRANSl\IlSSIllLES ET HYGI ÈNE J;'" sous-section:(Bactiriolog ie - 1'irolog ie ;"ygi~lIe"osp ilalitre)

DocteurFrancineMORY- Docteur MichèleWEBER- DocteurChristine LION Docteur MichèleDAILl OUX- DocteurVéroniqueVENARD

2- sous-section :(l'arasitotogieetlIIJ'cologie)

DocteurMarie-FranceBIAVA- DocteurNellyCON'fET-AUDONNEAU

46;'- Section:SANTl~PUBLI QUE,ENVIRONNEMENTET SOCIÉTÉ 1;'" sous -sectio n :(f."pidblliologie,üOllo", iedelasa",i et prb'e1ltiofl)

Docteur FrançoisALLA

4;'" sous-section:(Rios/ot istiqll tS,illjonlloliq llt II/Micalt etttelm ol ogiesdecannnnnication(tJ'pebiologique) DocteurPierreGILLOIS

47 ....Section:CANCÉRO I.OGIE,Gf:NÉTIQUE, IJÉ MATO LOGIE,IMMUN O LOG IE

1;'" sous-section:(Ilémot%gie ; trollsjusiOl' )

DocteurFrançoisSCIIOONEMAN 3;"sous-secuon r(/lIIl11f11lOlogi e)

DocteurMarie-Nathalie SARDA 4... snus-sccüon :(Géll étique) DocteurChristophe1'IIILlI' PE

...~><-Sectio n: ANESTl Il~SIOLOGIr., RÉANltl lATlON,M~~I>ECINEn'URGENCE,

l'IIARMACO LOGI E ETT I IÉR AI'EU T IQUE

1;'" sous -section :(A/ll'sllttSÎologieelrtallimatÎ/1IIchirurgicale) Docteur JacquelineHELMER- Docteur GérardAUDIBERT

3;·wsuus-scctlo n :(l'''afmocologie[otuknnente!e;pluirnmcologiccliniqur ï

Docteu r FrançoiseLAPICQUE- DocteurMarie-JoséROYER-MORROT DocteurDamien LOEUILLE

54...Sccüon:Dlh'EI.OPPEtil ENT ET l' ATII OLOGIEI)E L'ENFANT ,GYN I~CO LOG I E-O nSTl~THIQlJE,

ENI>OCIU NOLO GIE ETREPRODUCTION

5;'"sous-s ecnon:(/li% gie el médecilledu dil'eloppemelllelde [arepfod,lCIÎOII)

DocteurJean-LouisCORDONNIER

---

-

-tlIAÎTRr..sDE CONFÉRENCES

19'....section:SOCIOLOGIE, DÉl\I OGRAPIII E MadameMichèleBAUMANN

40'"section:SCIENCES DU MÉDICAMENT Monsieur Jean-YvesJOUZEAU

60·m

•section :MÉCANIQUE,GÉNIE MÉCANI QUEETGÉNIE CIV ILE MonsieurAlainDURAND

~-sect ion: UIOCIIIMI EET mOLOGIE MOLÉC ULAIRE MadameMarie-Odile PERRIN- MademoiselleMarie-ClaireLANHERS

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s'n

..

section : BIO LO G IE CELLULA IRE

MademoiselleFrançoise DREYFUSS- MonsieurJean-LouisGELLY - MadameAnneGERARD

Madame KetsiaHESS - Monsieu rPierreTANKO SIC- MonsieurHer véMEMBRE

67...section:BIOLOGIE DES POPULATIONSET ÉC O LO G IE

Mada meNadi ne MUSSE

6S' -secti on: mOLOGIE DESORGANISM ES MadameTaoXU-JIANG

====

MAÎTRESDECO NF ÉREN C ESASSO CI(~S Médc clucGénërn tc

Docteu r AlainAUBREGE

Docteur FrancisRAPHAEL

l'IWFES SEURSl~J\.II~nITES

Professeur GeorgesGRIGNO N-cl'rotcsscurMichel PIERSON-ProfesseurMichel BOULAN GE

ProfesseurAlai nLARCA N· ProfesseurMichelWAYOFF- Professeur DanielANTIIOINE Profe sseurIIu1lC11Ur FHO L1'2- Professeur Pierre GAU CHER- Professe urClaude CHAR DO T

ProfesseurAdrienDUPREZ· ProfesseurPaulVERT - ProfesseurJeanPREVOT- ProfesseurJean-PierreGRILLIAT

ProfesseurPhilippe CANTON- ProfesseurIienri HEPN ER- ProfesseurPierre MAT HIEU- Professeur GilbertTIIIBAUT

---

--

---IJO(''TEUR S1I0NOIUSCAUS A

Pro fesseurNormanSI IUMWAy (1972) Universitéde'SflU/ford .Californie(U.S.A) Professeur Paul MICIlIELSEN(1979) UniversitéCothotique, Lm waill (Belgiqlle)

Pro fesseur Charles A. BERRY(1982)

CentredeMMecitlcPréventive,Houston (V,S.A) ProfesseurPierre-Marie GALETIl(1982)

Brown University,Providence (US A)

Pro fesseur Mautish Nisbet MUNR O (1982) Mossachusenstnsüuue ofTe chnologv (U.S.A) Professeur MildredT.STAHLMAN(1982)

\Va llderbillUniversitv.Nashville(USA)

Harr y J.BUNCKE(Î989)

UIlÎl'ers;tideCalifomie.Sali Francisco(USA)

ProfesseurThéodore H. SCH IEBLER(19R9)

Institut d'Anatamiede lViirtzblllg(R.FA)

ProfesseurMaria DELI VORIA-PAPADOPOULO S (1996)

UniversitédePennsylvanie (USA ) ProfesseurMashakiKASHIWARA(1996)

Resea rctilnsntuteforMatht'matical SciencesdeKy oto (JAPO N) ProfesseurRalphGAASBECK (1996)

Universitéd'Helsinki(FIN LANDE) ProfesseurJamesSTEICHE N (1997)

Universi t éd'Indiana po lis(U,S,A)

Professeur DuongQuangl'RUNG(1997)

Centre Univers itairedeFormationetdePerfectionnementdes Prof essianueisde Sallté d'Hô Chi Milli/-Ville (VIÊTNAM)

A Notre Maître et Président de Thèse

Monsieur le Professeur A

lain

LOZNIEWSKI

Professeur de Bactério

logie

-Virolog

ie

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A notre Maitre et Juge

Madame le Professeur Janine SCHWARTZBROD

Professeur de Microbio

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A notre Maître et Juge

Monsieur le Professeur Christian RABAUD

Professeur de Maladies Infectieuses & Tropicales

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r

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A notre Juge

Madame Francine MORY

Maitre de Conférence des Univers

ités

Vous m

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g

uidée

e

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s

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u

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ssance

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proj

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rande d

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A notre Juge

Mademoiselle Hél

éne SC

HUHMAC HE R

Praticien Hospitalier de Maladie

s

Infectieuses & Trop

icales

Je s

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emerciée e

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urée d

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fond

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J

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adresse également

des remerciemen

ts

sincères

à

celles et

ceux qui ont apporté

leur collaboration ou leur soutien de près ou de

loin

dans

la réalisation

de ce travai

l:

A

Madame

Michèle W

EBER,

MCU-PH, qui

a

su

me

tr

ansmettre,

depuis

les

premières

années

de

faculté,

les

connaissa

nces

microbiologiques

nécessaires

à

l'exercice

de

la

biologie

.

A Xavier HAR

ISTOY

,

assistant hospita

lo-universitaire,

pour

son soutien au quotidien

,

ses conseils et ses tests sur

les

antibiogrammes

!

!!

Aux techniciennes

du

secteur

d'Antibiologie :

Marie-Renée

BALLAND,

Isabelle SCHO

LTUS

,

Marti

ne BENZAïED et Joëlle

GA

UTHIER

qui m'ont prodigué de précieux consei

ls

et

fait bénéficier

de

leur expérience

.

Marie-Renée

,

un grand merci pour ta soup

lesse

et

ta disponibilité

;

j'espére ne pas avoir été trop tyrannique

avec

toi

..

.

Aux

techn

i

c

i

ens et t

echniciennes du

secteur des Anaérobies

:

Catherine

LEHER

,

Sophie

CONTANT

,

Monique C

HAON

et

Jean-Pierre ROU

I

LLEAUX qui m'ont soutenu tout au

l

ong de ce

lte

année

avec

l

e

ur

sourire

et

l

eur disponibilité

.

A

l'

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n

plaisir de

travai

ll

er pendant

tro

is

semestres

à

vos côtés.

Au

personnel

de

l

a préparat

io

n

des

mi

l

ieux

de culture

et

de

la

stérilisation

pour leur dévoue

ment.

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ris (à

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nnées

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Je

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soins

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ell

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Je

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e ma mission.

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Je {e

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J'apport

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aide à m

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TABLES DES MAT

IERES

INTRODUCTION 9

PROPIONIBAC TERIUM ACNES 12

1. HISTORIQUE ET TAXONOMIE 13

II. HABITAT 14

III. POUVOIRPATHOGENE 14

111.1.L'acné 14

111.2.Infections suppuratives 15

IV.CARACTERES BACTERIOLOGIQUES 16

IV.1. Caractéres morphologiques etculturaux 16

IV.2.Caractéresbiochimiques 18

IV.2.1. Métabolismedeshydrates de carbone 18

IV.2.2.Métabolisme azoté 18

IV.2.3.Enzymes synthétisées 19

IV.3. Sensibilité aux antibiotiques 20

LES INFECTIONS NEURO-MENINGEES 21

1. L'ABCES CEREBRALET L'EMPYEME SOUS-OURAL 23

1.1. Physiopathologie 23

1.2.Aspects cliniques 24

1.2.1.Abcés cérébral 24

1.2.2.Empyéme sous-durai(ESD) 25

1.3.Aspects paracliniques 26

1.3.1.Imagerie 26

1.3.1.1.Tomodensitométrie cérébrale (TOM) sansetavec injection de

produit de contraste iodé (PCI) 26

1.3.1.2.Imagerieparrésonance magnétique nucléaire (IRM) 28

1.3.1.3. Examensisotopiques 29

1.3.2.Biologie 29

lA.Traitement

IA.1.Traitement neurochirurgical 1.4.2.Antibiothérapie

1.4.2.1.Aspectsthéoriques 1.4.2.1.1.Objectifs

1.4.2.1.2.Donnéespharmacocinétiques 1.4.2.1.3.Choix du traitement

1.4.2.2.Modalitéspratiques

1.4.2.3. Recomma ndations actuelles

1.4.2.3.1. Antibiothérapie probabiliste 1.4.2.3.2.Antibioprophylaxie

II.INFECTIONS SUR VALVE 11.1.Physiopathologie 11.2.Aspects cliniques 11.3.Aspectsparacliniques liA.Traitement 32 32 33 33 33 34 38 38 38 38

40

40

40

40

41 42 III.PROBLEMESENGENDRES PAR LESBACTERIES

MULTIRESISTANTES 43

TRAVAILPERSONNEL 45

OBJECTIFS DEL'ETUDE 46

MATERIELS ETMETHODES 48

1. SOUCHES BACTERIENNES,MILIEUX ETCONDITIONS DE CULTURE49

1.1.Souches 49

1.2.Conditionsetmilieuxde culture 49 1.3.Préparationd'un milieupré-réduit 51 II.MOLECULES ANTIBIOTIQUES 52

III. DETERMINATIONDES CMI 53

111.1.Objectifs 53

111.2. Souches bactériennes et molécules antibiotiques 53

111.3.Protocole 54

IV.ETUDE CINETIQUE DE L'A CTIVITEBACTERICIDE 55

IV.1. Moléculesantibiotiques testées 55

IV.2.Souche bactérienne 56

IV.3.Protocole 56

IV.3.1.Préparationdes solutions d'antibiotiques 56

IV.3.2.Préparation dei'inoculum 57

IV.3.3.Réalisationpratique 57

IV.3.4.Numérationbactérienne 58

IV.3.5.Expression desrésultats 58

RESULTATS 60

1. ACTIVITE BACTERIOSTATIQUEDES ANTIBIOTIQUES VIS-A-VISde P.

ACNES 61

II.ACTIVITE BACTERICIDE DES ANTIBIOTIQUES VIS-A-VISDE P.ACNES

(PAN14) 64

11.1.Céfotaxime etvancomycine 64

11.1.1.Antibiotiques seuls 64

II.1.1.1.Céfotaxime 64

11.1.1.2.Vancomycine 65

11. 1.2.Association 66

11.2.Céfotaxlme etfosfomycine 67

11.2.1.Antibiotiques seuls 67

11.2.1.1.Céfotaxime 67

Il.2.1.2.Fosfomycine 67

11.2.2.Association 68

i1.3.Céfotaxime et métronidazole 69

11.3.1. Antibiotiquesseuls 69

11.3.1.1.Céfotaxime 69

11.3.1.1.1.Avec Oxyrase" 69

11.3.1.1.2.SansOxyrase" 69

11.3.1.2.Métronldazole 70

11.3.2.Association 70

11.3.2.1.Avec Oxyrase" 70

Il.4.1.Antibiotiquesseuls Il.4.1.1.Céfotaxime

Il.4.1.2.0 uinupristine-dalfopristine 11.4.2.Association

11.5.Ouinupristine-da lfopristine et vancomyci ne 11.5.1.Antibiotiques seuls

Il.5.2.Association

11.6.Ouinupristine-dal fopri stine et métronid azole 11.6.1.Antibiotiqu es seuls

11.6.2.Association

Il.7.Ciprofloxac ineet c1indamycine Il.7.1.Antibiotiques seuls

II.7.1.1.Ciproflo xacine

11.7.1.2.Clinda mycine

11.7.2.Association

Il.8.Linezolideetcéfotaxime Il.8.1.Antibiotiq ues seuls Il.8.1.1.Céfotaxime 11.8.1 .2.Linézolide 11.8.2.Association DISCUSSION CONCLUSION BIBLIOGRAP HIE ANNEXES 71 71 71 73 74 74 75 76 76 76 77 77 77 77 78 78 78 78 79 79 80 87 89 113 4

RECAP

ITULATIF

DES F

IGURES

Figure n01 :Cinétique de l'activité ducéfotax ime

à

différentes concentrations 64

Figure n02:Cinétique de l'activité de la vancomyc ine à différentes

conce ntrations 65

Figure n03 :Cinétiquede l'activité de l'associationcéfotaxime +vancomycine

(concentration :Y,x CMI) 66

Figuren04 :Cinétiquede l'activité del'associationcéfotaxime+vancomycine

(concentrations :1 x CMIet2 x CMI) 67 Figure n05 :Cinétique del'activitéde l'associationcéfotaxime + fosfomycine.68

Figure n06 :Cinétique de l'activité du céfotaxime (concentrations: 1x CMIet2 x

CMI)avec et sans Oxyrase" 69

Figure n0 7

:Cinétique de l'activité del'association céfotaxime +métronidazole

(concentrations: 1x CMIet2 x CMI)avec etsans Oxyrase" 71

Figure n08:Cinétique de l'activitéde OD àdifféren tes concentrations 72 Figure nog:Cinétique del'activité del'associationQD+céfotaxime

(concentration :1 x CMI 73

Figuren010 :Cinétique del'activité del'association

00

+céfotaxime

(concentration :2 x CMI) 74

Figure n011 :Cinétiquedel'activité de l'association QD+ vancomycine

(concentration: 1x CMI) 75

Figuren012 :Cinétiquedel'activité de l'association OD +vancomycine

(concentration:2 x CMI) 76

Figure n013:Cinétique de l'activitéde la ciprofloxaci ne à différentes

concentrations 77

Figure n014: Cinétiquedel'activité del'associationciprofloxacine+

c1indamycine(concentrations:1x CMIet2 x CMI) 78

Figure n015:Cinétiquedel'activité del'associationlinézolide+ céfotaxime

RECAP

ITULATIF

DES TABLEAUX

Tableaun01 :Classilieation taxonom ique de Propionibaeteriumaenes 58 13

Tableau n02 :Fréqu ence d'apparition desdifférents signes cliniques12,96 ,174 •. 25

Tableau n03 :Flore bactérienne isolée etlocalisation d'unabcès cérébralen

1_onet_Ii_on d_{e e}l'éti l_{10 og}'_repres. _umee. 1293_{' ,}157_,165174_{, .}31 Tableau n04 :Diffusion intraméningée et intracér ébralede différents

antibiotiques 37

Tableau n05 :Antibiothérapieprobabiliste des abcès cérébrauxetempyèmes

sous-duraux recomm and ée en France 39

Tableaun06 :Antibiothérapie probabilistedes abeés cérébrauxetempyèmes

sous-d ura ux recomm andée aux Etats-Unis 12,174 39

Tableau 7 :Distribution des CMI(mg/l)8 62

Tableau8 :Activité bactériostatique de 16 antibiotiques vis-à-vis des 24

souches de P.

acnes

63

RECAPITULATIF

DES PHOTOGRAPHIES

Photographie n'1 :Aspect microscopiquede P.

ac

nes

(coloration de Gram)...16

Photographien'2:Aspect macroscopiqu e d'une culturede P.

ac

nes

surgélose

Brucella à 72 heures 17

Photographien03:Aspect macroscopique d'une culture de P.

ac

nes

surgélose

Brucella à 96 heures 18

Photographie n'4 :Principaux caractéresbiochimiques d'identification de

P

.

ac

nes

19

Photographien'5 :Abcés cérébral (TDM sansetavec injection) 27

Photographie n'6:Empyéme sous-durai (TDM avec injection de PCI) 27

Photographien'7 :Abcés cérébrald'origine mastoïdienne (IRM séquence T1) ... ...28

Photographie n'8:Chambreanaérobie 50

Photographie n'9 :Flacon utilisé lorsdes essais de cinétiques 52

ABREVIATIO

NS

UTILISEES

ATCC :Amer ican Type Cultureand Collection

BGN: bacillesà Gram négatif aérobies

CA-SFM :Comité de l'Antibiogramm e de la Société Françaisede Micro biologie C3G:céphalosporine detroisième génération

Cip:ciprofloxacine Clin: c1indamycine

CMI:concentrationminimale inhibitrice CTX :céfotaxime

DE:dérivation externe

ESD :empyéme sous-durai

Fasfo :fosfomycine FQ :fluoroquinolone

HMPAO:hexaméthylpropylèneamine oxime HSD : hématome sous-durai

INM:infection neuro-méningée

IRM :imagerie par résonancemagnétique nucléaire IV :intra-veineux

j =jour

LCR :liquide céphalo-rachidien LNZ:linézolide

MNZ :métronidazole

NCCLS :NationalCommitte for ClinicalLaboratory Standards PAN:P.aenes Nan ey

PCi :produitde contraste iodé PLP:protéine liant lespénicillines OD : quinupristine-dalfop ristine TDM :tomodensitométrie Van: vancomycine

r!)-UHp

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'<:00 -Décrits par Gilchrist en 1900, les Propionibacterium comme nsaux

s

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I

.

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' de découverte très ancienne ;d'abord classés dans le genre Corynebacterium,

ils appartiennent actuelleme ntau genre Propionibacterium.

Parmi les Propionibac terium appartenant aux flores commensales cutanéo- muqueuses de l'homme,Propionib acteriu m acnesest respon sable, en association avec Staphylococcus epidermidis, de la surinfection des lésion s acnéiques mais aussi d'infections plus graves. Cet aspec t de sa path ogénîcité est moin s connu car P.

acnes

a souvent

é

té

considé ré comme une bactérie contaminante. Le rôle pathogène de

P

.

acnes

dans les infections n euro-méningées (INM) n'a

é

té

que récemment reconnu par la Société Française d'Anesthésie-Réanimation à la faveur de deux études 98,177, Ceci explique le faible nombrede publications ayant porté à latoissurP.acnes etsur les INM.

Les travaux concernant l'étude de la sensibilité de P.

acnes

aux antibiotiques reposent essentielleme nt sur la détermination de concentration s minimales inhibitrices (CMI) et seuleme nt quelques essais cinétiques de l'activité bactéricide ontété publiés31.16 4.

Or, dans les INM, l'antibi oth érapie doit répondre à des critères impératifs, surtout en présence d'infections nosocomiales provoqu ées par des bactéries multirésistantes: spectre adapté pour une antibiothérapie probabiliste, activité bactéricide et synergique ainsi que préve ntion de

l'émergence de mutants résistants par l'association de deux voire trois antibiotiques,enfin pénétration optimale ausein du tissu infecté 163.

L'objet de ce travail a été de réaliser l'étude des activités bactériostatique puis bactéricide de certaines molécules antibiotiqu es vis-à-vis de cette espèce bactérienne. Les résultats obtenu s pourraient contribuer

à

la réévaluation de l'antibiothérapie probabiliste actuelleme nt définie pour les INM. Dans un premier temp s, nous avons évalué in vitro l'activité des molécules habituellement recomma ndées dans le traitem ent de ce type d'infec tion ; dans

un second temps, nous avons testé de nouvelles molécules actives sur les bactéries à Gram positif multirésistantes impliquées dans les infections postopératoires(Iinézolide,quinupristine-dalfopristine).

PROPIONIBA CTERIUM

ACNES

1.

H

ISTORIQUE

ET TAXONOM

IE

Propionibacterium acnes appartient au groupe des bacilles

à

Gram

positif anaérobies non sporulés. Cette bactérie, isolée de lésions d'acné vulgaris par Unna en 1896,a été cultivée pour la première fois par Sabouraud en 1897. Elle a été successivementdénommée Bacil/us aenes parGilchristen 1900, Corynebac lerium acnes par Eberson en 191 8 puis Propionibaclerium acnes par Douglas et Gunteren 194644. Unsynonyme a été parfois employé: Coryne bacterium parvum 34.

Ta

bleau

n01 : C

lassification

taxo

nomiq ue

de

Pr

opionibacte rium

ac

nes

58

Domaine Bacteria

Phylum BXIV.Actinobacteria phy. nov

Classe Actinobacteria

Sous-classe Actinobacteridae

Ordre Actinomycetales

Sou s -o rd re Propionibacterineae

Famill e Propionibacteriaceae

Genre Propionibacterium

II. HABITAT

87,l 18

Le genre Propionibacterium comprend, d'une part, des espèces présentes dans l'environnement (P. freudenreichii, P. thoenii, P.jensenii et P. acidipropionicl) et, d'autre part, des espèces appartenant aux flores comme nsales cutanéo-muqueuses de l'homme (P. acnes, P. avidum, P.

granulosum,

P.

Iymph ophilum).

Au niveau de la peau et du cuir chevelu, P.

a

cnes

réside dans les glandessébacéesetlesfollicules pileux.

III. POUVOIR PATHOGENE

P. acnes, qui intervientdans la physiopathologie de l'acné, se comporte

également comme un pathogène opportuniste et peut, de ce fait, ètre

responsable d'infectionsplus sévères 18,86.

111.

1

.

L'acné

46,13 3

L'acné est une maladie du follicule pilo-sébacé qui résulte d'une anomalie de la kératinisation, d'une hyperproduction de sébum et de la prolifération de certaines espèces bactériennes appartenant

à

laflore cutanèe,

notammentP.

ac

nes

etS.epkiennidis.

P.acnes neprovoquepas seulement uneinfection dufolliculepilosébacé,mais induit également une réaction inflammatoire, par le biais de différents mécanismes : production de lipases (hydrolyse du sébum entrainant la

formationd'acides gras à activité pro-inflammatoire et chimiotactique pour les

polynucléaires), activation directe de la voie classique du complément et

stimulation de l'interleukine 1.De plus,les acides gras produit parP.

acnes,

de parleur action irritante,peuvent aggraverleslésions.

Ainsi, P.

acnes

joue un rôle primordial dans l'induction et le maintien de laphase inflammatoirede l'acné.

111.

2

.

Infection s s

uppura t ives

Comme toutes Jes bactéries pathogènes opport unistes appartenant aux flores commensales, P. acnes peut être responsable d'autres infections, favorisées par une effraction cutanéo-muqueuse post-traumatique, pos t-chirurgicale, ou par la pose d'un matériel étranger 73 : endocardites après implantation d'une valve artificielle 17,71,102,108 ,134, ventriculites ou méningites

après dérivation du liquide céphalo-rachidien (LCR) 8,10,19,24,146,172 ,183

spondylodiscites survenant à la suite d'une anesthésie péridurale 33,72, 75 ,82 .145,

endophtalmies après chirurgie intraoculaireoupose d'imp lants 45,55,125,167 ,184,188, infections pulmonaires aprèspose de drain pleural 17, péritonites après dialyse péritonéale tz Il a également été montré que la production de biofilm

à

la surface de biomatériaux orthopédi ques parcertaines souchesde P.

aen

es

peut favoriser la survenued'ostéomyélites après ostéosynthèse 141,

La fréquence de ces infections est certainement sous-estimée comme

cela a été démontré pour les méningites chez les sujets porteurs d'une dérivation externe 19,183. Cette sous-estimation peut être due à une mise en culture anaérobie non systématique, une durée d'incubation insuffisante des milieux anaérob ies ou l'absence de prise en compte du pouvoir pathogè ne de P.

aenes

.

Il est possible de minimiser ce dernier point si l'on tient compte d'arguments démontrant l'implication de P.

acnes

:

examen direct positif indiquant la présencede bacilles

à

Gram positif corynéfor mes, isolement de P.

I

V. C

ARACTERES BACTER

IOLOG IQUES

59,87,118

I

V.1 .

Car

actères mo

rphol ogiq ues et c

ulturaux

P. acnes se présente sous la forme de petits bacillesdiphtérimorphes

à

Gram positif, mesurant de 0,5

à

0,8 ~ de diamètre et de 1

à

5 ~ de long, immobiles,non sporulés (photographie n01);des formescoccoïdes, bifides ou ramifiéespeuventêtre observées.

P

hotographie n

0

1: As

pect

m

icroscopiq ue d

e

P

.

acnes

(

coloration

de

G

ram)

r

.

-•

En gélose profonde, les colonies sont lenticulaires, blanches, d'une taille

supérieureou égaleà 4 mm ;unepigmentation rose ouorange peutapparaître chezcertainessouchesaprèstrois semainesd'incubation.

Après 2 à 3 jours d'incubation sur gélose au sang, les colonies sont punctiformes,circulaires ,translucidesà opaques, blanchesà grises,brillantes;

l'obtentionde subcultures nécessite48 heuresd'incubat ion. (photographiesn02

et n03)

Sa croissance est préférentielle en atmosphère anaérobie mais P.

a

cnes

peut se développer en atmosphère aérobie enrichie en dioxyde de carbone. Sa

température optimale decroissance se situeentre30et37°C.

Photograph

ie

n

02:

Aspect ma

croscopique

d

'un

e

c

ulture

de P

.

acnes

s

ur

gé

lose

Br

uce lla

à

72

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P

hot ograp hie

n03

:

Aspe

ct

macroscop

ique

d

'une

culture de P

.

acnes

sur gé

lose

B

ruce lla

à

96 heures

IV

.2.

Carac

tères

bi

och imiques (

phot ographie n04

)

IV.2.1. Métabolisme des hydrat es de carb one

P.

aen

es

t

e

rmente

le glucose etinconstammentleglycérolet le sorbitol.Il ne

fermentepasle lactose,lemaltoseet le saccharose. Iln'hydrolysepas

l'esculine.

Les produits majeurs terminaux de la fermentation du glucose, analysés par chro matographieen phase gazeuse,sontles acides propionique et acétique.

IV.2.2. Métabo lismeazoté

C'est la seule espèce de Propionibacterium capable de produire de

l'indole ;néanmoins, ce caractère discriminant peut manquer.

La plupart des souches réduisent les nitrates en nitrites : la gélatine est hydrolysée.Le laitcystéinéestleplus souventcoagulépuisdigéré.

P

hotographi e

n

0 4

: P

rincipaux

ca

rac tè res bio

ch imiques

d

'i

de ntificati o n d

e P

.

ac

nes

IV.2.3. Enzymes synthétisées

P.

acnes

produit généralement une catalase. Il synthétise d'autres

enzymes (neuraminidase, hyaluronidase, chondroïtine-sulfatase, lipase,

lécithinase, ribonucléase, phosphatase acide...) qui contribuent à son pouvoir

I

V.3. Sens

ibilité

aux ant

ibiotiques

28,118,186

Comme toutes les bactéries anaérobies,

P.

ac

nes

est naturellement résistant aux aminoglycosides, à l'aztréonam et au triméth oprime. Par ailleurs, il

es

t

également résistant aux 5-nitroimidazolés,

à

la fosfomycine et

à

la colistine.

Ces bactéries sont sensibles aux 0-lacta mines, la céphalospo rine la plus active étant le céfotax ime 40,aux phénicolés 182, auxcyclines 100, aux macrolides 100, à la clindamycine 100, aux streptogramines, aux glycopeptides (vancomyc ine, teicoplanin e), aux f1uoroquin olones,à l'acidefusidique et à la rifampicine

La résistance acquise concerne certains antibiotiques utilisés pour le

traitement de l'acné, à savoir les macrolides, les lincosamides et les cyclines

13,100,101,133

LES INFECTIONS

NEURO-MENINGEES