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UNIVERSITE MOHAMMED V DE RABAT
FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE - RABAT DOYENS HONORAIRES :
1962 – 1969 : Professeur Abdelmalek FARAJ 1969 – 1974 : Professeur Abdellatif BERBICH
1974 – 1981 : Professeur Bachir LAZRAK
1981 – 1989 : Professeur Taieb CHKILI
1989 – 1997 : Professeur Mohamed Tahar ALAOUI 1997 – 2003 : Professeur Abdelmajid BELMAHI
2003 – 2013 : Professeur Najia HAJJAJ - HASSOUNI
ADMINISTRATION :
Doyen : Professeur Mohamed ADNAOUI
Vice Doyen chargé des Affaires Académiques et estudiantines
Professeur Mohammed AHALLAT
Vice Doyen chargé de la Recherche et de la Coopération
Professeur Taoufiq DAKKA
Vice Doyen chargé des Affaires Spécifiques à la Pharmacie
Professeur Jamal TAOUFIK
Secrétaire Général : Mr. Mohamed KARRA
1- ENSEIGNANTS-CHERCHEURS MEDECINS
ET
PHARMACIENS
PROFESSEURS :
Décembre 1984
Pr. MAAOUNI Abdelaziz Médecine Interne – Clinique Royale
Pr. MAAZOUZI Ahmed Wajdi Anesthésie -Réanimation
Pr. SETTAF Abdellatif pathologie Chirurgicale
Novembre et Décembre 1985
Pr. BENSAID Younes Pathologie Chirurgicale
Janvier, Février et Décembre 1987
Pr. CHAHED OUAZZANI Houria Gastro-Entérologie
Pr. LACHKAR Hassan Médecine Interne
Pr. YAHYAOUI Mohamed Neurologie
Décembre 1988
Pr. BENHAMAMOUCH Mohamed Najib Chirurgie Pédiatrique
Décembre 1989
Pr. ADNAOUI Mohamed Médecine Interne –Doyen de la FMPR
Pr. CHAD Bouziane Pathologie Chirurgicale
Pr. OUAZZANI Taïbi Mohamed Réda Neurologie
Janvier et Novembre 1990
Pr. CHKOFF Rachid Pathologie Chirurgicale
Pr. HACHIM Mohammed* Médecine-Interne
Pr. KHARBACH Aîcha Gynécologie -Obstétrique
Pr. MANSOURI Fatima Anatomie-Pathologique
Pr. TAZI Saoud Anas Anesthésie Réanimation
Février Avril Juillet et Décembre 1991
Pr. AL HAMANY Zaîtounia Anatomie-Pathologique
Pr. AZZOUZI Abderrahim Anesthésie Réanimation –Doyen de la FMPO
Pr. BAYAHIA Rabéa Néphrologie
Pr. BELKOUCHI Abdelkader Chirurgie Générale
Pr. BENCHEKROUN Belabbes Abdellatif Chirurgie Générale
Pr. BENSOUDA Yahia Pharmacie galénique
Pr. BERRAHO Amina Ophtalmologie
Pr. BEZZAD Rachid Gynécologie Obstétrique
Pr. CHABRAOUI Layachi Biochimie et Chimie
Pr. CHERRAH Yahia Pharmacologie
Pr. CHOKAIRI Omar Histologie Embryologie
Pr. KHATTAB Mohamed Pédiatrie
Pr. SOULAYMANI Rachida Pharmacologie – Dir. du Centre National PV Pr. TAOUFIK Jamal Chimie thérapeutique V.D à la pharmacie+Dir du
CEDOC
Décembre 1992
Pr. AHALLAT Mohamed Chirurgie Générale V.D Aff. Acad. et Estud
Pr. BENSOUDA Adil Anesthésie Réanimation
Pr. BOUJIDA Mohamed Najib Radiologie
Pr. CHAHED OUAZZANI Laaziza Gastro-Entérologie
Pr. CHRAIBI Chafiq Gynécologie Obstétrique
Pr. DEHAYNI Mohamed* Gynécologie Obstétrique
Pr. EL OUAHABI Abdessamad Neurochirurgie
Pr. FELLAT Rokaya Cardiologie
Pr. GHAFIR Driss* Médecine Interne
Pr. JIDDANE Mohamed Anatomie
Pr. TAGHY Ahmed Chirurgie Générale
Pr. ZOUHDI Mimoun Microbiologie
Mars 1994
Pr. BENJAAFAR Noureddine Radiothérapie
Pr. BEN RAIS Nozha Biophysique
Pr. CAOUI Malika Biophysique
Pr. EL BARDOUNI Ahmed Traumato-Orthopédie
Pr. EL HASSANI My Rachid Radiologie
Pr. ERROUGANI Abdelkader Chirurgie Générale- Directeur CHIS
Pr. ESSAKALI Malika Immunologie
Pr. ETTAYEBI Fouad Chirurgie Pédiatrique
Pr. HADRI Larbi* Médecine Interne
Pr. HASSAM Badredine Dermatologie
Pr. IFRINE Lahssan Chirurgie Générale
Pr. JELTHI Ahmed Anatomie Pathologique
Pr. MAHFOUD Mustapha Traumatologie – Orthopédie
Pr. RHRAB Brahim Gynécologie –Obstétrique
Pr. SENOUCI Karima Dermatologie
Mars 1994
Pr. ABBAR Mohamed* Urologie
Pr. ABDELHAK M’barek Chirurgie – Pédiatrique
Pr. BELAIDI Halima Neurologie
Pr. BENTAHILA Abdelali Pédiatrie
Pr. BENYAHIA Mohammed Ali Gynécologie – Obstétrique Pr. BERRADA Mohamed Saleh Traumatologie – Orthopédie
Pr. CHAMI Ilham Radiologie
Pr. CHERKAOUI Lalla Ouafae Ophtalmologie
Pr. JALIL Abdelouahed Chirurgie Générale
Pr. LAKHDAR Amina Gynécologie Obstétrique
Pr. MOUANE Nezha Pédiatrie
Mars 1995
Pr. ABOUQUAL Redouane Réanimation Médicale
Pr. AMRAOUI Mohamed Chirurgie Générale
Pr. BAIDADA Abdelaziz Gynécologie Obstétrique
Pr. BARGACH Samir Gynécologie Obstétrique
Pr. CHAARI Jilali* Médecine Interne
Pr. DIMOU M’barek* Anesthésie Réanimation
Pr. DRISSI KAMILI Med Nordine* Anesthésie Réanimation
Pr. EL MESNAOUI Abbes Chirurgie Générale
Pr. ESSAKALI HOUSSYNI Leila Oto-Rhino-Laryngologie
Pr. HDA Abdelhamid* Cardiologie - Directeur HMI Med V
Pr. IBEN ATTYA ANDALOUSSI Ahmed Urologie
Pr. OUAZZANI CHAHDI Bahia Ophtalmologie
Pr. SEFIANI Abdelaziz Génétique
Pr. ZEGGWAGH Amine Ali Réanimation Médicale
Décembre 1996
Pr. AMIL Touriya* Radiologie
Pr. BELKACEM Rachid Chirurgie Pédiatrie
Pr. BOULANOUAR Abdelkrim Ophtalmologie
Pr. EL ALAMI EL FARICHA EL Hassan Chirurgie Générale
Pr. GAOUZI Ahmed Pédiatrie
Pr. MAHFOUDI M’barek* Radiologie
Pr. OUADGHIRI Mohamed Traumatologie-Orthopédie
Novembre 1997
Pr. ALAMI Mohamed Hassan Gynécologie-Obstétrique
Pr. BEN SLIMANE Lounis Urologie
Pr. BIROUK Nazha Neurologie
Pr. ERREIMI Naima Pédiatrie
Pr. FELLAT Nadia Cardiologie
Pr. HAIMEUR Charki* Anesthésie Réanimation
Pr. KADDOURI Noureddine Chirurgie Pédiatrique
Pr. KOUTANI Abdellatif Urologie
Pr. LAHLOU Mohamed Khalid Chirurgie Générale
Pr. MAHRAOUI CHAFIQ Pédiatrie
Pr. TAOUFIQ Jallal Psychiatrie
Pr. YOUSFI MALKI Mounia Gynécologie Obstétrique
Novembre 1998
Pr. AFIFI RAJAA Gastro-Entérologie
Pr. BENOMAR ALI Neurologie – Doyen de la FMP Abulcassis
Pr. BOUGTAB Abdesslam Chirurgie Générale
Pr. ER RIHANI Hassan Oncologie Médicale
Pr. BENKIRANE Majid* Hématologie
Pr. KHATOURI ALI* Cardiologie
Janvier 2000
Pr. ABID Ahmed* Pneumophtisiologie
Pr. AIT OUMAR Hassan Pédiatrie
Pr. BENJELLOUN Dakhama Badr.Sououd Pédiatrie
Pr. BOURKADI Jamal-Eddine Pneumo-phtisiologie
Pr. CHARIF CHEFCHAOUNI Al Montacer Chirurgie Générale
Pr. ECHARRAB El Mahjoub Chirurgie Générale
Pr. EL FTOUH Mustapha Pneumo-phtisiologie
Pr. EL MOSTARCHID Brahim* Neurochirurgie
Pr. ISMAILI Hassane* Traumatologie Orthopédie- Dir. Hop. Av. Marr. Pr. MAHMOUDI Abdelkrim* Anesthésie-Réanimation Inspecteur du SSM
Pr. TACHINANTE Rajae Anesthésie-Réanimation
Pr. TAZI MEZALEK Zoubida Médecine Interne
Novembre 2000
Pr. AIDI Saadia Neurologie
Pr. AJANA Fatima Zohra Gastro-Entérologie
Pr. BENAMR Said Chirurgie Générale
Pr. CHERTI Mohammed Cardiologie
Pr. ECH-CHERIF EL KETTANI Selma Anesthésie-Réanimation
Pr. EL HASSANI Amine Pédiatrie Directeur Hop. Chekikh Zaied
Pr. EL KHADER Khalid Urologie
Pr. EL MAGHRAOUI Abdellah* Rhumatologie
Pr. GHARBI Mohamed El Hassan Endocrinologie et Maladies Métaboliques
Pr. MAHASSINI Najat Anatomie Pathologique
Pr. MDAGHRI ALAOUI Asmae Pédiatrie
Décembre 2000
Pr. ZOHAIR ABDELAH* ORL
Décembre 2001
Pr. BALKHI Hicham* Anesthésie-Réanimation
Pr. BENABDELJLIL Maria Neurologie
Pr. BENAMAR Loubna Néphrologie
Pr. BENAMOR Jouda Pneumo-phtisiologie
Pr. BENELBARHDADI Imane Gastro-Entérologie
Pr. BENNANI Rajae Cardiologie
Pr. BENOUACHANE Thami Pédiatrie
Pr. BEZZA Ahmed* Rhumatologie
Pr. BOUCHIKHI IDRISSI Med Larbi Anatomie
Pr. BOUMDIN El Hassane* Radiologie
Pr. CHAT Latifa Radiologie
Pr. DAALI Mustapha* Chirurgie Générale
Pr. DRISSI Sidi Mourad* Radiologie
Pr. EL HIJRI Ahmed Anesthésie-Réanimation
Pr. EL MAAQILI Moulay Rachid Neuro-Chirurgie
Pr. EL MADHI Tarik Chirurgie-Pédiatrique
Pr. EL OUNANI Mohamed Chirurgie Générale
Pr. ETTAIR Said Pédiatrie Directeur. Hop.d’Enfants
Pr. GAZZAZ Miloudi* Neuro-Chirurgie
Pr. HRORA Abdelmalek Chirurgie Générale
Pr. KABBAJ Saad Anesthésie-Réanimation
Pr. KABIRI EL Hassane* Chirurgie Thoracique
Pr. LAMRANI Moulay Omar Traumatologie Orthopédie
Pr. LEKEHAL Brahim Chirurgie Vasculaire Périphérique
Pr. MAHASSIN Fattouma* Médecine Interne
Pr. MEDARHRI Jalil Chirurgie Générale
Pr. MIKDAME Mohammed* Hématologie Clinique
Pr. MOHSINE Raouf Chirurgie Générale
Pr. NOUINI Yassine Urologie Directeur Hôpital Ibn Sina
Pr. SABBAH Farid Chirurgie Générale
Pr. SEFIANI Yasser Chirurgie Vasculaire Périphérique
Pr. TAOUFIQ BENCHEKROUN Soumia Pédiatrie
Décembre 2002
Pr. AL BOUZIDI Abderrahmane* Anatomie Pathologique
Pr. AMEUR Ahmed * Urologie
Pr. AMRI Rachida Cardiologie
Pr. AOURARH Aziz* Gastro-Entérologie
Pr. BAMOU Youssef * Biochimie-Chimie
Pr. BELMEJDOUB Ghizlene* Endocrinologie et Maladies Métaboliques
Pr. BENZEKRI Laila Dermatologie
Pr. BENZZOUBEIR Nadia Gastro-Entérologie
Pr. BERNOUSSI Zakiya Anatomie Pathologique
Pr. CHKIRATE Bouchra Pédiatrie
Pr. EL ALAMI EL FELLOUS Sidi Zouhair Chirurgie Pédiatrique
Pr. EL HAOURI Mohamed * Dermatologie
Pr. FILALI ADIB Abdelhai Gynécologie Obstétrique
Pr. HAJJI Zakia Ophtalmologie
Pr. IKEN Ali Urologie
Pr. JAAFAR Abdeloihab* Traumatologie Orthopédie
Pr. KRIOUILE Yamina Pédiatrie
Pr. LAGHMARI Mina Ophtalmologie
Pr. MABROUK Hfid* Traumatologie Orthopédie
Pr. MOUSSAOUI RAHALI Driss* Gynécologie Obstétrique
Pr. OUJILAL Abdelilah Oto-Rhino-Laryngologie
Pr. RACHID Khalid * Traumatologie Orthopédie
Pr. RAISS Mohamed Chirurgie Générale
Pr. RGUIBI IDRISSI Sidi Mustapha* Pneumophtisiologie
Pr. RHOU Hakima Néphrologie
Pr. SIAH Samir * Anesthésie Réanimation
Pr. THIMOU Amal Pédiatrie
Pr. ZENTAR Aziz* Chirurgie Générale
Janvier 2004
Pr. ABDELLAH El Hassan Ophtalmologie
Pr. AMRANI Mariam Anatomie Pathologique
Pr. BENBOUZID Mohammed Anas Oto-Rhino-Laryngologie
Pr. BENKIRANE Ahmed* Gastro-Entérologie
Pr. BOUGHALEM Mohamed* Anesthésie Réanimation
Pr. BOULAADAS Malik Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale
Pr. BOURAZZA Ahmed* Neurologie
Pr. CHAGAR Belkacem* Traumatologie Orthopédie
Pr. CHERRADI Nadia Anatomie Pathologique
Pr. EL FENNI Jamal* Radiologie
Pr. EL HANCHI ZAKI Gynécologie Obstétrique
Pr. EL KHORASSANI Mohamed Pédiatrie Pr. EL YOUNASSI Badreddine* Cardiologie
Pr. HACHI Hafid Chirurgie Générale
Pr. JABOUIRIK Fatima Pédiatrie
Pr. KHARMAZ Mohamed Traumatologie Orthopédie
Pr. MOUGHIL Said Chirurgie Cardio-Vasculaire
Pr. OUBAAZ Abdelbarre* Ophtalmologie
Pr. TARIB Abdelilah* Pharmacie Clinique
Pr. TIJAMI Fouad Chirurgie Générale
Pr. ZARZUR Jamila Cardiologie
Janvier 2005
Pr. ABBASSI Abdellah Chirurgie Réparatrice et Plastique
Pr. AL KANDRY Sif Eddine* Chirurgie Générale
Pr. ALLALI Fadoua Rhumatologie
Pr. AMAZOUZI Abdellah Ophtalmologie
Pr. BARKAT Amina Pédiatrie
Pr. BENYASS Aatif Cardiologie
Pr. BERNOUSSI Abdelghani Ophtalmologie
Pr. DOUDOUH Abderrahim* Biophysique
Pr. EL HAMZAOUI Sakina* Microbiologie
Pr. HAJJI Leila Cardiologie (mise en disponibilité)
Pr. HESSISSEN Leila Pédiatrie
Pr. JIDAL Mohamed* Radiologie
Pr. LAAROUSSI Mohamed Chirurgie Cardio-vasculaire
Pr. LYAGOUBI Mohammed Parasitologie
Pr. NIAMANE Radouane* Rhumatologie
Pr. RAGALA Abdelhak Gynécologie Obstétrique
Pr. SBIHI Souad Histo-Embryologie Cytogénétique
Pr. ZERAIDI Najia Gynécologie Obstétrique
Décembre 2005 Pr. CHANI Mohamed Anesthésie Réanimation
Avril 2006
Pr. ACHEMLAL Lahsen* Rhumatologie
Pr. AKJOUJ Said* Radiologie
Pr. BELMEKKI Abdelkader* Hématologie
Pr. BENCHEIKH Razika O.R.L
Pr. BIYI Abdelhamid* Biophysique
Pr. BOUHAFS Mohamed El Amine Chirurgie - Pédiatrique Pr. BOULAHYA Abdellatif* Chirurgie Cardio – Vasculaire Pr. CHENGUETI ANSARI Anas Gynécologie Obstétrique
Pr. DOGHMI Nawal Cardiologie
Pr. FELLAT Ibtissam Cardiologie
Pr. FAROUDY Mamoun Anesthésie Réanimation
Pr. HARMOUCHE Hicham Médecine Interne
Pr. HANAFI Sidi Mohamed* Anesthésie Réanimation
Pr. IDRISS LAHLOU Amine* Microbiologie
Pr. JROUNDI Laila Radiologie
Pr. KARMOUNI Tariq Urologie
Pr. KILI Amina Pédiatrie
Pr. KISRA Hassan Psychiatrie
Pr. KISRA Mounir Chirurgie – Pédiatrique
Pr. LAATIRIS Abdelkader* Pharmacie Galénique
Pr. LMIMOUNI Badreddine* Parasitologie
Pr. MANSOURI Hamid* Radiothérapie
Pr. OUANASS Abderrazzak Psychiatrie
Pr. SAFI Soumaya* Endocrinologie
Pr. SEKKAT Fatima Zahra Psychiatrie
Pr. SOUALHI Mouna Pneumo – Phtisiologie
Pr. TELLAL Saida* Biochimie
Pr. ZAHRAOUI Rachida Pneumo – Phtisiologie
Octobre 2007
Pr. AIT HOUSSA Mahdi* Chirurgie cardio vasculaire
Pr. AMHAJJI Larbi* Traumatologie orthopédie
Pr. AOUFI Sarra Parasitologie
Pr. BAITE Abdelouahed* Anesthésie réanimation Directeur ERSM
Pr. BALOUCH Lhousaine* Biochimie-chimie
Pr. BENZIANE Hamid* Pharmacie clinique
Pr. BOUTIMZINE Nourdine Ophtalmologie
Pr. CHARKAOUI Naoual* Pharmacie galénique
Pr. EHIRCHIOU Abdelkader* Chirurgie générale
Pr. ELABSI Mohamed Chirurgie générale
Pr. EL MOUSSAOUI Rachid Anesthésie réanimation
Pr. EL OMARI Fatima Psychiatrie
Pr. GHARIB Noureddine Chirurgie plastique et réparatrice
Pr. HADADI Khalid* Radiothérapie
Pr. ICHOU Mohamed* Oncologie médicale
Pr. ISMAILI Nadia Dermatologie
Pr. KEBDANI Tayeb Radiothérapie
Pr. LALAOUI SALIM Jaafar* Anesthésie réanimation
Pr. LOUZI Lhoussain* Microbiologie
Pr. MADANI Naoufel Réanimation médicale
Pr. MAHI Mohamed* Radiologie
Pr. MARC Karima Pneumo phtisiologie
Pr. MASRAR Azlarab Hématologie biologique
Pr. MRABET Mustapha* Médecine préventive santé publique et hygiène
Pr. MRANI Saad* Virologie
Pr. OUZZIF Ez zohra* Biochimie-chimie
Pr. RABHI Monsef* Médecine interne
Pr. RADOUANE Bouchaib* Radiologie
Pr. SEFFAR Myriame Microbiologie
Pr. SEKHSOKH Yessine* Microbiologie
Pr. SIFAT Hassan* Radiothérapie
Pr. TABERKANET Mustafa* Chirurgie vasculaire périphérique
Pr. TACHFOUTI Samira Ophtalmologie
Pr. TAJDINE Mohammed Tariq* Chirurgie générale
Pr. TANANE Mansour* Traumatologie orthopédie
Pr. TLIGUI Houssain Parasitologie
Pr. TOUATI Zakia Cardiologie
Décembre 2007
Pr. DOUHAL ABDERRAHMAN Ophtalmologie
Décembre 2008
Pr. ABOUZAHIR Ali* Médecine interne
Pr. AGDR Aomar* Pédiatre
Pr. AIT ALI Abdelmounaim* Chirurgie Générale
Pr. AIT BENHADDOU El hachmia Neurologie
Pr. AKHADDAR Ali* Neuro-chirurgie
Pr. ALLALI Nazik Radiologie
Pr. AMINE Bouchra Rhumatologie
Pr. ARKHA Yassir Neuro-chirurgie
Pr. BELYAMANI Lahcen* Anesthésie Réanimation
Pr. BJIJOU Younes Anatomie
Pr. BOUHSAIN Sanae* Biochimie-chimie
Pr. BOUI Mohammed* Dermatologie
Pr. BOUNAIM Ahmed* Chirurgie Générale
Pr. BOUSSOUGA Mostapha* Traumatologie orthopédique
Pr. CHAKOUR Mohammed * Hématologie biologique
Pr. CHTATA Hassan Toufik* Chirurgie vasculaire périphérique
Pr. DOGHMI Kamal* Hématologie clinique
Pr. EL MALKI Hadj Omar Chirurgie Générale
Pr. EL OUENNASS Mostapha* Microbiologie
Pr. ENNIBI Khalid* Médecine interne
Pr. FATHI Khalid Gynécologie obstétrique
Pr. HASSIKOU Hasna * Rhumatologie
Pr. KABBAJ Nawal Gastro-entérologie
Pr. KABIRI Meryem Pédiatrie
Pr. KARBOUBI Lamya Pédiatrie
Pr. L’KASSIMI Hachemi* Microbiologie Directeur Hôpital My Ismail
Pr. LAMSAOURI Jamal* Chimie Thérapeutique
Pr. MARMADE Lahcen Chirurgie Cardio-vasculaire
Pr. MESKINI Toufik Pédiatrie
Pr. MESSAOUDI Nezha * Hématologie biologique
Pr. MSSROURI Rahal Chirurgie Générale
Pr. NASSAR Ittimade Radiologie
Pr. OUKERRAJ Latifa Cardiologie
Pr. RHORFI Ismail Abderrahmani * Pneumo-phtisiologie
PROFESSEURS AGREGES :
Octobre 2010
Pr. ALILOU Mustapha Anesthésie réanimation
Pr. AMEZIANE Taoufiq* Médecine interne
Pr. BELAGUID Abdelaziz Physiologie
Pr. BOUAITY Brahim* ORL
Pr. CHADLI Mariama* Microbiologie
Pr. CHEMSI Mohamed* Médecine aéronautique
Pr. DAMI Abdellah* Biochimie chimie
Pr. DARBI Abdellatif* Radiologie
Pr. DENDANE Mohammed Anouar Chirurgie pédiatrique
Pr. EL HAFIDI Naima Pédiatrie
Pr. ERRABIH Ikram Gastro entérologie
Pr. LAMALMI Najat Anatomie pathologique
Pr. MOSADIK Ahlam Anesthésie Réanimation
Pr. MOUJAHID Mountassir* Chirurgie générale
Pr. NAZIH Mouna* Hématologie biologique
Pr. ZOUAIDIA Fouad Anatomie pathologique
Mai 2012
Pr. AMRANI Abdelouahed Chirurgie Pédiatrique
Pr. ABOUELALAA Khalil* Anesthésie Réanimation
Pr. BELAIZI Mohamed* Psychiatrie
Pr. BENCHEBBA Driss* Traumatologie Orthopédique
Pr. DRISSI Mohamed* Anesthésie Réanimation
Pr. EL ALAOUI MHAMDI Mouna Chirurgie Générale
Pr. EL KHATTABI Abdessadek* Médecine Interne
Pr. EL OUAZZANI Hanane* Pneumophtisiologie
Pr. ER-RAJI Mounir Chirurgie Pédiatrique
Pr. JAHID Ahmed Anatomie pathologique
Pr. MEHSSANI Jamal* Psychiatrie
Pr. RAISSOUNI Maha* Cardiologie
Février 2013
Pr. AHID Samir Pharmacologie – Chimie
Pr. AIT EL CADI Mina Toxicologie
Pr. AMRANI HANCHI Laila Gastro-Entérologie
Pr. AMOUR Mourad Anesthésie Réanimation
Pr. AWAB Almahdi Anesthésie Réanimation
Pr. BELAYACHI Jihane Réanimation Médicale
Pr. BELKHADIR Zakaria Houssain Anesthésie Réanimation
Pr. BENCHEKROUN Laila Biochimie-Chimie
Pr. BENKIRANE Souad Hématologie biologique
Pr. BENNANA Ahmed* Informatique Pharmaceutique
0.
Pr. BENSGHIR Mustapha* Anesthésie Réanimation
Pr. BENYAHIA Mohammed* Néphrologie
Pr. BOUATIA Mustapha Chimie Analytique
Pr. BOUABID Ahmed Salim* Traumatologie Orthopédie
Pr. BOUTARBOUCH Mahjouba Anatomie
Pr. CHAIB Ali* Cardiologie
Pr. DENDANE Tarek Réanimation Médicale
Pr. DINI Nouzha* Pédiatrie
Pr. ECH-CHERIF EL KETTANI Mohamed Ali Anesthésie Réanimation Pr. ECH-CHERIF EL KETTANI Najwa Radiologie
Pr. ELFATEMI Nizare Neuro-Chirurgie
Pr. EL GUERROUJ Hasnae Médecine Nucléaire
Pr. EL KABABRI Maria Pédiatrie
Pr. EL KHANNOUSSI Basma Anatomie Pathologie
Pr. EL KHLOUFI Samir Anatomie
Pr. EL KORAICHI Alae Anesthésie Réanimation
Pr. EN-NOUALI Hassane* Radiologie
Pr. ERRGUIG Laila Physiologie
Pr. FIKRI Meryim Radiologie
Pr. GHFIR Imade Médecine Nucléaire
Pr. IMANE Zineb Pédiatrie
Pr. IRAQI Hind Endocrinologie et maladies métaboliques
Pr. KABBAJ Hakima Microbiologie
Pr. KADIRI Mohamed* Psychiatrie
Pr. LATIB Rachida Radiologie
Pr. MAAMAR Mouna Fatima Zahra Médecine Interne
Pr. MEDDAH Bouchra Pharmacologie
Pr. MELHAOUI Adyl Neuro-chirurgie
Pr. MRABTI Hind Oncologie Médicale
Pr. NEJJARI Rachid Pharmacognosie
Pr. OUBEJJA Houda Chirurgie Pédiatrique
Pr. OUKABLI Mohamed* Anatomie Pathologique
Pr. RAHALI Younes Pharmacie Galénique
Pr. RATBI Ilham Génétique
Pr. RAHMANI Mounia Neurologie
Pr. REDA Karim* Ophtalmologie
Pr. REGRAGUI Wafa Neurologie
Pr. RKAIN Hanan Physiologie
Pr. ROSTOM Samira Rhumatologie
Pr. ROUAS Lamiaa Anatomie Pathologique
Pr. ROUIBAA Fedoua* Gastro-Entérologie
Pr. SALIHOUN Mouna Gastro-Entérologie
Pr. SAYAH Rochde Chirurgie Cardio-Vasculaire
Pr. SEDDIK Hassan* Gastro-Entérologie
Pr. ZERHOUNI Hicham Chirurgie Pédiatrique
Pr. ZINE Ali* Traumatologie Orthopédie
Avril 2013
Pr. EL KHATIB Mohamed Karim* Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale
Pr. GHOUNDALE Omar* Urologie
Pr. ZYANI Mohammad* Médecine Interne
MARS 2014
ACHIR ABDELLAH Chirurgie Thoracique
BENCHAKROUN MOHAMMED Traumatologie- Orthopédie
BOUCHIKH MOHAMMED Chirurgie Thoracique
EL KABBAJ DRISS Néphrologie
EL MACHTANI IDRISSI SAMIRA Biochimie-Chimie
HARDIZI HOUYAM Histologie- Embryologie-Cytogénétique
HASSANI AMALE Pédiatrie
HERRAK LAILA Pneumologie
JANANE ABDELLA TIF Urologie
JEAIDI ANASS Hématologie Biologique
KOUACH JAOUAD Génécologie-Obstétrique
LEMNOUER ABDELHAY Microbiologie
MAKRAM SANAA Pharmacologie
OULAHYANE RACHID Chirurgie Pédiatrique
RHISSASSI MOHAMED JMFAR CCV
SABRY MOHAMED Cardiologie
SEKKACH YOUSSEF Médecine Interne
TAZL MOUKBA. :LA.KLA. Génécologie-Obstétrique
*
Enseignants MilitairesDECEMBRE 2014
ABILKACEM RACHID' Pédiatrie
AIT BOUGHIMA FADILA Médecine Légale
BEKKALI HICHAM Anesthésie-Réanimation
BENAZZOU SALMA Chirurgie Maxillo-Faciale
BOUABDELLAH MOUNYA Biochimie-Chimie
BOUCHRIK MOURAD Parasitologie
DERRAJI SOUFIANE Pharmacie Clinique
DOBLALI TAOUFIK Microbiologie
EL AYOUBI EL IDRISSI ALI Anatomie
EL GHADBANE ABDEDAIM HATIM Anesthésie-Réanimation
EL MARJANY MOHAMMED Radiothérapie
FE]JAL NAWFAL Chirurgie Réparatrice et Plastique
JAHIDI MOHAMED O.R.L
LAKHAL ZOUHAIR Cardiologie
OUDGHIRI NEZHA Anesthésie-Réanimation
Rami Mohamed Chirurgie Pédiatrique
SABIR MARIA Psychiatrie
AOUT 2015
Meziane meryem Dermatologie
Tahri latifa Rhumatologie
JANVIER 2016
BENKABBOU AMINE Chirurgie Générale
EL ASRI FOUAD Ophtalmologie
ERRAMI NOUREDDINE O.R.L
NITASSI SOPHIA O.R.L
2- ENSEIGNANTS – CHERCHEURS SCIENTIFIQUES
PROFESSEURS / PRs. HABILITES
Pr. ABOUDRAR Saadia Physiologie
Pr. ALAMI OUHABI Naima Biochimie – chimie
Pr. ALAOUI KATIM Pharmacologie
Pr. ALAOUI SLIMANI Lalla Naïma Histologie-Embryologie
Pr. ANSAR M’hammed Chimie Organique et Pharmacie Chimique
Pr. BOUHOUCHE Ahmed Génétique Humaine
Pr. BOUKLOUZE Abdelaziz Applications Pharmaceutiques
Pr. BOURJOUANE Mohamed Microbiologie
Pr. CHAHED OUAZZANI Lalla Chadia Biochimie – chimie
Pr. DAKKA Taoufiq Physiologie
Pr. DRAOUI Mustapha Chimie Analytique
Pr. EL GUESSABI Lahcen Pharmacognosie
Pr. ETTAIB Abdelkader Zootechnie
Pr. FAOUZI Moulay El Abbes Pharmacologie
Pr. HAMZAOUI Laila Biophysique
Pr. HMAMOUCHI Mohamed Chimie Organique
Pr. IBRAHIMI Azeddine Biologie moléculaire
Pr. KHANFRI Jamal Eddine Biologie
Pr. OULAD BOUYAHYA IDRISSI Med Chimie Organique
Pr. REDHA Ahlam Chimie
Pr. TOUATI Driss Pharmacognosie
Pr. ZAHIDI Ahmed Pharmacologie
Pr. ZELLOU Amina Chimie Organique
Mise à jour le 14/12/2016 par le
ﻢﻴﻈﻋو ﻚ ﺟو لﻼ
ﺒ ﻳ ﺎﻤﻛ ﺪﻤ ا ﻚﻟ ﻢ ﻠﻟا
ﻚﻧﺎﻄﻠﺳ
A ma très chère mère SOUAD EL AKKADE
La fleur de ma vie, la plus tendre et la plus merveilleuse des mamans.
C’est à travers votre encouragement que je me suis réalisée et arrivée à
ce niveau.
Votre prière et votre bénédiction m’ont été d’un grand secours.
Je ne vous remercierai jamais assez pour tous les sacrifices que vous
avez faits pour moi.
J’espère pouvoir répondre à vos attentes et de pouvoir être à la hauteur
de l’espoir que vous avez fondé en moi et que je réussirai aujourd’hui à
réaliser l’un de vos rêves.
Que dieu vous préserve
A mon très cher père AHMED ZINEDDINE
J’aimerai vous exprimer ma gratitude et ma reconnaissance. Vous
m’avez offert tous ce que vous pouvez. Ce travail est le fruit des sacrifices,
efforts et prières que vous m’avez offerts.
Puisse dieu vous protège et vous accorde une meilleure santé et une
longue vie
A mes très chers frères SAAD et TAHA
Mes chers frères vous étiez présents dans tous mes moments difficiles
par votre soutien moral, bel esprit et sens d’humeur
Je vous souhaite un avenir plein de joie, de bonheur, de réussite et de
sérénité
Que l’amour et la fraternité nous unissent à jamais
Que dieu vous protège
A toute ma grande famille
Veuillez trouver dans ce travail l’expression de mon affection la plus
sincère et mon respect le plus profond
A mes chères amies
Salwa yahyawi, Meryam touima, Kenza Hanan, Soraya Bouhairi, Meryem
Hejaji , Najoua Sefiani, Hanae berahou, Jihan Benamran, Amal Zahir,
Ilham Zardoud, Majdi Amina et Fatima Toulali
Imane karam et Hanane karam
Aucun mot ne saurait exprimer mes sentiments de considération et de
reconnaissance envers votre soutien et vos encouragements le long de mes
études
Vous avez toujours été des amies attentives et fidèles, et des
camarades serviables et marrants
Je vous souhaite santé, bonheur et prospérité
A ma très chère amie Zainab Hamouch
Votre aide, votre générosité et votre soutien ont été pour moi une
source de courage et de confiance
En témoignage de l’affection, l’amour et l’attachement que je porte
pour vous et ta famille, je dédie cettethèse à vous tous.
Je prie dieu qu’il vous apporte bonheur et qu’il vous aide à réaliser tous
vos vœux
A mon professeur TAGHZOUTI
Votre aide, orientation conseils et formation m’ont beaucoup aidé pour
choisir mon parcours
Merci énormément pour le cycle de préparation au concours de la
pharmacie pour l’année 2012 que vous avez organisé, aucun mot ne peut
exprimer ma reconnaissance.
Vos compétences, votre dynamisme ainsi que vos qualités humaines et
professionnelles exemplaires ont toujours suscité notre admiration.
Qu’il soit permis, cher maître, de vous exprimer mes sincères
reconnaissances et mon grand respect
A ma chère Mme Latifa Bouyermaouen mon coach et professeur
Votre douceur ,votre soutien et vos conseilles m’ont toujours
accompagné.
A mes coachs Mr Jamal Eddine SDIDDI et Mr Hodaifa ALOMQI
Vos formations, vos conseils et votre confiance ont influencé ma vie.
Je vous remercie énormément
A moi-même :
Merci pour l’effort, la patience, l’esprit positif et l’encouragement.
A tous ceux que j’aime et à toute personne qui m’avez soutenu de près ou de
loin et que j’ai omis de citer involontairement
A notre maître et Président de thèse
Pr Mimoun ZOUHDI
Professeur de microbiologie
Nous vous remercions pour le grand honneur que vous nous faites en
acceptant de présider cette thèse.
Votre amabilité et votre modestie me marque toujours. Veuillez
trouver dans ce travail l’expression de mes vifs remerciements et mon
respect, tout en espérant être à la hauteur de vos attentes.
A notre maître et rapporteur de thèse
Pr Yassine SEKHSOKH
Professeur de microbiologie
Vous m’avez fait l’honneur de me confier ce travail riche et de me
guider dans sa réalisation.
Je vous remercie énormément pour votre proposition, disponibilité et le
bon accueil malgré vos engagements professionnels
Je saisie cette occasion pour vous exprimer ma profonde gratitude tout
en témoignant mon respect
A notre maître et juge de thèse
Pr Sakina EL HAMZAOUI
Professeur de microbiologie
Nous gardons de vous un souvenir d'un enseignant remarquable par sa
modestie, sa rigueur et son sérieux dans l'exercice de sa profession.
Vous me faites un grand honneur en acceptant de siéger parmi le jury
de ce travail
Veuillez trouver dans ce travail, l’expression de mon profond respect et
mes vifs remerciements
A notre maître et juge de thèse
Pr Mona NAZIH
Professeur d’hématologie
Nous avons le privilège et l'honneur de vous avoir parmi les membres
de notre jury.
Veuillez accepter nos remerciements et notre admiration pour vos
qualités d'enseignement et vos compétences .Veuillez croire, chère maître, à
l’assurance de notre respect et notre considération.
A notre maître et juge de thèse
Pr Meryama CHADLI
Professeur de Microbiologie
Nous avons l’honneur de vous compter parmi les membres du jury de
notre thèse dont vous avez accepté avec grande amabilité. Cet honneur nous
touche infiniment et nous tenons à vous exprimer nos sincères remerciements
et notre profond respect.
Abréviations
A. castellani :Acanthamoeba castellani .
A. polyphaga :Acanthamoeba polyphaga
ACMV :A. polyphaga moumouvirus.
ADNdb :AND double brin
ALM :Ace Lake mavirus;
APM ou APMV :Acanthamoeba polyphaga mimivirus
B. natans :Bigelowiella natans
C. roenbergensis :Cafeteria roenbergensis
CroV :Virus de la Cafeteria roenbergensis
cryoEM :Cryo-électronique
FAA : Zone d’acquisition des fibres
FISH : L’hybridation in situ en fluorescence
kb :Kilobases
Mb : Mégabases
mCP :Protéine de capside mineure
MCP :Protéine majeure de capside,
MGE : Les éléments génétiques mobiles
NCLDV :Virus nucléocytoplasmiques à grand ADN
Nombre :Nbre
OLV :Virophage de lac organique
ORFans :Les gènes paralogues qui codent pour des protéines de fonction inconnue
P. sibericum :Pithovirus sibericum
pDNAP ou ADNp :L'ADN polymérase
PgV :Virus Phaeocystis globosa
PgVV : Virophage du virus de Phaeocystis globosa
PgVV :Virophage Virus Phaeocystis globosa
pi :Post infection
RNV :Rio Negro virophage
RVE :Intégrase de type rétroviral
RVP :Virophage ruminal
TE :Elément transposable
TRUC :Things Resisting Uncompleted Classifications
TRUC :Things Resisting Uncompleted Classifications
Liste des figures
Figure 1 : Schéma d'un bref historique de la dénomination et de la définition des virus ...6 Figure 2 : Micro-organismes strictement intra-amibiens, observés en microscopie optique
après coloration de Gram. ...8
Figure 3 : Schéma de l'ordre chronologique de la découverte des principaux représentants des
virus géants de l'amibe et des virophages ... 10
Figure 4 : Principales caractéristiques spécifiques aux virus géants par rapport aux autres
virus ... 12
Figure 5 : Reconstruction phylogénique basée sur l’ADN polymérase B, représentant les
membres des NCLDV ... 17
Figure 6 : Reconstruction phylogénique basée sur l'ARN polymérase ARN dépendante des
représentants de Megavirales ... 18
Figure 7 : Morphologie des particules A : Mimivirus, B : Mollivirus, C : Pandoravirus, D :
Pithovirus. ... 20
Figure 8 : Micrographies électroniques de : a) Virus de Port-Miou (un marseillevirus encore
à classer), (b) faustovirus, (c) Megavirus chilensis, d) Mollivirus sibericum, e) Pandoravirus salinus, f) Pithovirus sibericum : ... 21
Figure 9 :Structure de l'APMV, les gènes de base et la relation des virus géants... 26 Figure 10 : Diversité des hôtes eucaryotes connus pour être infectés par des Mimiviridae. ... 30 Figure 11 : Particules du mamavirus géant (rouge) et virophages Sputnik (vert) . ... 32 Figue 12 : Coupe transversale à travers la carte cryoEM de sputnik. ... 34 Figure 13 : Reconstruction Cryo-EM du virion Sputnik. ... 35 Figure 14 : Infection de l' amibe Acanthamoeba castellanii avec à la fois le virus géant
mamavirus et le virophage Sputnik 1, après 16 h d'infection ... 35
Figure 16 : Micrographie au microscope électronique à coloration négative des particules de
mavirus ... 37
Figure 17 : Le génome de Zamilon, avec des séquences codantes prédites sur le brin avant
(bleu) et le brin inverse (rouge) ... 38
Figure 18 : Infection de l'amibe Acanthamoeba polyphaga avec à la fois le virus géant Mont1
et le virophage Zamilon, après 16 h d'infection ... 39
Figure 19 : Comparaison des architectures génétiques conservées dans les génomes de
virophages ... 43
Figure 20 : Relations entre virophages... 45 Figure 21 : Reconstruction phylogénique basée sur les protéines de capside des
virophages. ... 46
Figure 22 : Micrographies électroniques de : (A) Mimivirus; (B) Usine virale de Mimivirus
dans Acanthamoeba polyphaga ; (C) Marseillevirus; (D)Virophages; (E) Faustovirus; (F) Pandoravirus sp.. ... 47
Figure 23 : La classification génomique qui différencie les organismes codant pour la capside
(CEOs) et les organismes codant pour le ribosome (REOs) en plus de catégorie « autres » ... 52
Figure 24 : Arbre de vie simplifié ... 54 Figure 25 : Organisation du génome et contenu génétique des virophages et polintons ... 60 Figure 26 : Réseau évolutif représentant les relations entre les virophages, les polintons et les
transpovirons. Ce réseau comprend également au moins trois groupes distincts de virus, le NCLDV, les adénovirus et un assemblage de bactériophages. ... 61
Figure 27 : Premier scénario proposé avec deux cas de figure ... 63 Figure 28 : Deuxième scénario évolutif proposé... 64 Figure 29 : Tracé de la taille du virion et du génome à partir de représentants de virus géants
et de virophages d'amibes. ... 68
Figure 31 : Schéma représentatif du cycle de réplication du mimivirus ... 72 Figure 32 : Images en microscopie électronique à transmission de l’entrée de mimivirus dans
la cellule hôte par phagocytose et la décapsidation ... 73
Figure 33 : Images en microscopie électronique à transmission montrant les étapes de la
formation de particules de mimivirus, à mesure que ces particules croît en épaisseur et en complexité ... 74
Figure 34 : Images de microscopie électronique à transmission d'usines virales matures
indiquant l'incorporation du génome (flèches rouges) simultanée à l'acquisition de fibres (pointes de flèches violettes). ... 75
Figure 35 : Images en microscopie électronique à transmission (A-D) et en microscopie
électronique à balayage (E et F) de particules défectueuses dans le cycle de réplication du mimivirus en l'absence de virophages ... 76
Figure 36 : Modèle représentant les modes et les étapes de la co-infection par les
virophages ... 78
Figure 37 : Le cycle de vie intracellulaire des virophages... 79 Figure 38 : Ultrastructure des virons et du cycle de réplication des mimivirus M1, M2, M3 et
M4, en plus de l’électrophorèse de leur génome ... 81
Figure 39 : Micrographies électroniques de particules de Mimivirus M4 hydratées et
congelées ... 82
Figure 40 : Spoutnik avec les virus des différents groupes de Mimiviridae. ... 84 Figure 41: Croissance de Spoutnik 1 et 2 dans différents virus géants. ... 85 Figure 42: Image au microscope électronique à balayage du virus Samba et du virophage Rio
Negro ... 88
Figure 43 : Impact des virophage Zamilon et sputnik sur les virus géants et cellules hôtes. . 89 Figure 44 : Modèle d’intégration des éléments types virophages dans le génome Bigelowiella
Figure 45 : Virophage et CRISPR-Cas: deux formes non apparentées mais analogues
d'immunité acquise ... 94
Figure 46 : Modèles récapitulatifs d'infections et d'effets protecteurs dans la relation tripartite
cellule hôte-virus géant- virophage ... 95
Figure 47. Croissance de Zamilon chez les Mimiviridae . ... 96 Figure 48 : Carte qui représente les emplacements d'échantillons où les virus géants d'amibes
ont été isolés ou dans lesquels des lectures métagénomiques liées à ces virus ont été détectées . ... 103
Figure 49 : Distribution géographique et abondance des virophages ... 106 Figure 50 : Abondance des virophages dans différents environnements (A), profondeurs
océaniques (B) et latitudes (C) ... 107
Figure 51: Schéma indiquant les sites du corps humain pour lesquels des preuves de la
présence et le rôle pathogène des virus géants d’amibes ont été obtenues chez des personnes en bonne santé et chez des personnes malades. ... 110
Figure 52 : Cliché thoracique du technicien de laboratoire infecté par le Mimivirus, montrant
des infiltrats basilaires bilatéraux ... 111
Figure 53 : Les résultats de l'électrophorèse bidimensionnelle sur gel avec coloration à
l'argent (à gauche) et du Western blot (à droite) pour 3 échantillons de sérum provenant de patients ayant visité le Laos ... 115
Figure 54 : Schéma de la chronologie des principaux résultats qui soutiennent la présence et
le rôle pathogène possible chez l'homme de virus géants d'amibes ... 116
Figure 55 : Modèle de régulation de la dynamique des populations par les virophages ... 119 Figure 56 : Le creuset génétique de l'amibe produit des organismes aux génomes
chimériques. ... 120
Liste des tableaux
Tableau I : Les groupes proposés de l’ordre des Megavirales ... 19 Tableau II : Les principales caractéristiques des virus géants ... 19 Tableau III : Vue d'ensemble de la famille de Mimiviridae et des infections à virophage
expérimentales ... 28
Introduction ...1
I- Historique ...4 1- Concept et définition des virus aux XIXe et XXe siècles ...5 2- Emergence des virus géants ...7 3- Découverte des Virophages ...8 II- Caractères virologiques ... 11 1- Virus géants ... 12 1-1 Virion et taille du génome ... 13 1-2 Complexité ... 13 1-3 Mobilome ... 14 1-4 Monophylie ... 14 1-5 Large spectre d'hôtes ... 16 2- Famille des Mimiviridaes ... 22 2-1 Principales caractéristiques des mimiviridae ... 23 2-2 Description de l’APM ... 24 2-3 Description du CroV ... 27 3- Virophages ... 31 3-1 Virophages isolés ... 31 3-1-1 Isolats de Spoutnik : Sputnik, Sputnik2 et Suptnik3 ... 32 3-1-2 Mavirus ... 36
3-1-3 Zamilon ... 37
3-2-2 Virophage de Phaeocystis globosa : PgVV ... 40 3-2-3 Ace Lake Mavirus (ALM) ... 40 3-2-4 Virophages de Yellowstone Lake (YSLV): [15, 16, 23]... 40 3-2-5 Virophages hybrides(Hybrid virophages) ... 41 3-2-6 Zamilon 2 ... 41 3-2-7 Séquences de génomes de virophages intégrées dans le génome de Bigelowiella natans ... 41 3-2-8 Virophage de Dishui Lake (DSLV1) ... 41 3-2-9 Virophage de Qinghai Lake (QLV) [16, 21]... 42 3-2-10 Séquences codantes pour la capside de virophage trouvées dans les
métagénomes ... 42 3-3 Les Gènes conservés ... 42 3-4 Phylogénie des virophages ... 44 III- Position des virus géants et virophages dans le monde microbien ... 49 1- Microbes ... 50 2- Virus géants ... 51 2-1 Virus géants et monde des vivants ... 51 2-2 TRUC : Nouvelle classification des virus géants ... 53 3- Virophages ... 55 IV- Origines des virophages ... 57 1- Polintons ... 58 2- Virophages et Polintons ... 59 3- Origines des virophages : scenarios évolutifs ... 61 3-1 Premier scénario ... 62
V- Réplication ... 66 1- introduction ... 67 2- Cycle de réplication des mimivirus : ... 70 3- Cycle de réplication des virophages ... 77 3-1 Les modes de co-infection ... 77 3-2 Cycle réplicatif de sputnik ... 79 3-2-1 Entrée de Spoutnik dans l'Amibe ... 79 3-2-2 Virophages envahissent l'usine de virus géant ... 82 3-2-3 Propagation de la progéniture de virophages ... 83 3-3 Cycle réplicatif d'autres virophages ... 86 3-3-1 Zamilon ... 86 3-3-2 Mavirus ... 86 4- Effets des virophages sur le virus géant et la cellule hôte ... 87 5- Les provirophages ... 90 5-1 Découverte ... 90 5-2 Scénario d’intégration des provirophages dans la cellule hôte ... 91 5-3 Rôle des provirophages ... 93 6- Système mimivire ... 96 6-1 Système CRISPR ... 97 6-2 Mécanisme du système mimivire ... 97 VI- Distribution ... 99 1- Distribution des virus ... 100 2- Distribution des virus géants ... 100
3- Distribution des virophages ... 104 VII- Pouvoir pathogène ... 109 1- Pouvoir pathogène des virus géants d’amibes ... 110 2- Virus géants et les autres hôtes ... 113 3- Pouvoir pathogène des virophages ... 113 VIII Impacts des virophages et persepective ... 117 1-Impact des virophages ... 118 1-1 impact des virophages des virus géants amibiens ... 118 1-2 Impact des virophages des écosystèmes marins ... 121 2-Perspective ... 123
Conclusion ... 124 Résumés
Le monde des virus ne cessera jamais de nous étonner. Historiquement, les virus ont été étudiés principalement d'un point de vue médical et économique, cependant, les dernières décennies ont montré que les virus jouent des rôles beaucoup plus polyvalents qu’on peut imaginer.
Étant les entités biologiques les plus abondantes de la planète, les virus conduisent les cycles biogéochimiques à l'échelle globale, affectent la biodiversité et les structures communautaires de leurs hôtes et plus profondément ils ont influencé toute la vie cellulaire depuis le tout début et ils continuent à laisser leurs empreintes dans les génomes cellulaires [1].
L'une des plus grandes surprises de l'histoire virologique récente a été la découverte d'Acanthamoeba polyphaga mimivirus, en 2003 par des bactériologistes, qui est un virus géant associé aux amibes du genre Acanthamoeba. Plus de 10 ans après son isolement et sa classification initiale comme une bactérie parasite intracellulaire obligatoire des amibes du genre Acanthamoeba, la nature virale du mimivirus a été reconnue et par la suite d’autres virus géants ont été découverts [1-3].
Les virus géants sont des parasites obligatoires de plusieurs organismes, ils font partie du groupe des virus nucléocytoplasmiques à grand ADN et ils ont confronté la communauté scientifique par des caractéristiques jamais observées auparavant dans un virus, leur taille de virion et leur complexité génétique avec de nombreux gènes habituellement trouvés dans les cellules eucaryotes et procaryotes, ce qui a défié la définition classique des virus comme étant des agents infectieux «filtrables» et ce qui en résulte l’invalidation une fois pour toutes de la séparation entre les virus et les formes de vie cellulaires en fonction de la taille [4-12].
La vie de certains virus géants peut ne pas être toujours facile car ils peuvent eux-mêmes être la proie de minuscules virus, précédemment inconnu, qui agissent comme des parasites des virus géants appartenant à la famille des mimiviridae. Ces parasites surnommés «virophages», par analogie avec le terme bactériophage, sont de petits virus non enveloppés avec une capside icosaédrique d'environ 35 à 74 nm de diamètre et un génome d'ADN
double-unicellulaires avec des virus géants et de détourner la machinerie de réplication de ces derniers pour leur propre multiplication [1,3,8,9,13-15].
Sputnik présente le premier virophage découvert, par la suite d’autres représentants ont été décrits principalement dans les données métagénomiques et ils ont été classés dans une nouvelle famille virale « Lavidaviridae » [8,16].
La découverte accidentelle de virus géants puis des virophages a conduit à un changement des bases de la virologie. Dans notre revue nous visons à :
Rappeler les principales caractéristiques des virus géants et des virophages. Mettre en évidence leurs cycles de réplication, origines potentielles,
1- Concept et définition des virus aux XIXe et XXe siècles :
Pendant longtemps, le concept de «virus» a été embrouillé (figure1) [11].
Les virus ont été décrits pour la première fois à la fin du XIXe siècle comme des agents infectieux ultrafiltrables et submicroscopiques [3].
Leur description a été entamée par Pasteur, qui a découvert l’agent de la rage qu’il l’a considéré comme un microbe [11,17].
Entre 1886 et 1898, les bases de la virologie ont été posées avec la découverte des agents responsables de la mosaïque du tabac et des maladies de la fièvre aphteuse, ultrafiltrables et invisibles en microscope optique. En conséquence, ces agents ont été appelés ultravirus ou inframicrobes [11].
Au cours des années 1910-1920, les virus sont devenus de plus en plus établis comme de petites entités qui ont besoin de cellules vivantes pour se répliquer, de plus Rickettsia et Chlamydia (parasites intracellulaires) ne sont plus considérés comme des virus[11].
Au cours des années 1930-1940, les premières micrographies électroniques de virions ont été obtenues et la période d'éclipse de la réplication virale a été découverte [11].
Puis, au cours des années 1950, le concept de virus a été dévoilé par A. Lwoff, basé principalement sur des critères négatifs, y compris l'absence à la fois de l'ADN ou de l'ARN ou des composants de l'appareil de traduction [3,11].
Par conséquent, les virus ont été définis comme des molécules biologiques potentiellement pathogènes capables de passer à travers des filtres à pores de 0,2 μm et de rester invisibles au microscope optique, contrairement aux microbes[11,16,17].
Ainsi comme possédant un contenu génétique limité, un mode de vie strictement parasitaire avec un cycle réplicatif qui repose largement sur les protéines de l'hôte [3,11,16].
En raison de cet état d’esprit, les virus sont restés longtemps à la lisière du monde vivant avec un déni évident de l'existence de virus dont la taille serait suffisamment grande pour être résolue avec un simple microscope optique [4].
2- Emergence des virus géants :
Acanthamoeba polyphaga mimivirus (APM) a été isolé par hasard en 1992, à partir d'un échantillon d'eau prélevé en Angleterre d’une tour de refroidissement, suite à une enquête déclenchée par une épidémie de pneumonie en Angleterre. Son isolement a été réalisé par co-culture sur Acanthamoeba polyphaga : une stratégie de mise en œuvre principalement utilisée pour récupérer les pathogènes de type Legionella [3,4,18].
Les virions d’APM ont d'abord été confondus avec des bactéries car ils pouvaient être visualisés par microscopie optique et ressemblaient à des coccus Gram positif (figure 2). Après une décennie, seule l'absence d’ADN ribosomique et la visualisation de la capside icosaédrique par microscopie électronique dans la bactérie présumée a conduit à la découverte et la définition du premier virus géant en 2003 à Marseille « Mimivirus » pour souligner qu'ils étaient des virus imitant les microbes. Ce dernier a fondé la famille des Mimiviridae [3,4,18].
Suite à cette découverte, beaucoup d'autres virus géants ont été identifiés au cours des 12 dernières années (figure 3) [3,4,18,19] :
En 2007, un virus nommé Marseillevirus a été isolé sur biofilm à partir d'une tour de refroidissement près de Paris.
En 2010, Megavirus chilensis a été prélevé dans un échantillon d'eau de mer des côtes du Chili.
En 2013, le plus grand des virus géants découverts à ce jour, le Pandoravirus, a été retrouvé sur les rives du Chili et dans un étang de jardin en Australie.
Plus récemment, d’autres membres de virus géants ont été décrits, présentant des souches types de nouvelles familles de virus géants putatifs tels que Pithovirus
sibericum et Mollivirus sibericum qui ont été identifiés dans un pergélisol sibérien datant de
trente mille ans.
Figure 2 : Micro-organismes strictement intra-amibiens, observés en microscopie optique après
coloration de Gram [20].
A : Acanthamoeba polyphaga Mimivirus (anciennement appelé "le coccus de Bradford"). B : Parachlamydia acanthamoeba (anciennement appelé "coccus de Hall").
C : Legionella drancourtii.
3- Découverte des Virophages :
En 2008, La Scola et al ont décrit de petites particules virales inconnues d’environ 70 nm de diamètre observé en utilisant le microscope électronique dans le cytoplasme des cellules d’Acanthamoeba infectées par un mimivirus appelé Acanthamoeba polyphaga
mamavirus. Ce petit virus a été appelé Sputnik et classé comme virophage en raison de sa
similitude fonctionnelle aux bactériophages [3,4,6,16,21-24].
La découverte de sputnik a permis la découverte du premier virus infectant véritablement un autre virus après les découvertes successives depuis les années 1890 de virus d'eucaryotes, de bactéries et d'archées et la considération des virus comme un dernier niveau de parasitisme dans la nature vivante pendant des décennies [16,18,24].
Le second virophage « Mavirus » a été découvert en 2010 dans les eaux côtières des États-Unis avec le virus de la Cafeteria roenbergensis (CroV), un parent distant des Mimivirus qui parasite la Cafeteria roenbergensis (un flagellé phagotrophique marin) [6,16,21-25].
Trois autres virophages étroitement apparentés à Sputnik ont été isolés [3,16,22,23,26,27] :
Sputnik 2 a été décrit en 2012 avec un mimivirus appelé lentillevirus. Il a été isolé à partir du liquide de stockage de lentille de contact d'une jeune fille de 17 ans souffrant de la myopie et présentant une kératite.
Sputnik 3 a été isolé en 2013 avec un rapporteur mimivirus plutôt qu'avec son hôte viral naturel à partir d'une procédure de co-culture.
Sputnik Rio Negro a été isolé en 2014 en association avec un mimivirus appelé virus Samba en utilisant l'Acanthamoeba système.
Egalement en 2014 un nouveau virophage appelé zamilon (signifiant «un collègue» en arabe) a été découvert dans un échantillon de sol tunisien avec un mimivirus appelé virus Mont1 [3,4,22,23,28].
D’autres virophages ont été décrits principalement à partir de jeux de données métagénomiques à différents endroits et à partir de diverses sources, renforçant ainsi cette nouvelle classe [5,16].
Figure 3 : Schéma de l'ordre chronologique de la découverte des principaux représentants des virus
1- Virus géants :
La découverte des virus géants a contesté la définition classique d’un virus car ils présentent des caractéristiques phénotypiques et génotypiques uniques qui les différencient des virus «traditionnels» et les rapprochent de certains microbes ( figure 4 )[8,11,28,29].
Figure 4 : Principales caractéristiques spécifiques aux virus géants par rapport aux autres virus [11]. 2-Complexité c c cc 4-Mobilome 3-composants de traduction
1-Taille géante 5-Monophylie
6-Origine archaïque 7-Large spectre
1-1 Virion et taille du génome :
- Les virus géants sont simplement définis comme des particules virales suffisamment grandes pour être facilement observées sous un microscope optique, car leurs tailles se situent entre 0.2-1.5 μm (P. sibericum étant actuellement le plus grand) , intégrant un génome d'ADN double brin de plus d'un million de paires de bases (de 105 kpb pour Iridovirus à 2474 kpb pour Pandoravirus salinus ) et codant environ 1000 protéines [10,11,30,31].
- Leurs tailles de particule (2 à 15 fois plus grandes que les virus traditionnels) et de génomes sont comparables à celles des petites bactéries. Cela a conduit à considérer ces virus pendant longtemps comme une bactérie Gram positif et des endosymbiotes parasitaires, respectivement [3,11,32].
- Par conséquent, la découverte de ces derniers a défié la définition des virus comme étant des agents infectieux «filtrables» parce que leurs virions énormes ne passent pas à travers les filtres bactériens et invalident une fois pour toutes la séparation entre les virus et les formes de vie cellulaires en fonction de la taille [7,12].
1-2 Complexité :
- En plus de leur taille inhabituelle, les virus géants présentent une grande complexité génétique, avec la présence de certains gènes cellulaires universels [12].
- Les génomes contiennent entre 50 et 250 fois plus de gènes que les virus traditionnels, parmi lesquels de grandes proportions sont uniques parmi les virus et au moins la moitié ont des fonctions inconnues, en plus de plusieurs gènes similaires aux gènes cellulaires tels que ceux impliqués dans la réparation de l'ADN, la traduction, le repliement des protéines et la synthèse des polysaccharides [3,13,32].
- Les virus géants sont beaucoup moins dépendants de leur hôte pour la réplication que d'autres virus car ils codent pour un ensemble de protéines conservées qui interviennent dans la plupart des processus essentiels à la multiplication virale [11,33].
1-3 Mobilome
- Les éléments génétiques mobiles (MGE) collectivement appelés «mobilome» sont des acteurs clés de l'évolution du génome des procaryotes et des eucaryotes et sont considérés comme des «ingénieurs génétiques» de l'innovation biologique [34].
- Les MGE peuvent être grossièrement regroupées en quatre grandes classes : les éléments transposables, les plasmides, les virus et les éléments d'auto-épissage [34]
- Le mobilome pour de nombreuses bactéries, archaea et eucaryotes unicellulaires inclut tous ces éléments sous une forme libre ou intégrée [34].
- Étant donné que les virus constituent une partie du mobilome, ils ne sont normalement pas considérés comme possédant leur propre mobilome, mais la découverte des virophages a ajouté une nouvelle à la compréhension des relations existantes entre les différents éléments mobiles en démontrant pour la première fois qu'un virus géant pourrait être infecté par un autre virus beaucoup plus petit d'une manière similaire à l'infection virale des cellules [34].
Ce qui a permis de caractériser un mobilome propre des virus géants, chose inhabituel dans les virus classique [11].
Le mobilome des mimivirus comprend [11,16,34] : Plusieurs introns d’auto-épissage de groupe I et II.
Parfois des virus : les virophages soit sous forme libre (virions de virophages) ou intégrées ( provirophages).
Les transpovirons.
Un système de défense appelé MIMIVIRE.
1-4 Monophylie
- Selon le système de Baltimore, les virus géants sont placés parmi les virus nucléocytoplasmiques à grand ADN (NCLDV) qui présentent l’assemblage viral monophylétique le plus grand, le plus diversifié et le plus largement distribué [10,13,19,35,36].
- Les NCLDV, un groupe inventé en 2001, comprennent des virus avec des génomes allant de 100 kb à 2,5 Mb (indiquant que leur répertoire génomique est important comparé à d'autres virus à ADN et équivalent à celui de plusieurs bactéries parasitaires) et infectent un large éventail d'hôtes eucaryote [3,13,37,38].
- Tous les virus NCLDV sont unis par [3,12,32,37-39] :
La monophylie c'est-à-dire l’origine commune qui se manifeste par l'existence d'un grand ensemble de gènes ancestraux responsables des fonctions virales clés dont cinq sont trouvés dans la totalité de leurs génomes, à savoir ceux codant pour la protéine capside majeure, l'hélicase-primase (D5), ADN polymérase B, ATPase d’encapsidation A32 et le facteur 3 de transcription tardif viral et environ 50 gènes, bien que manquants dans certains NCLDV, ont été attribués, avec une grande confiance, à l'ancêtre commun du groupe entier.
l'architecture commune du virion.
(A part quelque exceptions tels que Pandoravirus et P. sibericum possédant une l'architecture différente de virion en plus de l’absence de la capside)
Les principales caractéristiques biologiques communes, en particulier la reproduction virale cytoplasmiques dans des compartiments spécialisés appelés usine virale.
- Les relations familiales entre les membres de la NCLDV sont représentées par la reconstruction phylogénétique des séquences de l' ADN polymérase B illustrées à la figure 5 [40].
- Les familles de NCLDV ont été proposées en 2012 pour être reclassées dans un nouvel ordre viral appelé Megavirales, qui se divisent en sept familles bien établies, en plus de certains virus restés non classer tels que pandoravirus et P. sibericum, et se propagent dans les organismes de trois des cinq supergroupes eucaryotes, àsavoir Archaeplastida, Chromalveolata et Uniconta [3,11,12,22,35,37,39,41,42].
- Les sept familles de l’ordres des megavirales suggérés sont [35,37,39]:
Ascoviridae , Asfarviridae , Iridoviridae , Marseilleviridae , Mimiviridae , Phycodnaviridae et
- Il existe une différence entre les virus géants et les autres membres des NLCDV, car en plus des génomes de grandes tailles qui se présentent chez les NCLDV, les virus géants se caractérisent par leur visibilité sous microscope optique. De plus, il a été démontré que la corrélation entre la taille des virions et celle des génomes qu’ils transportent est loin d’être absolue [2].
- Les virus géants correspondent aujourd’hui à 4 familles distinctes dont les prototypes sont Mimivirus, Pandoravirus salinus, Pithovirus sibericum et Mollivirus sibericum. En plus de deux autres familles dont les prototypes sont Marseillevirus et Faustovirus qui sont considérés à la limite du critère de visibilité [2].
1-5 Large spectre d'hôtes :
- Les virus géants infectent un large éventail d'hôtes cellulaires appartenant à des groupes phylogénétiquement très éloignés, notamment les invertébrés, les amibes, les algues vertes et les mammifères [11].
- Néanmoins, les amibes sont susceptibles d'être des hôtes naturels communs pour les mimivirus et les virophages [6].
En plus de ces caractéristiques, d’autres sont présentes telles que la présence de composants de traduction et l’origine archaïque de ce groupe de virus [11].
Figure 5 : Reconstruction phylogénique basée sur l’ADN polymérase B, représentant les
membres des NCLDV [40].
Les tailles de génome viral sont données lorsqu'elles sont disponibles. Les hexagones rouges indiquent des virophages associés à certains virus géants.
Figure 6 : Reconstruction phylogénique basée sur l'ARN polymérase ARN dépendante des
Tableau I : Les groupes proposés de l’ordre des Megavirales [12,24] :
Familles / Membres Taille de génome (kb) Hôte
Poxviridae 130–375 Animaux
Asfarviridae 165–190 Mammifères, protistes
Iridoviridae 140–303 Animaux, protistes
Ascoviridae 150–190 Insectes
Marseilleviridae 346–386 Amibe
Phycodnaviridae 154–407 Algue, autres protistes
Mimiviridae 370–1.259 Amibe, algue, autres protistes
Pandoraviruse 1.908–2.473 Amibe
Pithovirus 600 Amibe
Tableau II : Les principales caractéristiques des virus géants [2, 3] :
Famille/Nom Hôte G+C % Génome Taille Type Protéines Virion Forme Taille Mode d’infection Relargage des virions Mimiviridae Acanthamoeba 28 ≈ 1,2 Mb dsADN linéaire
≈ 1 000 Icosaèdre 750 nm Phagocytose Lyse Pandoraviridae Acanthamoeba 62-64 1,9-2,8 Mb dsADN linéaire ≈ 2 550 Amphore 500 nm x 1 200 nm Phagocytose Lyse et exocytose Pithovirus Acanthamoeba 36 610 kb ADN circulaire ≈ 465 Amphore 500 nm x 1 500 nm Phagocytose Exocytose Mollivirus Acanthamoeba 60 651 kb ADN linéaire
≈ 520 Sphère 600 nm Phagocytose Exocytose Marseilleviridae Acanthamoeba 43 ≈ 350
kb
ADN circulaire
≈ 400 Icosaèdre 200 nm Phagocytose Bourgeo-nnement en saccules Faustovirus Vermamoeba 36,2 466 kb ADN circulaire
Figure 7 : Morphologie des particules A : Mimivirus, B : Mollivirus, C : Pandoravirus, D : Pithovirus [2].
1. Vues en microscopie optique (x63, Nomarski). La barre d’échelle mesure 2 μm. 2. Vues en microscopie électronique à balayage. La barre d’échelle mesure 100 nm.
Figure 8 : Micrographies électroniques de : a) Virus de Port-Miou (un marseillevirus encore à
classer), (b) faustovirus, (c) Megavirus chilensis, d) Mollivirus sibericum, e) Pandoravirus salinus,
f) Pithovirus sibericum [40].