The Comptes rendus Palevol also publishes neontological, evolutionary studies

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neontological, evolutionary studies

Michel Laurin

To cite this version:

Michel Laurin. The Comptes rendus Palevol also publishes neontological, evolutionary studies.

Comptes Rendus Palevol, Elsevier, 2016, �10.1016/j.crpv.2016.10.001�. �hal-01409000�

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Comptes Rendus Palevol

www . s c ie n c e d i r e c t . c o m

The Comptes rendus Palevol also publishes neontological, evolutionary studies

Les Comptes rendus Palevol publient aussi des études néontologiques évolutives

Éditorial

Certainslecteursseront surprisderemarquerquece fasciculeinclutunarticlepurementnéontologique(Smith etal.,2017).Enfait,s’ils s’aventurentàparcourirdivers fasciculesantérieurs,ilsremarquerontquelesC.R.Palevol ontrégulièrementpubliédesarticlesavecpeuoupasde contenupaléontologique(Fig.1),spécialementdansdes fascicules thématiques(e.g.,Laurin et Cubo,2016).Ceci nerésultepasd’unrelâchementpériodiquedenotrepoli- tiqueéditoriale.Aucontraire,ledomainedesC.R.Palevol fut conc¸u dès l’origine commecomprenant à la fois la paléontologieetlabiologieévolutive,spécialement(mais pas exclusivement) la macroévolution. Ceci fut briève- ment expliquédans l’éditorialinauguralpubliédansles C. R. Palevol,dans lequel Dercourtet al. (2002)présen- tèrentdeuxnouvellessériesdeComptesrendus,Geoscience etPalevol,etexpliquèrentque«lasecondetraiteradela paléontologieetdessciencesdel’Évolution.»Ceciestjusti- fiéparlefaitqueleregistrefossilefournitdesinformations importantessurplusieursphénomènesévolutifs,comme lestendances(e.g.,Bokmaetal.,2016)etpatronsévolu- tifs,cesdernierscomprenantlesévénementsd’extinctions demasse(e.g.,ArensetWest,2008),lesradiationsévo- lutives (e.g.,Brusatte et al., 2011 ; de Wever et David, 2015), et lesmodèles évolutifs(e.g., Edlredge et Gould, 1972).Ilestdoncintéressantdeconfronterlesdonnées paléontologiquesetnéontologiquesportantsurlesmêmes questions.Deplus,lacompréhensionduprésentestlaclé d’unebonnecompréhensiondupassé,uneidéequifutpro- poséeparJamesHutton(1795)pourlagéologie,maisqui estégalementvraieencequiconcernelabiologie;ilserait impossibledebienreconstituerlesécosystèmesdupassé

Editorial

Somereaderswillbesurprisedtonoticethatthisissue includesapurelyneontologicalpaper(Smithetal.,2017).

Actually,byglancingatvariouspastissues,theywillnotice thatthejournalC.R.Palevolhasregularlypublishedpapers thathavelittleornopaleontologicalcontent(Fig.1),espe- ciallyinthematicissues(e.g.,LaurinandCubo,2016).Thisis nottheresultofanepisodicrelaxationofoureditorialpol- icy.Onthecontrary,thescopeoftheC.R.Palevolwasorig- inallyconceivedasencompassingbothpaleontologyand evolutionarybiology, especially(thoughnotexclusively) dealingwithmacroevolution. Thiswasbrieflyexplained intheinauguraleditorialpublishedintheC.R.Palevol,in whichDercourtetal.(2002)presentedtwonewseriesof theComptesrendus,GeoscienceandPalevol,andexplained that:“thelatterdealswithPalaeontologyandEvolutionary Sciences.”Thisisjustifiedbythefactthatthefossilrecord providescriticalinformationformanyevolutionaryphe- nomena,suchasevolutionarytrends(e.g.,Bokmaet al., 2016)andpatterns,encompassingmassextinctionevents (e.g.,ArensandWest,2008),evolutionaryradiations(e.g., Brusatteetal.,2011;deWeverandDavid,2015),andevolu- tionarymodels(e.g.,EldredgeandGould,1972).Thus,itcan beinterestingtoconfrontpaleontologicalandneontologi- caldatabearingonthesameissues.Equallyimportantisthe factthatunderstandingthepresentiskeytounderstanding thepast,anideathatwasproposedbyJamesHutton(1795) forgeology,butwhichisequallytrueofbiology;itwould beimpossibletoaccuratelyreconstructpastecosystems withouta thoroughknowledge of theextantones(e.g., Schultze,2009),andevenmuchsimplerquestionsconcern- ingthefunctionofastructureinanextinctorganismare http://dx.doi.org/10.1016/j.crpv.2016.10.001

1631-0683/©2016Acad ´emiedessciences.PublishedbyElsevierMassonSAS.ThisisanopenaccessarticleundertheCCBY-NC-NDlicense(http://

creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).

2 TheComptesrendusPalevolalsopublishesneontological,evolutionarystudies/C.R.Palevolxxx(2016)xxx–xxx

Fig.1.NumberofpaperscontaininglittleornopaleontologypublishedinregularandspecialissuesoftheC.R.Palevolovertheyears.Notethatmostsuch papershavebeenpublishedinspecialissues.

Fig.1. Nombred’articlescontenantpeuoupasdepaléontologiepubliésdansdesfasciculesréguliersouthématiquesdesC.R.Palevolaufildesans.Notez quelaplupartdecesarticlesontétépubliésdansdesfasciculesthématiques.

sansunebonneconnaissancedesécosystèmesactuels(e.g., Schultze,2009),etmêmedesquestionsbienplussimples ayanttraitàlafonctiondesstructuresdansdesorganismes éteintsdoiventidéalementêtreabordéesparl’étude du fonctionnementdecelles-cidanslestaxonsactuels(e.g., Pouydebatetal.,2008).

Malgré la parution régulière d’un nombre limité d’articlesnéontologiquesdanslesC.R.Palevoletl’énoncé explicitedesdomainescouvertsparlarevuedansDercourt etal.(2002),desconversationsavecplusieurscollèguesau fildesansrévélèrentqueplusieursd’entreeuxignoraient quedetelsarticlespouvaientyêtrepubliés.Cetéditorial tentededissipercetteidée.Commeonleverraci-dessous, plusieursdecesarticlesincluentunecourtesectionpaléo- biologique,maisd’autresn’encomportentpas;cetterevue couvrelesdeuxtypesd’articles.

Plusieurstypesd’articlesnéontologiquesfurentpubliés danslesC.R.Palevol.Certainsétablirentdescorrélations entre caractèrespouvant être observéschez des taxons actuels et éteints et d’autres, d’intérêt paléontologique mais typiquement non observables directement sur les fossiles.En utilisant cette méthode, Moine et Rousseau (2002)établirentunmodèled’inférencethermiquefondé surlesmollusquesterrestres,quileurpermitd’inférerles paléotempératuresdansledernierâgeglaciaire(130000à 10000ansBP)danslaséquenced’AchenheimenAlsace.

Naturellement,plusieurscontributionsnéontologiques décrivirent la morphologie, le développement ou l’histologie du squelette des vertébrés, incluant des humains (e.g., García Gil et al., 2016), souvent pour améliorerdes inférencespaléobiologiques (e.g.,Carayon etal.,2015).Cependant,d’autresabordèrentdesquestions fondamentales (et fascinantes) sur l’histologie osseuse, telles que les relations entre la densité et la surface deslogettes ostéocytaireset lataillecorporellechez les humains(Bromageetal.,2016),oul’enregistrementdela croissancedanslesosdesruminants(Jordanaetal.,2016) oudel’ânesauvaged’Asie(Nacarino-Menesesetal.,2016), sans tenter pour autant d’applications paléobiologiques

besttackledbystudyinghowsimilarstructuresworkin extanttaxa(e.g.,Pouydebatetal.,2008).

Despitetheregularpublicationofalimitednumberof neontologicalpapersintheC.R.Palevolandtheexplicit statementonthescopeof thejournal inDercourtetal.

(2002), informal conversations with several colleagues over the years have revealed that many of them were unawareofthefactthatsuchpaperscouldbepublished inthejournal.Thiseditorialattemptsatfixingthismiscon- ception.Aswillbeseenbelow,manysuchpapersincludea shortpaleobiologicalsection,butsomedonot;thissurvey includesbothkindsofpapers.

Severaltypesofneontologicalpapershavebeenpub- lished intheC.R.Palevol.Someestablishedcorrelations betweencharacters that can beobserved inextant and extinct taxa and other charactersof interest in paleon- tology,buttypicallyunobservableinfossils.Usingsucha method,MoineandRousseau(2002)establishedathermal inferencemodelbasedonterrestrialmollusksthatallowed themtoinferpaleotemperaturesinthelasticeage(130,000 to10,000yearsBP)intheAchenheimsequence(Alsace).

Naturally, many neontological papers described the morphology, development,function, or histologyof the skeleton of extant vertebrates, including humans (e.g., García Gil et al., 2016), often to improve paleobiologi- calinferences(e.g.,Carayonetal.,2015).However,others addressedbasic(yetfascinating)questionsonbonehis- tology,suchastherelationshipbetweenosteocytelacuna densityorareaandbodysizeinhumans(Bromageetal., 2016), or the growthrecord visible in extantruminant bones (Jordana et al.,2016)and in theAsiatic wildass (Nacarino-Menesesetal.,2016),withoutattemptingany immediatepaleontologicalapplication.Functionalpapers includeastudyoftherelationshipbetweentemporalmor- phologyandneckmotioninturtles(Werneburg,2015).

Otherpapersfocusedontheoreticalissuesandthehis- toryofscience.Thus,someparticipatedinadebateabout Darwin’s views about sexual selection and the strange structuresthatitcanproduceinsometaxa(Borkovicand

immédiates.Lesarticlesfonctionnelsincluentuneétude sur la relation entre la morphologie temporale et les mouvementsducouchezlestortues(Werneburg,2015).

D’autresarticlesportentsurdesquestionsthéoriques etl’histoire dessciences.Ainsi,certainsparticipèrentau débat sur lesopinions de Darwin au sujet de la sélec- tionsexuelleetdesstructuresétrangesqu’ellespeuvent produirechezcertainstaxons(BorkovicetRussell,2014; PadianetHorner,2014).Mêmesicedébatfutdéclenchépar unedifférenced’interprétationdestructurescrâniennesde dinosauresduMésozoïque,lesarticlessefocalisèrentsur desquestionsrelevantdelathéorieévolutiveplutôtque surdestaxonsspécifiques.Lathéorieetlapratiquedela phylogénétiquefurentégalementdiscutéesparquelques articles. Ainsi, Li (2013) a fourni un critère fondé sur lacohérencedesrésultatspourévaluerlesstratégiesde recherches d’arbres phylogénétiques. Même l’analyse à trois éléments, qui a généré d’intenses controverses, a étédiscutéedanslarevue(Zaragüeta-BagilsetBourdon, 2007;Zaragüeta-Bagilsetal.,2012).Ilsemblequenous ayonseuraisondepubliersurcetteméthodetropsouvent décriée,carlesdernièresétudesparsimulationsuggèrent qu’elle fonctionnemieuxque la parcimonienon ordon- néepourdesdonnéesintrinsèquementordonnées(Grand etal.,2013).Pourtant,laplupartdes étudesphylogéné- tiques récentesfondées surdes donnéesphénotypiques ontutilisé laparcimonienonordonnée,mêmepourdes donnéesintrinsèquementordonnées(Rineauetal.,2015, p.131).

Les contributions en biologie moléculaire et en génomique furent moins nombreuses. Parmi celles-ci, Damerval et Manuel (2003) décrivirent des duplica- tionsconvergentes defacteursdetranscription chezdes angiospermes, alors que Hernandez-Lopez et al. (2013) suggérèrentquelaphaseinitialedelaradiationévolutive desNeoavesfutcaractériséeparbeaucoupd’hybridation ouuntriincompletdeslignées.Sauquet(2013)afourni unexcellentguidepratiquesurlesméthodesdedatation moléculaire.

Cettebrèverevue estloind’êtreexhaustive ;ellene fournitquequelquesexemplespourmontrerunepartiede ladiversitéd’articlesnéontologiquespubliésdanslesC.R.

Palevol.Cecidevraitaideràréfuterlafausseimpression, présentechezcertainsauteurs,quenotrejournalestune revuestrictementpaléontologique.

Russell,2014;PadianandHorner,2014).Eventhoughthis debatestartedfromadifferenceininterpretationofcranial structuresofsomeMesozoicdinosaurs,thepapersfocused largelyon issues relevantto evolutionarytheoryrather thanonspecifictaxa.Thetheoryand practiceofphylo- geneticshasalsobeencoveredbyafewpapers.Thus,Li (2013)providesacoherence-based criteriontoevaluate treesearchstrategies.Lastbutnotleast,thecontroversial three-taxonstatementphylogeneticmethodhasalsobeen discussedin thejournal(Zaragüeta-Bagilsand Bourdon, 2007;Zaragüeta-Bagilsetal.,2012).Itseemsthatwemade therightchoiceinpublishingthesepapersbecausethelat- estsimulation-basedstudiessuggestthatitworksbetter thanunorderedparsimony,forintrinsicallyordereddata (Grandetal.,2013).Yet,mostrecentphylogeneticstud- iesbasedonphenotypicdatausedunorderedparsimony, evenforsuchintrinsicallyordereddata(Rineauetal.,2015, p.131).

Contributionsonmolecularbiologyandgenomicsare lessnumerous.Amongthese,DamervalandManuel(2003) described convergent duplications of transcription fac- tors in angiosperms, whereas Hernandez-Lopez et al.

(2013)suggestedthattheinitialphase oftheevolution- aryradiationoftheNeoaveswascharacterizedbymuch hybridization and incomplete lineage sorting. Sauquet (2013)providedanexcellentpracticalguidetomolecular dating.

Thisbriefsurveyisfarfromexhaustive;itonlyprovided afewexamplesshowingpartofthediversityofneonto- logicalpapers publishedintheC.R.Palevol.Thisshould hopefullyhelpdispelthefalseimpression,presentamong someauthors,thattheC.R.Palevolisanexclusivelypale- ontologicaljournal.

References

Arens,N.C.,West,I.D.,2008.Press-pulse:ageneraltheoryofmassextinc- tion?Paleobiology34,456–471.

Bokma,F.,Godinot,M.,Maridet,O.,Ladevèze,S.,Costeur,L.,Solé,F.,Gheer- brant,E.,Peigné,S.,Jacques,F.,Laurin,M.,2016.TestingforDepéret’s Rule(bodysizeincrease)inMammalsusingCombinedExtinctand ExtantData.Syst.Biol.65,98–108.

Borkovic, B.,Russell,A.,2014.Sexualselectionaccordingto Darwin:

AresponsetoPadianandHorner’sinterpretation.C.R.Palevol13, 701–707.

Bromage,T.G.,Juwayeyi,Y.M.,Katris,J.A.,Gomez,S.,Ovsiy,O.,Goldstein, J.,Janal,M.N.,Schrenk,F.,2016.Thescalingofhumanosteocytelacuna densitywithbodysizeandmetabolism.C.R.Palevol15,33–40.

Brusatte, S.L., Benton, M.J., Lloyd, G.T.,Ruta, M., Wang, S.C., 2011.

Macroevolutionary patterns in the evolutionary radiation of archosaurs(Tetrapoda:Diapsida).Trans.R. Soc.Edinburgh:Earth Sci.101,367–382.

Carayon,D.,Vaysse,F.,Tramini,P.,Dumoncel,J.,Esclassan,R.,2015.

The age-related maturational pattern of the human subarcuate fossa(petromastoidcanal).Preliminaryresultsfromtheapplication ofanewthree-dimensionalanalyticalapproach.C.R.Palevol14, 139–145.

Damerval,C.,Manuel,M.,2003.IndependentevolutionofCycloidea- like sequences in several angiosperm taxa. C. R. Palevol 2, 241–250.

deWever,P.,David,B.,2015.Labiodiversitédecriseencrise.AlbinMichel, Paris,301p.

4 TheComptesrendusPalevolalsopublishesneontological,evolutionarystudies/C.R.Palevolxxx(2016)xxx–xxx

Dercourt,J.,Taquet,P.,Coppens,Y.,deRicqlès,A.,Padian,K.,2002.Édito- rial/Editorial.C.R.Palevol1,1–2.

Eldredge,N.,Gould,S.J.,1972.Punctuatedequilibria:analternativeto phyleticgradualism.In:Schopf,T.J.M.(Ed.),Freeman,Cooper&Com- pany.SanFrancisco,pp.82–115.

GarcíaGil,O.,Cambra-Moo,O.,Gil,J.A.,Nacarino-Meneses,C.,Barbero, M.Á.R.,Pérez,J.R.,Martín,A.G.,2016.Investigatinghistomorphologi- calvariationsinhumancranialbonesthroughontogeny.C.R.Palevol 15,527–535.

Grand,A.,Corvez,A.,DuqueVelez,L.M.,Laurin,M.,2013.Phylogenetic inferenceusingdiscrete characters:performanceof orderedand unorderedparsimonyandofthree-itemstatements.Biol.J.Linn.Soc.

110,914–930.

Hernandez-Lopez,A.,Raoult,D.,Pontarotti,P.,2013.Birdsperchingon bushes:networkstovisualizeconflictingphylogeneticsignalsduring earlyavianradiation.C.R.Palevol12,333–337.

Hutton,J.,1795.Theoryoftheearth:withproofsandillustrations.Printed forMessrsCadell,junior,andDavies,London;andW.Creech.Edin- burgh,Vol.1,620p.

Jordana,X.,Marín-Moratalla,N.,Moncunill-Solè,B.,Nacarino-Meneses,C., Köhler,M.,2016.Ontogeneticchangesinthehistologicalfeaturesof zonalbonetissueofruminants:Aquantitativeapproach.C.R.Palevol 15,255–266.

Laurin,M.,Cubo,J.,2016.Progrèsrécentsenpaléohistologie:unhommage àunegénérationdepaléohistologistesfranc¸ais/Currentadvancesin paleohistology:AtributetoagenerationofFrenchpaleohistologists.

C.R.Palevol15,1–7.

Li,B.,2013.Evaluatingstrategiesofphylogeneticanalysesbythecoher- enceoftheirresults.C.R.Palevol12,381–387.

Moine, O.,Rousseau, D.-D., 2002.Mollusques terrestreset tempéra- tures:unenouvellefonctiondetransfertquantitative.C.R.Palevol 1,145–151.

Nacarino-Meneses,C.,Jordana,X.,Köhler,M.,2016.Firstapproachtobone histologyandskeletochronologyofEquushemionus.C.R.Palevol15, 267–277.

Padian,K.,Horner,J.R.,2014.Darwin’ssexualselection:Understanding hisideasincontext.C.R.Palevol13,709–715.

Pouydebat,E.,Laurin,M.,Gorce,P.,Bels,V.,2008.Evolutionofgrasping amonganthropoids.J.Evol.Biol.21,1732–1743.

Rineau,V.,Grand,A.,Zaragüeta,R.,Laurin,M.,2015.Experimentalsystem- atics:sensitivityofcladisticmethodstopolarizationandcharacter orderingschemes.Contrib.Zool.84,129–148.

Sauquet,H.,2013.Apracticalguidetomoleculardating.C.R.Palevol12, 355–367.

Schultze,H.-P.,2009.Interpretationofmarineandfreshwaterpaleoenvi- ronmentsinPermo–Carboniferousdeposits.Palaeogeogr.Palaeocli- matol.Palaeoecol.281,126–136.

Smith,H.F.,Parker,W.,Kotzé,S.H.,Laurin,M.,2017.Morphologicalevolu- tionofthemammaliancecumandcecalappendix.C.R.Palevol(this issue).

Werneburg,I.,2015.Neckmotioninturtlesanditsrelationtotheshape ofthetemporalskullregion.C.R.Palevol14,527–548.

Zaragüeta-Bagils,R.,Bourdon,E.,2007.Three-itemanalysis:hierarchical representationandtreatmentofmissingandinapplicabledata.C.R.

Palevol6,527–534.

Zaragüeta-Bagils,R.,Ung,V.,Grand,A.,Vignes-Lebbe,R.,Cao,N.,Ducassea, J.,2012.LisBeth:Newcladisticsforphylogeneticsandbiogeography.

C.R.Palevol11,563–566.

MichelLaurin UMR7207,Centrederecherchessurla paléobiodiversitéetlespaléoenvironnements, SorbonneUniversités,CNRS/MNHN/UPMC, Muséumnationald’histoirenaturelle, département«HistoiredelaTerre», bâtimentdegéologie,casepostale48,57,rue Cuvier,75231Pariscedex05,France E-mailaddress:michel.laurin@mnhn.fr

Received6October2016 Accepted7October2016 Availableonlinexxx