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environnementaux et techniques favorisant l’expression des symptômes dans le vignoble bordelais
Hélène Marrou
To cite this version:
Hélène Marrou. Maladies du bois de la vigne : étude des facteurs environnementaux et techniques favorisant l’expression des symptômes dans le vignoble bordelais. Sciences du Vivant [q-bio]. 2009. �hal-02823369�
MALADIES DU BOIS DE LA
VIGNE
(Esca et Black Dead Arm)
Étude des facteurs environnementaux et techniques
favorisant l’expression des symptômes dans le
vignoble bordelais.
Hélène MARROU
Maître de stage : Thierry Coulon Encadrant : J.P. Goutouly
Tuteur : J. Wery 25 septembre 2009
Impact sur le vignoble français
Des parcelles décimées
10% de la surface vignoble rendue improductive Dans le Bordelais : 88% des parcelles touchées
Interdiction de l’AsNa en 2001
Pas de produit de substitution actuellement disponible
Une inquiétude croissante chez les viticulteurs
Un besoin de solution urgent
Esca et BDA :
2 maladies de dépérissement de la vigne
Dépérissement : détérioration progressive de l’état général des ceps Un cortège de champignons…
5 champignons impliqués De nombreuses souches
Qui causent des nécroses du bois…
Nécrose centrale Nécrose sectorielle
… des décolorations foliaires…
Feuilles « tigrées » puis desséchées
… allant jusqu’à la mort du cep
Apoplexie (dessèchement brutal, estival) Mort lente
Une extrême variabilité d’expression
Dans l’espace
Entre parcelles
Entre ceps d’une même parcelle
Dans le temps
Fluctuation inter annuelle
Quels sont les facteurs qui influencent l’expression
des symptômes foliaires?
Un système complexe
De nombreux facteurs en interaction
Plante
Complexe de
pathogènes
Environnement
Destrac (2004) : Première approche écophysiologique, dans le Bordelais Littérature sur le système de défense des plantes pérennes
(Hartley et Jones, 1999; Estiarte, 1998)
HYPOTHESE FONDATRICE
Antagonisme Vigueur/défense (1)
Métabolisme I Développement Métabolisme II Mol. De défenseC
C/N élevé Carence en N Stress hydrique? C/N faible N non limitantLes polyphénols participent au renforcement du compartimentage
= mise en place de barrières physiques dans le bois
Limite la progression des champignon dans le bois Limite la mise en circulation de toxines via le xylème
Thylles et gommes dans les vaisseaux
Rayon parenchymateux
Cambium
Épaississement des dernière assises du xylème produit
l’année N
C. Jousse (2006)
Antagonisme Vigueur/défense (2)
CODIT
(Compartmentalization Of Decay In Tree)
Le réseau MDB Bordeaux
Un réseau créé en 2004
22 parcelles
1 parcelle=2000 ceps identifiés
Observations des symptômes cep à cep
• En fin de saison
• Observation de chaque bras 5 années d’observations
Informations connexes
• État des lieux : ceps morts manquants, bras morts…
• Autres maladies : Eutypiose
PAS DE BASE DE DONNEES ORGANISEE PAS DE TRAITEMENT DEPUIS 2005
1. Caractériser l’état sanitaire des parcelles
Formaliser les observations du réseau
Description de l’état annuelde chaque cep par une note de gravité
Uniformisation
• Eutypiose : non pris en compte
• Esca et BDA non différenciés
• morts, manquants, recépés, jeunes plants, complants =mortalité antérieure attribués aux maladies du bois = ceps historiques ; pas de note
• Bras mort : attribué aux maladies du bois, symptôme irréversible
Création d’une base de données répertoriant la
trajectoire sanitaire des 22*2000 ceps au cours des 5 ans
État des 2 bras Note 5 4 3 2 1 0 * * * * * *
1. Caractériser l’état sanitaire des parcelles
(suite)
Définir des indicateurs de l’état sanitaire de la parcelle
% historiques (% morts, manquants… = ceps « sans note »)
Antériorité de maladie
% exprimants
= % des ceps non historiques ayant une note >0 ~ taux d’expression
NSvx (Note Sanitaire de ceps vivants, + de 18 ans)
= moyenne pondérée des notes des ceps « non historiques »
NStot (Note Sanitaire de tous les ceps de la parcelle)
= NSvx * % historiques Ceps « historiques » Ceps vivants âgés de plus de 18 ans %. exprimants NSvx % historiques NS tot
2. Caractériser les facteurs du milieu
Rassembler des données mesurées ou modélisées décrivant
la période 2004 - 2008
Analyses de sol par parcelle (2004)
Données météo : 10 stations+interpolation (B. Bois)
Modélisation du Bilan hydrique (Lebon et al., 2003) et azoté pour chaque parcelle Modélisation de la production de biomasse végétative
(LAI avec STICS; JP Goutouly)
+mesures du poids de bois de taille (2004-2005)
Choisir un pas de temps pour le séquençage des indicateurs du milieu
Objectif : repositionner les effets du milieu sur le cycle végétatif de la vigne Pas de temps : 100°Cj
Variables concernées : climat (SomP, NBjP, Tmoy), ISv,VminN
0 100 200 300 ………… 1100 1200 1300 1400 1500
3. Développer une méthodologie statistique
pour dégager une relation entre les facteurs
Multiplicité des facteurs
insuffisance des approches classiques (Régression, Anova)
Méthodologie de classification, confrontation
Établir 5 classifications de parcelles
• ACP, Cluster hiérarchique
Confronter les 5 classifications obtenues
• AFCM
Traitements préalables
Annualisation caractérisation d’une parcelle par sa combinaison d’états
Étude des corrélations
Sélection des variables les mieux corrélées à NStot
5 classifications 1. Etat sanitaire 2. Sol 3. Climat 4. Indices de stress 5. Vigueur
4. Approfondir par des analyses ciblées
(échelle intra - parcellaire)
Relation sol – expression des symptômes
Technologie Géocarta ®
• Mesure de la résistivité des sols = indicateur texture • 7 parcelles
Comparaison de cartes
• Carte de densité de ceps symptomatiques • Carte de résistivité
• Superposition, Reg. SWR
Contenu en composés phénoliques
Technologie : Multiplex®3 = mesures de fluorescence • 2 parcelles,
• 2 sous populations de ceps :
sur sol à forte résistivité/ sur sol à faible résistivité
Comparaison teneure moyenne entre
• Ceps situés sur sols différent
• Sols exprimant à des fréquences différentes
Mise en évidence d’un trait dominant
6 modalités Classification Indices de stress 7 modalités Classification sanitaire 6 modalités Classification Climat 7 modalités Classification Biomasse 4 modalités Classification Sol Comp. 2Sol de graves Climat chaud & sec tout au long du cycle
1. Effet du pédoclimat
A l’échelle inter - parcellaire
Ciblage de la phase sensible
Sol de boulbènes Climat frais et humide,
Retard de FloraisonAzote
Reg. Lin NStot = a * NBjP4+ b
0- 500°Cj
Reg. Lin NStot = a *NBjP8+ b
500 - 800°Cj
Reg. Lin NStot = a * NBjP9+ b
800-1500°Cj 0.045 <R²<0.52 R² moy = 0.21 0.002 <R²<0.93 R² moy = 0.34 0.19 <R²<0.95 R² moy = 0.63
--100 Ω.m -- 50 100% dparcelle 80% 60% 40% 20% 0
1. Effet du pédoclimat
A l’échelle intra-parcellaire
-- 15Ω.m -- 50 --100Ω.m -- 1 -- 0.75 -- 0.50 -- 0.25 --0Répartition des ceps symptomatiques en auréoles de densité
Plus forte densité de ceps symptomatiques sur les zones à faible résistivité
• Superposition partielle ou quai- exacte
• Non indépendance pou 5 parcelles/7
Rappel :
Composés indicateurs de vigueur 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 2 2.1 2.2 0 2 4 5 u n it é M u lt ip le x . 0 0.01 0.02 0.03 0.04 0.05 0.06 0.07 0.08 u n it é M u lt ip le x . SFR NBI b a a a bc ab c a Molécules de défense 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 0 2 4 5
Nombre d'années d'expression
u n it é M u lt ip le x . -2.5 -2 -1.5 -1 -0.5 0 u n it é M u lt ip le x . FLAV ANTH-SFR a b ab a b b a b
2. Relation sol – molécules de défense –
expression de symptômes
Azote N N + 1 N+2 N N+1 N+2Des relations apparentes sur les parcelles à large gamme
Schéma de synthèse
Croissance Défense Génome Gravitédes symptômes année N-1 Vigueur + -Sol Climat Pratiques PATHOSYSTEME PLANTE HISTORIQUE EFFICACITE DU COMPARTIMENTAGE Complexe de Pathogènes 0% 80% 100% 30%1ers éléments de réponse à la profession
1. Réduire la vigueur
Maîtriser la fertilisation Enherbement?
Taille : régulation du rapport surface foliaire / fruit
2. Stimuler les défenses de la vigne
Des molécules qui restent à trouver
Efficacité mitigée sur les plantes très vigoureuses
• Stratégie sur le long terme?
• Mesure de 2nde génération, après réduction de la vigueur Protocole d’applications à définir
Principaux acquis
Confirmation de la relation entre vigueur et expression de
symptômes
Impact du pédoclimat :
• climat frais et humide favorable à la vigueur et à l’expression des symptômes • Sol à forte réserve utile favorable à la vigueur et à l’expression des symptômes Phase de sensibilité maximale : post - floraison (500-800°Cj)
Accroissement de la sensibilité en fonction de la proportion de tissus touchés (historiques)
Contenu en composés phénoliques plus important chez les ceps asymptomatiques (strict)
Développement d’une méthodologie statistique adaptée
À l ’analyse multivariéePerspectives
Arrêt du réseau…?
Suffisamment de données accumulées
5 ans de mesures = suffisant pour analyser l’évolution (Surico, 2004)
Des résultats à vérifier
Confirmer les classifications avec d’autres parcelles
Développer des approches ciblées :
Généralisation du traitement Géocarta Optimiser l’utilisation du Multiplex
Études en conditions contrôlées (serres): inoculations, recherche de marqueurs, reproduction des symptômes, sur plants stressés (N, C , H20)