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Submitted on 18 Jun 2020
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Gestion des échantillons végétaux à l’Unité de Recherche Ecologie des Forêts Méditerranéennes INRA-PACA
Matthieu Lingrand, Frédéric Jean, Caroline Scotti-Saintagne, Philippe Clastre
To cite this version:
Matthieu Lingrand, Frédéric Jean, Caroline Scotti-Saintagne, Philippe Clastre. Gestion des échantil- lons végétaux à l’Unité de Recherche Ecologie des Forêts Méditerranéennes INRA-PACA. Journées d’Animation Transversale EFPA 2019 Echantillons biologiques et Qualité, Nov 2019, Orléans, France.
�hal-02873311�
Gestion des échantillons végétaux
à l’Unité de Recherche Ecologie des Forêts Méditerranéennes INRA-PACA
Réunion pour évaluer les besoins et mise
en œuvre du protocole
d'échantillonnage
Un seul identifiant unique par échantillon Génération d’un
fichier interface Labo/Terrain Modalités de récolte
Défini dans le protocole de
recherche Validation des
résultats d’analyse
Contexte de la collecte d’échantillons à l’URFM :
Adaptation des forêts au changement climatique (perturbation, risques, résilience)
Acteurs de la gestion des échantillons :
ITA, Chercheurs, Cellule SIG-BDD
Légende des pictogrammes Bonne idée et/ou astuce Difficulté
Règle, bonne pratique
Matthieu Lingrand, Frédéric Jean, Caroline Scotti-Saintagne, Bruno Fady, Philippe Clastre
Document Qualité de recensement des échantillons : COLL_QUAL_E_Inventaire_Type_Ech_vDGBF2
OUI
NON
Stockage sans limite de temps
DESTRUCTION
génotypage
séquençage
Intégration des échantillons dans la base de données PlantaExp
Mise a disposition des échantillons
Système de surveillance et
d’alerte des enceintes
climatiques (niveau Centre)
Base de données
Sites Naturels
ID Individu
Qui Quoi Combien Pourquoi
utilisateur
Interrogatio n SI
Gestionnaire
Demande d’accès aux échantillons
Retour d’échantillons et quantités prélevées Création d’un
fichier de mise à jour
Manipulation des échantillons
Points de vigilance génériques : RH (volontariat) , financements sur projet Points forts génériques : Cellule SIG-BDD + groupe de travail transversal UR-UEFM EVEA (Echantillons Vivants et Enceintes Associées)
plusieurs types de conservation
gestions des pannes des enceintes -20°C
pollen
feuilles graines
bourgeons carottes racines
insectes
Lieu Boite
ID Echantillon Nature
Combien
