Impact écotoxicologique de la leptospermone, un herbicide β-tricétone naturel, sur l’abondance et la diversité de la communauté bactérienne du sol

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Submitted on 3 Jun 2020

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Impact écotoxicologique de la leptospermone, un herbicide β-tricétone naturel, sur l’abondance et la

diversité de la communauté bactérienne du sol

Sana Romdhane, Marion Devers-Lamrani, Cédric Bertrand, Christophe Calvayrac, Jean-François Cooper, Franck Dayan, Lise Barthelmebs, Fabrice

Martin-Laurent

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Sana Romdhane, Marion Devers-Lamrani, Cédric Bertrand, Christophe Calvayrac, Jean-François Cooper, et al.. Impact écotoxicologique de la leptospermone, un herbicide β-tricétone naturel, sur l’abondance et la diversité de la communauté bactérienne du sol. 7. Colloque AFEM Association Francophone d’Ecologie Microbienne, ”Microbiologie et environnement : fondamentaux et applica- tions” , Université de Pau et des Pays de l’Adour (UPPA). FRA., Nov 2015, Anglet, France. 143 p.

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Session 1 : Dynamique de la

biodiversité, évolution et biogéographie

1

Impact écotoxicologique de la leptospermone, un herbicide β-tricétone naturel, sur

l’abondance et la diversité de la communauté bactérienne du sol

Sana Romdhane ^{∗ 1}, Marion Devers-Lamrani ², Cédric Bertrand ³, Christophe Calvayrac ⁴, Jean-François Cooper ³, Franck Dayan ⁵, Lise

Barthelmebs ⁶, Fabrice Martin-Laurent ⁷

1Univ. Perpignan (UP) – Univ. Perpignan – Univ. Perpignan Via Domitia, Biocapteurs Analyse Environnement, F-66860, Perpignan, France., France

2 INRA (UMR Agroécologie) – Institut national de la recherche agronomique (INRA) : UMR1347 – INRA UMR Agroécologie 17 rue sully BP86510 21065 Dijon Cedex, France

3 Univ. Perpignan (UP) – CNRS : USR3278 – Univ. Perpignan Via Domitia, Laboratoire de Chimie des Biomolécules et de l’Environnement – CRIOBE – USR 3278 CNRS EPHE, F-66860, Perpignan,

France, France

4 Univ. Perpignan (UP) – CNRS : UMR3278 – Univ. Perpignan Via Domitia, Laboratoire de Chimie des Biomolécules et de l’Environnement – CRIOBE – USR 3278 CNRS EPHE, F-66860, Perpignan,

France, France

5United States Department of Agriculture (USDA) – Agricultural Research Service US Arid Land Agricultural Research Center, Maricopa, AZ, USA, États-Unis

6 Univ. Perpignan (UP) – Université de Perpignan – Univ. Perpignan Via Domitia, Biocapteurs Analyse Environnement, F-66860, Perpignan, France., France

7 INRA (UMR Agroécologie) – Institut national de la recherche agronomique (INRA) : UMR1347 – INRA UMR 1347 Agroécologie 17 rue sully BP 86510 21065 Dijon Cedex, France

L’utilisation quasi-généralisée des produits phytopharmaceutiques a altéré la santé de l’environnement et de l’homme. Actuellement, l’un des enjeux essentiels de l’agriculture est l’intensification

écologique visant à satisfaire la demande croissante en produits agricoles tout en respectant l’environnement et la santé humaine. Dans ce contexte, une nouvelle génération de molécules telle que les biopesticides paraît prometteuse pour remplacer les pesticides de synthèse. Etant d’origine naturelle, ces nouvelles molécules sont supposées être facilement biodégradables et plus respectueuses de l’environnement. Dans ce contexte, le projet ANR TRICETOX vise à décrire le devenir environnemental d’herbicides de synthèse (sulcotrione et mesotrione) et naturels (lep- tospermone et myrigalone) de la famille chimique β-tricétone et à estimer leur impact écotoxi- cologique sur la communauté bactérienne de sols agricoles. Dans cette présentation, nous rappor- tons l’évaluation de l’impact écotoxicologique de la leptospermone, un composé allélochimique synthétisé par des myrtacées telles que Callistemon citrinus, présentant une activité herbicide.

Pour ce faire, nous avons établi dans des microcosmes de sol incubés dans des conditions con- trôlées au laboratoire, des cinétiques de dissipation de la leptospermone, dans deux types de sol afin d’évaluer sa dégradation biologique et sa persistance dans les sols, pour définir le scénario d’exposition de la communauté bactérienne. L’impact écotoxicologique de la leptospermone a

∗Intervenant

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été estimée en appliquant des outils moléculaires afin de (i) mesurer par qPCR ciblant l’ARNr 16S l’abondance de 11 groupes microbiens et (ii) évaluer la diversité génétique de la communauté bactérienne par une approche de séquençage de nouvelle génération d’amplicons d’ARNr 16S.

Mots-Clés: β, tricétones, leptospermone, écotoxicologie, pyroséquençage, communauté bactérienne

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