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La diversité des virus sur cucurbitacées au Vénézuéla

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Academic year: 2021

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La diversité des virus sur cucurbitacées au Vénézuéla

Gustavo Romay, Hervé Lecoq, Francis Geraud-Pouey, Dorys Chirinos, Cecile Desbiez

To cite this version:

Gustavo Romay, Hervé Lecoq, Francis Geraud-Pouey, Dorys Chirinos, Cecile Desbiez. La diversité

des virus sur cucurbitacées au Vénézuéla. 13. Rencontres de Virologie Végétale, Jan 2011, Aussois,

France. 2011, RVV 2011. �hal-02747370�

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Comment citer ce document :

Romay, G., Lecoq, H., Geraud-Pouey, F., Chirinos, D., Desbiez, C. (2011). La diversité des virus sur cucurbitacées au Vénézuéla. In: RVV 2011 (p. 87). Presented at 13. Rencontres de

Virologie Végétale, Aussois, FRA (2011-01-16 - 2011-01-20).

13

èmes

Rencontres de Virologie Végétale-Aussois-2011/01/16-20

87 La diversité des virus sur cucurbitacées au Vénézuéla

Romay, G

1

. Lecoq, H

1

, Geraud-Pouey, F

2

. Chirinos, D.T.

2

& Desbiez, C

1

1) INRA, Unité de Pathologie Végétale UR407, F-84140 Montfavet, France

2) La Universidad del Zulia (LUZ), Facultad de Agronomía, Unidad Técnica Fitosanitaria, La Universidad del Zulia, Maracaibo 4005, Estado Zulia, Venezuela

Les principales cucurbitacées cultivées au Venezuela sont le melon (Cucumis melo), la pastèque (Citrullus lanatus) et le concombre (Cucumis sativus). La courge (Cucurbita maxima) et la courgette (Cucurbita pepo) sont aussi cultivées, mais en moindre proportion.

Depuis les années 1960, peu de travaux ont été effectués sur les virus infectant les cucurbitacées au Venezuela. Le but de cette étude était d’identifier et caractériser la prévalence des virus infectant les cucurbitacées dans ce pays, en vue d’améliorer la lutte contre ce type de maladies. Dans ce but, 251 échantillons de cucurbitacées présentant des symptômes de maladies virales ont été collectés à partir des principales zones de production de cucurbitacées au Venezuela. La détection des virus a été effectuée par polymerase chain reaction (PCR) ou par rolling circle amplification (RCA) pour les virus à ADN, et par reverse- transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) pour les virus à ARN. La majorité des échantillons (61,3%) était infectée par un begomovirus décrit au Venezuela en 2004 et partiellement caractérisé, le melon chlorotic mosaic virus (MeCMV). Trois potyvirus ont été détectés, le papaya ringspot virus (PRSV) (27,9%), le zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) (25,6%) et le watermelon mosaic virus (WMV) (1.6%). Le cucumber mosaic virus (CMV, cucumovirus) a aussi été détecté à une assez faible fréquence (5.6%), alors que tous les échantillons ont été négatifs pour le cucurbits aphid-borne yellows virus (CABYV). Par RCA, la séquence complète des 2 composants (ADN-A et ADN-B) du MeCMV a été obtenue, ainsi que celle d’un satellite associé à ce virus qui a été dénommé MeCMVa1. L’organisation génétique du MeCMV est typique des begomovirus du Nouveau Monde. Le satellite MeCMVa1 présentait une structure génétique similaire à celle des alphasatellites associés aux begomovirus monopartites de l’Ancien Monde, avec un cadre ouvert de lecture (ORF1) correspondant à une protéine associée à la réplication (rep) et une région riche en adenosines.

Toutefois, ce satellite présentait deux caractéristiques particulières : un second ORF potentiel

inclus dans l’ORF1 et un nonanucléotide AAGTATTAC légèrement différent du

TAGTATTAC présent chez les alphasatellites de l’Ancien Monde. La présence de cet

alphasatellite atypique apporte des perspectives nouvelles sur l’origine et l’évolution des

begomovirus et de leurs satellites.

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