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Algorithme des quatre russes

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Academic year: 2022

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(1)

Algorithme des quatre russes

(2)

C A G T C A A

T G T C A

0 1 2 3 4 5 6

6 5 4 3 2 1

Vecteurs offset 1ere ligne et colonne

+1 +1 +1 +1 +1 +1

+1 +1 +1 +1 +1 +1

0

Subdiviser en t-blocs

C A G 0 1 2 3 A 1 1 1 2 T 2 2 2 2 G 3 3 3 2

0 -1

0 0

0 0 -1 0 0 -1 0

-1 0

0

T C A

0 1 2 3

A -1 0 1 2 T -1 -1 0 1 G -1 0 0 1

0 -1 -1 0

0 -1 0 +1

-1 -1 +1 0 -1 0

-1 +1+1

+1 +1

0 -1 -1-1 -1

-1 -1

D(6,6)= D(6,0) -1 -1 +1 -1 -1 -1 =2

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