Suivi de population d’une espèce
vulnérable par la méthode de CMR en forêt exploitée :
le Sonneur à ventre jaune (Bombina variegata) en forêt domaniale de Verdun
Rencontres herpétologiques Grand Est 2015
9 600 hectares
« Natura 2000 »
Historique de l’étude et du site
Sites à Sonneur situés à l’ouest
du massif (étage argilo-marneux)
8 ans de suivi de population
Jeu de données de plus de 10 000
individus
Reconnaissance individuelle…
La méthode de capture marquage recapture
ID Sexe Stade S1 2008 S2 2008 S3 2008 S1 2009 S2 2009 S3 2009 S4 2009 S1 2010 S2 2010 S3 2010 S4 2010 S1 2011 S2 2011 S3 2011 S1 2012 S2 2012 S3 2012 S1 2013 S2 2013 S3 2013 S1 2014 S2 2014 S3 2014
F208-10 F A 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0
F329-10 F J 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0
F3732 F S 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
F4043 F A 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0
F2782 F A 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
F2783 F A 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0
F2786 F A 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0
I3936 S J 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
I241-10 M S 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 1
I242-10 J J 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
F4199 F A 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 0 1 1 0
IMG_0014 M A 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
IMG_0017 F A 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 1 0 1 0
IMG_0965_240613_34 S S 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 IMG_0969_240613_34 S J 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 IMG_1810_190614_135_F F A 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 IMG_1043_260514_203_F M A 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1
… et histoires de captures…
…Pour estimer
- des tailles de population
…Pour estimer
- des tailles de population
- des paramètres démographiques : survie, recrutement...
…Pour estimer
- des tailles de population
- des paramètres démographiques : survie, recrutement...
et évaluer l’impact de facteurs environnementaux ou humain sur la dynamique de la population…
…Pour estimer
- des tailles de population
- des paramètres démographiques : survie, recrutement...
et évaluer l’impact de facteurs environnementaux ou humain sur la dynamique de la population…
…quand tous les individus de la population ne sont pas détectables
…Pour estimer
- des tailles de population
- des paramètres démographiques : survie, recrutement...
et évaluer l’impact de facteurs environnementaux ou humain sur la dynamique de la population…
…quand tous les individus de la population ne sont pas détectables Mais attention de bien définir les questions auxquelles on
souhaite répondre au préalable !
La détectabilité
La détectabilité dépend de facteurs environnementaux,
(type d’habitat…
La détectabilité dépend de facteurs environnementaux,
(type d’habitat, saison,
conditions météorologiques au moment des captures ou sur une année considérée…)
La détectabilité dépend de facteurs environnementaux, de la biologie de
l’espèce…
Aire de repos
Site de reproduction
La détectabilité dépend de facteurs environnementaux, de la biologie de
l’espèce…
…et de la
robustesse du protocole !
Zone d’étude Zone de présence de l’espèce
-Bien cerner la population que l’on veut étudier pour bien définir la zone d’étude
-Maximiser le taux de recapture -> Prévoir une pré-étude
(mise en œuvre de la CMR
Pendant une année « à blanc »)
Attention : on ne suit que les sites de
reproduction !
2 4
5
7 6
Détectabilité et disponibilité à la capture : émigration temporaire
Disponible à la capture et capturé : 1
Disponibles à la capture mais non capturé :
2 : présent à proximité du site lors de la session de capture, non détecté, 3 : présent sur le site, non détecté ou détecté mais non capturé, 4 : en déplacement entre deux sites aquatiques (de reproduction ou de repos), 5 : présent sur un site de reproduction non connu. Ils ont une probabilité non nulle d’être capturés au cours de la saison, mais ne sont
effectivement pas tous capturés. Leur probabilité de capture peut être estimée.
Indisponible à la capture : 7 : ne participe pas à la reproduction cette année-là et reste à terre. Sa probabilité de capturé est nulle
6 : Indisponible à la capture si sa probabilité de détection est nulle (site inconnu, individu fidèle à ce site durant la saison), disponible à la capture sinon (site connu ou pas, individu susceptible de se déplacer vers un site de reproduction).
La mise en oeuvre
Un point clef :
la reconnaissance des individus Pas d’erreur d’identification !
ID Sexe Stade S1 2014 S2 2014 S3 2014
2014_1 2014_2 2014_3
IMG_0827_220514_168.2_M M A 1 1 1 IMG_0827_220514_168.2_M P1180648_180614_168.2_M P1040721_170714_168.2_M IMG_0533_200514_18B_J J J 1 1 1 IMG_0533_200514_18B_J P1030837_180614_18a_S IMG_2265_170714_18a_S IMG_0545_200514_220_S S S 1 1 1 IMG_0545_200514_220_S P1030879_180614_219_S IMG_2285_170714_220_S
IMG_0154_190514_230_M M A 1 0 0 IMG_0154_190514_230_M 0 0
IMG_0292_190514_101a_F F A 1 0 0 IMG_0292_190514_101a_F 0 0
IMG_0197_190514_231_J J J 1 0 1 IMG_0197_190514_231_J 0 P1040425_150714_231_S IMG_0224_190514_101_F S S 1 0 1 IMG_0224_190514_101_F 0 P1180897_150714_230_S IMG_0256_190514_101_S F A 1 0 1 IMG_0256_190514_101_S 0 P1180912_150714_101c_F
ID Date Site Sexe/stade
IMG_0292_190514_101a_F 19/05/2014 101a F 2014 Session 1
IMG_0292_190514_101a_F
Rappel du protocole de lutte contre la
chytridiomycose
www.alerte-amphibien.fr
Et demande de dérogation pour les captures !
MERCI !
