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Etude des mécanismes moléculaires contrôlant la prolifération des cellules de la crête neurale chez le xénope

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Academic year: 2021

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Texte intégral

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Université Libre de Bruxelles

Faculté des Sciences

Département de Biologie Moléculaire

Institut de Biologie et de Médecine Moléculaire (IBMM) Laboratoire d’Embryologie Moléculaire

Directeur de thèse : Eric J. Bellefroid

Etude des mécanismes moléculaires contrôlant la prolifération des cellules de la crête neurale

chez le xénope

Thèse présentée en vue de l’obtention du grade de Docteur en Sciences

Massimo NICHANE

Année académique 2008-2009

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Etude des mécanismes moléculaires contrôlant la prolifération des cellules de la crête neurale chez le xénope

Thèse présentée en soutenance privée le 22 octobre 2009 devant le jury composé des membres suivants :

Pr. E. Pays Université Libre de Bruxelles Président Dr. A-M. Marini Université Libre de Bruxelles Secrétaire

Dr. E.J. Bellefroid Université Libre de Bruxelles Direteur de thèse Dr. F. Andris Université Libre de Bruxelles Expert de la Faculté Dr. P. Vanderhaeghen Université Libre de Bruxelles Expert de la Faculté Dr. A-H. Monsoro-Burq Université Paris-Sud XI (France) Expert Extérieur

Massimo Nichane

Laboratoire d’Embryologie Moléculaire

Institut de Biologie et de Médecine Moléculaire (IBMM) Département de Biologie Moléculaire

Faculté des Sciences

Université Libre de Bruxelles

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Abréviations

7TM : 7 TransMembrane receptor

ADAM : A Disintegrin And Metalloprotease ADN : acide désoxyribonucléique

ADNc : acide désoxyribonucléique complémentaire AP2α : Activator Protein-2α

AR : acide rétinoïque Arg : Arginine

ARN : Acide RiboNucléique

ARNm : acide ribonucléique messager BCIP : Bromo Chloro Indolyl Phosphate Bcl-2 : B-Cell Lymphoma protein-2

Bcl-xL : B-Cell Lymphoma protein- eXtra Large BCNE : Blastula Chordin Noggin Expression center bHLH : basic Helix Loop Helix

bHLH-O : basic Helix Loop Helix-Orange domain

bHLH-PAS : basic Helix Loop Helix-Per-Arnt/AhR-Sim domain bHLH-zip : basic Helix Loop Helix-leucine zipper

BMB : Boeringher Mannheim Blocking BMP : Bone Morphogenetic Protein BSA : Bovine Serum Albumine

CBP/p300 : CREB Binding Protein/E1A binding protein p300 Cdc25A : Cell Division Cycle 25 homolog A

Cdk : Cyclin Dependent Kinases

CIS : Cytokine Induced STAT inhibitor CN : Crête Neurale

CRM1 : Chromosome Region Maintenance 1 DAPI : 4',6'-DiAmidino-2-PhénylIndole DEPC : DiEthyl PyroCarbonate

DLL1 : DeLta-Like 1

E suivi d’un chiffre : désigne le stade de développement chez l’embryon de souris. Le chiffre correspond au nombre de jours après l’accouplement.

EDTA : EthyleneDiamineTetraacetic Acid EGF : Epidermal Growh Factor

EGFR : Epidermal Growh Factor Receptor

EMT : Epithelial Mesenchyme Transition (transition épithélio-mésenchyme) Eph : Erythropoietin-producing hepatoma

ERK : Extracellular signal-Regulated Kinases ES : Embryonic stem cell

ESR : Enhancer of Split Related

FACS : Fluorescence-Activated Cell Sorting FGF : Fibroblast Growth Factor

FGFR : Fibroblast Growth Factor Receptor FoxD3: FOrkhead boX D3

GAPDH : GlycerAldehyde 3-Phosphate Dehydrogenase G-CSF : Granulocyte-Colony Stimulating Factor

GFAP : Glial Fibrillary Acidic Protein

GFP : Green Fluorescent Protein

GSK3β : Glycogen Synthase Kinase β

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GTPases : Guanine Tri-Phosphatases HATs : Histone Acetyl Transferases hCG : human Chorionic Gonadotropin HDACs : Histone DéACétylases

Her : Hairy and Enhancer of Split Related Hes : Hairy and Enhancer of Split

HLH : Helix Loop Helix

HNF-1 : Hepatocyte Nuclear Factor-1 HRT : Hairy Related Transcription factor HSCs : Hematopoietic Stem Cells

Id : Inhibitor of differentiation IL-6 : InterLeukin-6

ISCs : Intestinal Stem Cells JAKs : Janus Associated Kinases JNK : c-Jun N-terminal Kinase Kb : kilobase

kDa : kilodalton

LAR II : Luciférase Assay Reagent II Lys : Lysine

MAB : Maleic Acid Buffer

MAP2 : Microtubule-associated protein 2 MAPK : Mitogen Associated Protein Kinase Mash1: Mouse Achaete-Scute Homologue 1 MBS : Modified Barth Saline

Mcl-1 : Myeloid Cell Leukemia-1

MEMFA : MOPS-EGTA-MgSO4-FormAldéhyde MMPs : Matrix Metallo-Proteases

MO : morpholinos

mRFP : Membrane bound Red Fluorescent Protein Msx : Msh homeobox 1

MyoD : Myogenic differentiation 1 NBT : Nitro Blue Tetrazolium

NCoA : Nuclear receptor Coactivator A Ngn3 : Neurogenin 3

NLK : Nemo-Like Kinase

PAGE : PolyAcrylamide Gel Electrophoresis Pax : PAired boX

Pb : paires de bases

PBS : Phosphate Buffer Saline

PC3 : human Prostate Cancer cell line 3 PCAF : P300/CBP Associated Factor PCP : Planar Cell Polarity pathway PCR : Polymerase Chain Reaction PDGF : Platelet Derived Growth Factor

PI3K/Akt : PhosphoInositide 3-Kinases/V-akt murine thymoma viral oncogene PIAS : Protein that Inhibit Activated Stat proteins

PKC : Protein Kinase C PLB : Passive Lysis Buffer PLCγ : PhosphoLipase C γ

PMSF : phenylmethylsulphonyl fluoride

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PRMT1 : Protein aRginine MethylTransferase 1 Ptf1a : Pancreas specific Transcription Factor 1a PTw : PBS Tween-20

PVDF : PolyVinylidine DiFluoride

RBPJk : Recombination signal Binding Protein for immunoglobulin kappa J region RBs : RenalBlasts

REMI : Restriction Enzyme Mediated Integration RLDx : Rhodamine Lysine Dextran

RNase : ribonucléase

RNSCs : Renal Nephric Stem Cells RTKs : Receptor Tyrosine Kinase SDS : Sodium Dodecyl Sulfate Ser : Serine

SH2 : Src Homology 2

SHP : Src Homology 2-containing protein-tyrosine phosphatase SLIM : STAT-interacting LIM protein

SOCS : Suppressor Of Cytokine Signaling Sox : Sry HMG-box

Src : Sarcoma

Stat : Signal Transducers and Activator of Transcription Su(H) : Suppressor of Hairless

SUMO : Small Ubiquitin-like MOdifier TAK1 : TGF-β Activated Kinase 1 TBST : Tris Buffer Saline Tween-20

TcPTP : T cell Protein Tyrosine Phosphatase TDT : Terminal Desoxynucleotide Transferase TGF-β : Transforming Growth Factor-β

TLE : Transducin-Like Enhancer of split Tyr : Tyrosine

UTP : Uracil TriPhosphate VegT : Vegetal T-box Wnt : Wingless Int-1

Xnr : Xenopus nodal related

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