Cours: Bases de données biologiques

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FACULTÉ DES SCIENCES DE LA NATURE ET DE LA VIE DÉPARTEMENT DE BIOLOGIE APPLIQUÉE

Cours: Bases de données biologiques

Proposé par:

Dr. YOUCEF-ALI M.

Année universitaire: 2020-2021

Public cible: Etudiants L3 Bioinformatique

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Présentation de la matière

Unité d'Enseignement Fondamentale 2 : BIOINFORMATIQUE GENERALE Matière 1 : Banques de Données Biologiques

Crédits : 04 Coefficient : 02

Objectifs de l’enseignement :

- Apprendre à explorer les banques génomiques et protéiques;

- Apprendre à extraire des séquences, profils et motifs protéiques et nucléiques.

Connaissances préalables recommandées : - Outil Internet;

- Structure des acides nucléiques et des protéines.

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Contenu de la matière

-Introduction à la technologie d’Internet

-Définition de base de données : Exemples biologiques -Description des portails Expasy et NCBI

- Les bases de données génomiques -Les banques généralistes

-Les bases spécifiques

-Les bases de données protéiques -Les banques généralistes -Les bases spécifiques -Les logiciels de BLAST

-Systèmes d’exploration des banques biologiques (Le système SRS et le système Entrez)

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-Introduction à la technologie d’Internet

-Définition de base de données : Exemples biologiques -Description des portails Expasy et NCBI

- Les bases de données génomiques -Les banques généralistes

-Les bases spécifiques

-Les bases de données protéiques -Les banques généralistes -Les bases spécifiques -Les logiciels de BLAST

-Systèmes d’exploration des banques biologiques (Le système SRS et le système Entrez)