Catherine TROTTIER
Maˆıtre de Conf´erences - Classe Normale Universit´e Paul Val´ery - Montpellier 3 Section CNU : 26
N´ee le 10 avril 1971 `a Tours (Indre-et-Loire) Nationalit´e fran¸caise
adresses professionnelles : Universit´e Paul Val´ery UFR4 - D´epartement MIAp Route de Mende
34199 Montpellier cedex 5 T´el. : 04 67 14 25 09
Email : catherine.trottier@univ-montp3.fr http://www.univ-montp3.fr/miap/∼trottier/
I3M - Universit´e Montpellier 2 Case courrier 051
34095 Montpellier cedex T´el. : 04 67 14 41 64
Email : catherine.trottier@univ-montp2.fr
D´eroulement de carri`ere
• 2002-2013 :
Maˆıtre de conf´erences `a l’universit´e Paul Val´ery - Montpellier 3.
Rattachement recherche `a I3M (Institut de Math´ematiques et Mod´elisation de Montpel- lier) - Universit´e Montpellier 2 (UMR CNRS 5149).
• 1999-2002 :
Maˆıtre de conf´erences `a l’universit´e Charles de Gaulle - Lille 3.
Rattachement recherche au Gremars (Groupe de recherche : “Mod´elisation appliqu´ee `a la Recherche en Sciences Sociales”) - Universit´e Lille 3 (EA 2459).
• 1998-1999 :
Postdoctorat `a l’Inria Rhˆone-Alpes - Projet is2 (Inf´erence Statistique pour l’Industrie et la Sant´e) sur un CERD avec EDF.
• 1994-1998 :
Doctoratde l’Institut National Polytechnique de Grenoble - sp´ecialit´e : math´ematiques appliqu´ees.
Titre de la th`ese : Estimation dans les mod`eles lin´eaires g´en´eralis´es `a effets al´eatoires.
Travail effectu´e au sein du Laboratoire de Mod´elisation et de Calcul (LMC - IMAG) et de l’Inria Rhˆone-Alpes. Dir. : C. Lavergne
Th`ese soutenue le 2 Juillet 1998 `a Grenoble. Jury : J.-L. Soler, M. Bonneu (rap.), J.-L.
Foulley (rap.), A. Antoniadis.
Financement bourse MESR (1994 - 1997) puis contrat ATER (1997 - 1998).
Monitorat `a l’UJF (Universit´e Joseph Fourier - Grenoble I), U.F.R. Informatique et Math´ematiques Appliqu´ees (1994 - 1997).
• 1994 :
D.E.A. de Math´ematiques Appliqu´ees de l’UJF - Department of Mathematics de l’Imperial College `a Londres.
Diplˆome d’ing´enieur ENSIMAG
Enseignement
L1 psychologie Statistique descriptive univari´ee Cours en amphi depuis 2002
/ sociologie / AES et TD
Gestion d’enseignement tr`es gros effectif depuis 2005
(1400 ´etudiants en 2012-2013) - Recrutement des vacataires Recrutement des vacataires
Deug1 MASS Initiation aux probabilit´es Cours et TD de 2003 `a 2005 Deug Misashs Statistique uni- et bi-vari´ee Cours et TD de 2002 `a 2004 Deug psychologie Statistique descriptive Cours en amphi de 1999 `a 2002
et TD
L2 psychologie Statistique bivari´ee TD de 2002 `a 2010
L2 AES-misashs Initiation aux probabilit´es Cours et TD depuis 2010 L3 psychologie Initiation aux probabilit´es Cours en amphi depuis 2004
Gestion d’enseignement gros effectif et TD
(400 ´etudiants en 2012-2013)
L3 psychologie Inf´erence statistique Cours et TD depuis 2012
L3 AES-misashs Initiation au logiciel R Cours et TP depuis 2011
Licence psychologie Statistique inf´erentielle Cours en amphi de 1999 `a 2002 et TD
Maˆıtrise MASS Mod`eles lin´eaires Cours, TD, TP de 2002 `a 2004 M1 IDS Statistique descriptive et inf´erentielle Cours, TD, TP de 2007 `a 2009
sous excel
Ecole´ ENSIA-SIARC Statistique descriptive et inf´erentielle, Cours, TD, TP de 2005 `a 2007
ing´e. probabilit´es sous excel
M2 SOI Statistique descriptive et inf´erentielle Cours, TD, TP 2005-2006 sous R
M2 Biostatistique Mod`eles lin´eaires mixtes Cours, TD, TP depuis 2010
Responsabilit´es administratives
• Responsable des sections 25 et 26 `a l’universit´e Montpellier 3 : gestion des 2500 heqTD d’enseignement, ventilation des services, recrutement vacataires, coordination (depuis 2008).
•Coordination des actions duplan “R´eussite en Licence”pour l’UFR 4 - universit´e Montpellier 3 (2008-2011).
• Participation aux commissions de sp´ecialistes de l’universit´e Montpellier 3 (2007) et de l’universit´e d’Aix-Marseille (2007) et aucomit´e de s´electionde l’universit´e Montpellier 1 (2013).
Th`emes de recherche
• Mod`eles lin´eaires mixtes (L2M) et mod`eles lin´eaires g´en´eralis´es mixtes (GL2M).
• Choix de mod`ele dans les GL2M.
• Mod´elisation par m´elange de GL2M.
• Mod`eles lin´eaires g´en´eralis´es mixtes multiphasiques.
• Donn´ees longitudinales de comptage.
• R´egression PLS.
• R´egression multivari´ee de donn´ees non gaussiennes sur composantes.
• D´eveloppements appliqu´es en mod´elisation de l’architecture des plantes.
• D´eveloppements appliqu´es en sciences du langage.
Encadrement
• Co-encadrement de th`ese
2002 - 2006 : Marie-Jos´e Martinez “Mod`eles lin´eaires g´en´eralis´es `a effets al´eatoires : contributions au choix de mod`ele et au mod`ele de m´elange” - Universit´e Montpellier 2.
2005 - 2008 : Florence Chaubert “Combinaisons markoviennes et semi-markoviennes de mod`eles de r´egression. Application `a la croissance d’arbres forestiers.” - Universit´e Montpellier 2.
2010 - : Jean Peyhardi “Combinaisons markoviennes et semi-markoviennes de mod`eles lin´eaires g´en´eralis´es mixtes appliqu´ees `a lanalyse de larchitecture des plantes en relation avec des facteurs g´en´etiques et environnementaux” - Universit´e Montpellier 2.
2004 - 2010 : Participation `a la th`ese d’Harold Andres Guerrero Lopez “Caract´erisation de la voix de l’enfant sourd appareill´e et implant´e cochl´eaire : approches acoustique et perceptuelle et proposition de mod´elisation” - Universit´e Montpellier 3.
• Participation Comit´e de th`ese
2002 - 2004 : Carine V´era “Mod`eles lin´eaires mixtes multiphasiques pour l’analyse de donn´ees lon- gitudinales - Application `a la croissance des plantes”’ - Universit´e Montpellier 2 - Dir. de th`ese : Y.
Gu´edon (CIRAD) - C. Lavergne (I3M)
2006 - 2009 : Cir´e Elimane Sall “Estimation de l’apparentement g´en´etique par la m´ethode du maxi- mum de vraisemblance composite avec prise en compte de l’information spatiale” - Universit´e Mont- pellier 2 - Dir. de th`ese : F. Mortier (CIRAD) - A. Gannoun (CNAM).
2009 - 2012 : Olivier Taugourdeau “R´eponses des arbres aux gradients environmentaux : ´etude de la plasticit´e architecturale en milieu m´editerran´een” - Dir. de th`ese : Caraglio Y., Sabatier S. (CIRAD).
2009 - : Caroline Mwongera “Pertes de semences dans les syst`emes agricoles traditionnels en lien avec l’irr´egularit´e des pluies au Kenya” - Dir. de th`ese : Leclerc C., Dosba F.
• Encadrement stages master 2 et fin d’´etudes d’´ecole d’ing´enieur
2004 : L. Gourari “M´ethodes d’analyse de donn´ees longitudinales de comptage appliqu´ees `a des suivis de croissance de caf´eiers.” (stage M2)
2005 : T. Pierre-Joseph “Analyse de donn´ees de comptage. Mod´elisation de l’effet de la pluviom´etrie sur la croissance des caf´eiers.” (stage M2)
2006 : M. Zouch “Mod`ele de Poisson pond´er´e pour des donn´ees longitudinales de comptage sous- et sur- dispers´ees : Application aux donn´ees de suivi de croissance des plantes.” (stage ing´enieur) 2007 : M. Zouch “Loi de Poisson pond´er´ee et famille exponentielle bidimensionnelle.” (stage M2)
2008 : I. Nefzi “Estimation dans les mod`eles lin´eaires mixtes et les mod`eles lin´eaires g´en´eralis´es mixtes. Application sur les donn´ees de pommiers.” (stage ing´enieur)
2010 : J. Peyhardi “Mod`eles markoviens `a transitions r´egies par des mod`eles lin´eaires g´en´eralis´es mixtes” (stage M2)
Participation `a la vie scientifique
• Participation au groupe de travail MODEST : Mod´elisation et d´ependance structurelle - I3M.
• Participation comme collaborateur ext´erieur `a l’´equipe Inria “Virtual Plants” dont la respons- abilit´e est assur´ee par C. Godin. C’est dans ce projet que s’inscrit la probl´ematique de la mod´elisation de donn´ees longitudinales de croissance des plantes.
•Reviewer pour les revues : Biometrics, Statistics and Computing, Journal de la Soci´et´e Fran¸caise de Statistique.
• S´ejour `a Piracicaba - Universit´e de Sao Paulo (Br´esil) du 10 au 17 novembre 2009 - cours pour chercheurs et doctorants sur les mod`eles mixtes en collaboration avec C. Demetrio (ESALQ - USP - Br´esil) et F. Mortier (CIRAD).
• Invitation de C. D´emetrio (ESALQ - USP - Br´esil) `a Montpellier pour un mois (juin 2011).
• Cours mod`eles mixtes du 21 au 28 juin 2011 - cours pour chercheurs et doctorants du CIRAD avec C. Demetrio (ESALQ - USP - Br´esil) et F. Mortier (CIRAD).
• R´ealisation d’une ´etude pour l’ICV (Institut Coop´eratif du Vin) en 2006. `A partir des donn´ees rassembl´ees par l’ICV, nous avons propos´e avec C. Lavergne une mod´elisation permettant d’une part de comparer les performances des bentonites commerciales pour la stabilisation prot´eique des vins et d’autre part d’optimiser le choix de la dose de bentonite utilis´ee en cours ou apr`es fermentation alcoolique. Les r´esultats de cette ´etude ont ´et´e pr´esent´es au congr`es de l’office international du vin.
• R´ealisation d’une contre-expertise scientifique dans le cadre des affaires juridiques de l’INRA en novembre 2006.
Publications
• Publications en statistique
[1] Bry X., Trottier C., Verron T., Mortier F. ”Supervised Component Generalized Linear Regression using a PLS-extension of the Fisher scoring algorithm”, Journal of Multivariate Analysis (2013), pp. 47-60
[2] Chaubert - Pereira F., Gu´edon Y., Lavergne C., Trottier C. ”Markov and Semi-Markov Switching Linear Mixed Models Used to Identify Forest Tree Growth Components.”
Biometrics (2010), 66(3), pp. 753-762.
[3] Martinez M.-J., Lavergne C., Trottier C. “A mixture model-based approach to the clustering of exponential repeated data.”
Journal of Multivariate Analysis (2009), 100(9), pp. 1938-1951.
[4] Lavergne C., Martinez M.-J., Trottier C. “Empirical Model Selection in Generalized Linear Mixed Effects Models”
Computational Statistics (2008), 23(1), pp. 99-110.
[5] Diebolt J., Garrido M., Trottier C. ”Improving extremal fit: a Bayesian regularization procedure.” Reliability Engineering and System Safety (2003), 82, pp. 21-31
[6] Trottier C. ”A quasi-score marginal approach in generalized linear mixed models.”
Statistics (2000), 33(4), pp. 291-308
[7] Lavergne C., Trottier C. ”Sur l’estimation dans les mod`eles lin´eaires g´en´eralis´es mixtes.” Revue de Statistiques Appliqu´ees (2000), XLVIII (1), pp. 45-63
[8] Trottier C. “Estimation dans les mod`eles lin´eaires g´en´eralis´es `a effets al´eatoires”.
Th`ese de doctorat de l’Institut National Polytechnique de Grenoble - juillet 1998
• Publications appliqu´ees
[1] Dambreville A., Lauri P.-E., Gu´edon Y., Trottier C., Normand F. ”Deciphering structural and temporal interplays during the architectural development of mango trees”, Journal of Experimental Botany (2013), doi:10.1093/jxb/ert105
[2] Lauri P.-E., Gorza O., Cochard H., Martinez S., Celton J.-M., Ripetti V., Lartaud M., Bry X., Trottier C. and Costes E. ”Genetic determinism of anatomical and hydraulic traits within an apple progeny” Plant, Cell and Environment (2011), 34, pp. 1276-1290 [3] Lauri P.-E., Kelner J. J., Trottier C., Costes E. “Insights into secondary growth in perennial plants: its unequal spatial and temporal dynamics in the apple (Malus domestica) is driven by architectural position and fruit load.”
Annals of Botany (2010) (doi: 10.1093/aob/mcq006).
[4] Normand F., Pambo Bello A. K., Trottier C. and Lauri P.-E. “Is axis position within tree architecture a determinant of axis morphology, branching, flowering and fruiting
? An essay in mango.”
Annals of Botany (2009), 103, pp. 1325-1336.
[5] Lauri P.-E., Bourdel G., Trottier C. and Cochard H. “Apple shoot architecture:
evidence for strong variability of bud size and composition and hydraulics within a branching zone.”
New Phytologist (2008), 178, pp. 798-807.
[6] Han H.-Hee., Coutand C., Cochard H., Trottier C. and Lauri P.-E. “Effects of shoot bending on lateral fate and hydraulics: invariant and changing traits across five apple genotypes.”
Journal of Experimental Botany (2007), 58(13), pp. 3537-3547.
[7] Lauri P.-E., Maguylko K. and Trottier C. “Architecture and size relations: an essay in the apple (Malus x domestica) tree.”
American Journal of Botany (2006), 93(3), pp 357-368.
[8] Lauri P.-E., Trottier C. “Patterns of size and fate relationships of contiguous organs in the apple (Malus domestica) crown.”
New Phytologist (2004), 163, pp 533-546.
• Communications
[1] Peyhardi J., Trottier C., and Gu´edon Y. ”A unifying framework for specifying generalized linear models for categorical data”, 28th International Workshop on Statistical Modeling, Italie (2013)
[2] Peyhardi J., Costes E., Caraglio Y., Lauri P.-E., Trottier C., Gu´edon Y. ”Integrative models for analyzing jointly shoot growth and branching patterns”, 7th International Workshop on Functional Structural Plant Models, Finlande (2013)
[3] Bry X., Trottier C., Verron T., Mortier F. ”Supervised Component Generalized Linear Regression using a PLS-extension of the Fisher scoring algorithm”, COMPSTAT 2012, Chypre (2012)
[4] Trottier C., Bry X., Mortier F., Verron T. ”Component based Generalized Linear Regression using a PLS extended variant of the Fisher scoring algorithm”, 57a Reunio anual da RBRAS, Br´esil (2012)
[5] Peyhardi J., Trottier C., and Gu´edon Y. “GLM multinomial hi´erarchique”, 44`emes journ´ees de statistique, Bruxelles, Belgique (2012)
[6] Guerrero H., Mondain M., Amy De La Bret`eque B., Serrafero P., Trottier C., Barkat-Defradas M. “Etude comparative de la voix de l’enfant implant´e cochl´eaire et de l’enfant sourd appareill´e de 5 `a 13 ans”, ORPHEO, Campus orthophonique d’´et´e : Surdit´e et Orthophonie, La Grande Motte - France (2010)
[7] Guerrero H., Mondain M., Amy De La Bret`eque B., Serrafero P., Trottier C., Barkat-Defradas M. “Identification et caract´erisation acoustique et physiologique des troubles vocaux manifest´es chez l’enfant implant´e cochl´eaire”, 3◦ Journ´ees de Phon´etique Clinique, Aix en Provence - France (2009)
[8] Trottier C., Lavergne C., Gu´edon Y., Zouch M. “Weighted Poisson mixed model for underdispersed longitudinal count data”, 40`emes joun´ees de statistique, Ottawa, Canada (2008)
[9] Chaubert-Pereira F., Gu´edon Y., Lavergne C., Trottier C. “Semi-Markov switching linear mixed model for analyzing forest tree development”, International Biometric Conference (IBC), Irlande (2008)
[10] Chaubert - Pereira F., Gu´edon Y., Lavergne C., Trottier C. “Estimating Markov and semi-Markov switching linear mixed models with individual-wise random effects”
COMPSTAT’2008, 18th Symposium of IASC, Volume II, pp. 11-18 (2008)
[11] Chaubert F., Caraglio Y., Lavergne C., Trottier C., Gu´edon Y. “A statistical model for analyzing jointly growth phases, the influence of environmental factors and inter- individual heterogeneity. Applications to forest trees.” 5th International Workshop on Functional-Structural Plant Models (2007), Napier, New Zealand, p. 43
[12] Chaubert F., Gu´edon Y., Lavergne C., Trottier C. “Combinaison markovienne de mod`eles lin´eaires g´en´eralis´es pour donn´ees structur´ees en phases”. 39`emes Journ´ees de Statistique (SFDS), Angers - France (2007)
[13] Martinez M.-J., Lavergne C. and Trottier C., “Finite mixture model for exponential repeated data.” International conference on Statistical Latent Variable Models in the Health Sciences, Perugia, Italie (2006)
[14] Trottier C., Lavergne C. “Une h´et´erog´en´eit´e dans les mod`eles lin´eaires g´en´eralis´es mixtes”, 30`emes journ´ees de statistique, Rennes - France (1998)
[15] Lavergne C. & Trottier C. “From a conditionnal to a marginal point of view in GL2M” in : Good Statistical Practice C.E.Minder & H. Friedl (editors) pp. 205 - 209, Proceedings of the 12th International Workshop on Statistical Modelling - Suisse (1997) [16] Trottier C. “Les mod`eles lin´eaires g´en´eralis´es mixtes : extension de la m´ethode GAR”,
29`emes journ´ees de statistique, Carcassonne - France (1997)
[17] Trottier C., Lavergne C. “Estimation des composantes de la variance dans un GL2M”, 28`emes journ´ees de statistique, Canada (1996)
