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Le phénotypage précoce de traits racinaires du soja au service de la caractérisation de la diversité variétale et de la conception de systèmes de culture agroécologiques

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Academic year: 2021

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Texte intégral

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HAL Id: hal-03169376

https://hal.inrae.fr/hal-03169376

Submitted on 15 Mar 2021

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Le phénotypage précoce de traits racinaires du soja au service de la caractérisation de la diversité variétale et de la conception de systèmes de culture agroécologiques

Elana Dayoub, Jay Ram Lamichhane, Luc Champolivier, Colette Quinquiry, Philippe Debaeke, Pierre Maury

To cite this version:

Elana Dayoub, Jay Ram Lamichhane, Luc Champolivier, Colette Quinquiry, Philippe Debaeke, et al..

Le phénotypage précoce de traits racinaires du soja au service de la caractérisation de la diversité variétale et de la conception de systèmes de culture agroécologiques. Les 3e Rencontres Francophones sur les Légumineuses (RFL3), Feb 2021, Angers, France. �hal-03169376�

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Idéotype de soja pour une stratégie d’évitement de la sécheresse (Dayoub et al., 2021)

Le phénotypage précoce de traits racinaires du soja au

service de la caractérisation de la diversité variétale et de la conception de systèmes de culture agroécologiques

Dayoub E.1, Lamichhane J R.2, Champolivier L.3, Quinquiry B.1, Debaeke P.2, Maury P.1

Résultats

Le soja (Glycine max (L.) Merr.) possède de nombreux atouts pour contribuer à la transition agroécologique des systèmes de culture en Europe, cependant sa production est fortement impactée par la sécheresse estivale. Les caractéristiques du système racinaire, y compris en phase précoce, apparaissent essentielles pour augmenter et stabiliser le rendement sous climat actuel et futur (Battisti et al., 2017).

Cette étude vise à phénotyper les traits racinaires pour une gamme de variétés de référence au sein d’un continuum phénotypage-modélisation-conception de nouveaux idéotypes (Schoving et al., 2020).

1. Université de Toulouse, INRAE, INP-ENSAT Toulouse, UMR AGIR, F-31320, Castanet-Tolosan, France 2. Université de Toulouse, INRAE, UMR AGIR, F-31320, Castanet-Tolosan, France

3. Terres Inovia – Institut technique des oléagineux, des protéagineux et du chanvre, F-75378, Baziège, France

La Région Occitanie Pyrénées-Méditerranée et les partenaires Sojamip (Euralis Semences, RAGT2n, Terres Inovia, Terres Univia, INP- ENSAT, INP-PURPAN ,INRA) sont remerciés pour leur soutien financier et leur implication dans les expérimentations

Discussion et Perspectives

Variabilité intraspécifique des traits morpho- physiologiques

Typologie de croissance précoce des variétés

Groupe 1 (cv. Isidor)  croissance précoce élevée

Groupes 2 et 3 (cv. Pallador)  croissance précoce faible et interactive avec l’état hydrique du sol

Traits architecturaux affectés par l’état hydrique du sol

Variation variétale

Effet hydrique Témoin Sec

Angle racinaire (°) 43 - 57 58 - 71

Vitesse d’enracinement en

profondeur (cm jour-1) 2.9 - 4 3.7 - 4.8

Vitesse d’enracinement latéral

(cm jour-1) 1.4 - 2 0.8 - 1.5

- Vitesse en profondeur rapide - Vitesse en latéral lente

Racines plus profondes - Nombre d’extrémités racinaire

Plus des racines latérales - Forte biomasse racinaire - Longueur élevée

- Diamètre faible

- Volume et surface élevées

Acquisition des ressources - Angle élevé (> 60°)

Racines plus profondes - Forte biomasse aérienne - Longueur de tige élevée

Vigueur des plantules

Témoin hydrique Moyenne Variation variétale

Longueur de tige (cm) 9.02 7 - 10.9 ***

Biomasse aérienne (mg) 148 122 - 185 ***

Biomasse racinaire (mg) 24 14 - 37 ***

Longueur racinaire (cm) 156 94 - 248 ***

Diamètre racinaire (mm) 0.53 0.5 - 0.6 * Volume racinaire (cm3) 0.34 0.2 - 0.5 ***

Surface racinaire (cm2) 26 16 - 38 ***

Nombre d’extrémités racinaire 140 86 - 204 ***

Caractérisation des traits racinaires (morpho-physiologiques et architecturaux) pendant la phase précoce pour des variétés de soja cultivées en Europe.

Les variétés ayant une profondeur, une longueur et un angle racinaires élevés sont de bonnes candidates à l’évitement du stress hydrique via une meilleure exploration du sol (à valider à des stades plus avancés et dans d’autres conditions de culture).

De nouvelles stratégies agronomiques mobilisant la diversité variétale pourront être testées pour améliorer l’efficience hydrique du soja face au changement climatique.

***, * : effets significatifs de la variété

Sec Témoin

Traits architecturaux

-Angle racinaire

-Profondeur racinaire -Largeur racinaire

Traits morpho-physiologiques

-Longueur de tige -Biomasse aérienne

-Longueur racinaire totale -Diamètre racinaire

-Volume et surface racinaires -Nombre d’extrémités racinaire -Biomasse racinaire

Matériel et Méthodes

-10 variétés de soja de différents groupes de maturité (de 000 à II)

-Minirhizotrons (24.5 x 24.5 x 2.5 cm), en chambre de culture (25°C)

- 2 états hydriques du sol :

Témoin (humidité volumique ~ 25%) Sec (humidité volumique ~ 12.5%)

- 8 répétitions, 160 plantes au total

Prélèvement à 10 jours après le semis

Suivi dynamique d’enracinement

(WinRhizo 2013e program)

2020

Traits architecturaux

Traits morpho-physiologiques

Stress hydrique

Croissance précoce

Références:

1. Battisti, R., Sentelhas, P.C., 2017. Improvement of soybean resilience to drought through deep root system in Brazil. Agron. J. 109, 1612–1622. https://doi.org/10.2134/agronj2017.01.0023

2. Dayoub, E., Lamichhane, J.R., Schoving, C., Debaeke, P., Maury, P., 2021. Early-Stage Phenotyping of Root Traits Provides Insights into the Drought Tolerance Level of Soybean Cultivars. Agronomy 11, 188. https://doi.org/10.3390/agronomy11010188

3. Schoving, C., Stöckle, C.O., Colombet, C., Champolivier, L., Debaeke, P., Maury, P., 2020. Combining Simple Phenotyping and Photothermal Algorithm for the Prediction of Soybean Phenology: Application to a Range of Common Cultivars Grown in Europe. Front. Plant Sci.

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