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B ases écologiques d'une veille moléculaire chez les microbes et parasites transmis par les rongeurs.

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Academic year: 2022

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(1)

L

a multiplicité des circonstances par lesquelles un agent m i c robien peut être capturé par un hôte dépend, pour simplifier, de 2 types de processus: ceux qui sont relatifs à la re n c o n t re entre l'hôte et le microbe (étudiés notamment en éco- logie, biologie des populations, et éthologie) et ceux qui sont relatifs à la compatibilité entre les deux organismes (étudiés notamment en immunologie et biologie moléculaire). Le g roupe des rongeurs est constitué par des espèces généralement de petite taille présentes dans virtuellement tous les milieux continentaux. Par contacts entre espèces génétiquement proches, et, de ce point de vue, plus proches de l'homme que ne le sont bien d'autres mammifères, elles peuvent offrir de multiples chaînes de contamination. Nombre de ces espèces présentent des fluctuations pluriannuelles d'abondance qui peuvent être multipliées par la biomasse présente, jusqu'à faire du groupe un élément majeur de structuration des bio- cénoses de vertébrés terre s t res de certains écosystèmes. La veille microbiologique concernant ce groupe doit donc s'in- t é resser simultanément à la réémergence d'anciens et de nou- veaux types microbiens et identifier les conditions écologiques et démographiques qui rendent "à risque" pour l'homme telle ou telle situation particulière.

Il est matériellement impossible de mettre sous surveillance l'ensemble des pathogènes, connus et inconnus, en tous temps et en tous points du globe, fussent-ils transmis uniquement par des rongeurs, ou de s'essayer à une combinatoire illimitée portant sur les résultats attendus de contacts potentiels entre

centaines d'espèces, dans des circonstances qui peuvent varier à l'infini. Une des stratégies imposée par cette impossibilité logistique et conceptuelle consiste à hiérarchiser les priorités en fonction de considérations épidémiologiques et écolo- giques empiriques. Les pre m i è res amènent à porter l'attention sur les zones d'endémie connues et leur périphérie. Elles sui- vent les phénomènes, au mieux à leur début, et ne perm e t- tent que trop rarement des anticipations. Les secondes, en cours de mise au point, prennent acte de ce que la plupart des é m e rgences de maladies transmises par les rongeurs à l'homme le sont suite : (1) à un pic démographique d'une espèce au sein d'une communauté plurispécifique ; (2) à l'installation d'une nouvelle espèce dans l'écosystème ou (3) à des change- ments dans les comportements humains. Les bouleversement de milieux qui déterminent les changements de régime démo- graphique chez les rongeurs, ou l'apparition de nouvelles espèces dans une communauté, ont presque toujours une ori- gine anthropique. Un des enjeux majeurs est donc de rendre la veille microbiologique plus efficace en la dotant d'outils de surveillance permettant de détecter où, quand, et à quelles échelles, les changements démographiques affectent les popu- lations de rongeurs. La mise en œuvre d'outils indiciaire s d'estimation de densités relatives dans le cadre des concepts de l'écologie du paysage et des communautés pourrait appor- ter de nouvelles perspectives dans ce domaine et perm e t t re de contextualiser de façon raisonnée et réaliste des re c h e rc h e s en nature sur les bases moléculaires de la transmission inter- espèces.

B ases écologiques d'une veille moléculaire chez les microbes et parasites transmis par les rongeurs.

Summary:Ecological basis of molecular surveillance for microbes and parasites spread by rodents.

The multiplicity of circumstances by which a host can capture a microbiological agent can be b r oken down into two simplified processes:

1. encounter between host and microbe, 2. compatibility of two organisms.

Given that rodents include species of generally small size, inhabiting continental areas in closer proximity to man than many other mammals, they offer numerous chain of contamination. Micro - biological surveillance must both consider the emergence of old and new microbial types and iden - tify ecological and demographic condition placing man at risk. Since it is materially impossible to survey all existing pathogens, priorities must be set according to empirical, epidemiological and eco - logical considerations. One of the major challenges is how to make microbiological surveillance more effective by way of new tools for detecting demographic changes in rodent populations.

P. Giraudoux (1), P. Delattre (2) & F. Raoul (1)

(1) Laboratoire de biologie et écophysiologie - Centre collaborateur de l'Organisation mondiale de la santé pour la prévention et le traitement des échinococcoses humaines, Université de Franche-Comté,25030 Besançon, France. E-mail : Patrick.Giraudoux@univ-fcomte.fr

(2) Laboratoire de biologie et gestion des pullulations - Institut national de la recherche agronomque (INRA),Université de Montpellier 11,34095 Montpellier, France.

3e colloque du réseau international des Instituts Pasteur et instituts associés. 14-15 octobre 1999,Institut Pasteur de Paris.

ecology epidemiology chain of contamination rodent

écologie épidémiologie chaîne de transmission rongeur

B A S E S M O L É C U L A I R E S D E L A T R A N S M I S S I O N I N T E R E S P È C E S

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