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PGR Conservation

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Academic year: 2021

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Texte intégral

(1)

Université Frères Mentouri Constantine

Facult é des Sciences de la Nature et de la Vie D é partement de Biologie et Ecologie Végétale

Master en Biologie et Génomique végétale

Cours de : Biotechnologie et Amélioration des Plantes

PGR Conservation

(2)

PGR Conservation PGR Conservation

Aires protégées (réserves, parcs nationaux)

Banques de gènes

Plantations, Populations d’amélioration (essais), jardins botaniques, peuplements conservatoires

In vitro conservation de graines, pollen et tissus

CONSERVATION

ex-situ

Aires protégées (réserves, parcs nationaux)

Forêts naturelles gérées à des fins de production ou de protection

Parcs agroforestiers, forêts sacrées

in-situ

Forêts naturelles Plantations Champs des producteurs

(3)

Méthodes de conservation Méthodes de conservation

L’utilisation des techniques de culture in vitro est d’un grand intérêt pour conserver :

1) les ressources génétiques d’espèces à semences récalcitrantes et propagées végétativement ;

végétativement ;

2) les produits de la biotechnologie (génotypes élite, lignées cellulaires productrices de métabolites, matériel génétiquement modifié) ;

3) les espèces rares et menacées.

(4)

Méthodes de conservation Méthodes de conservation

La conservation à moyen terme est réalisée en réduisant la croissance du matériel végétal, ce qui permet d’espacer les repiquages. Des protocoles de stockage en croissance ralentie sont employés pour de nombreuses espèces tropicales et tempérées.

de nombreuses espèces tropicales et tempérées.

Pour la conservation à long terme, la cryoconservation (azote liquide, -196 °C) permet de stocker le matériel végétal sans modifications ni altérations pendant des durées prolongées, à l’abri des contaminations et avec un entretien réduit.

(5)

Méthodes de conservation Méthodes de conservation

La cryoconservation est bien développée avec les espèces à multiplication végétative.

Les recherches sont nettement moins avancées avec les espèces à semences récalcitrantes, du fait de les espèces à semences récalcitrantes, du fait de certaines de leurs caractéristiques, telles leur sensibilité élevée à la dessiccation,

leur complexité structurale

et leur hétérogénéité en termes de stades de développement et de teneur en eau à maturité.

(6)

Conservation en

Conservation en croissance ralentie croissance ralentie

Pour la croissance en vie ralentie, la technique la plus largement utilisée est la réduction de la température qui peut être combinée avec une diminution de l’intensité combinée avec une diminution de l’intensité lumineuse ou avec une culture à l’obscurité.

Des températures de l’ordre de 0-5 °C sont

employées pour les espèces tolérantes au

froid.

(7)

Conservation en

Conservation en croissance ralentie croissance ralentie

Les espèces tropicales sont souvent sensibles au froid et doivent être conservées à des températures plus élevées, qui dépendent de leur sensibilité au froid. Diverses modifications peuvent également être apportées au milieu de culture afin de ralentir la apportées au milieu de culture afin de ralentir la croissance.

Les techniques de conservation à moyen terme sont utilisées en routine pour de nombreuses espèces, à la fois d’origine tropicale et tempérée, telles que la pomme de terre, les Musa spp. et le manioc.

(8)

Conservation en

Conservation en croissance ralentie croissance ralentie

En 1996, la FAO recensait environ 38 000 accessions conservées in vitro en vie ralentie.

Si la conservation in vitro semble une option simple et pratique pour la conservation à moyen terme de nombreuses espèces,

son utilisation nécessite une adaptation à chaque nouveau matériel ainsi que des apports continus d’intrants,

(9)

Conservation en

Conservation en croissance ralentie croissance ralentie

Des questions se posent quant à la stabilité génétique du matériel stocké pour certaines espèces.

Des directives techniques ont été publiées récemment qui peuvent servir de guide aux chercheurs et gestionnaires des banques de gènes pour l’établissement et la gestion des collections in vitro de ressources génétiques.

(10)

Avantage Avantage ::

Faible

Faible surface / jardin botaniquesurface / jardin botanique

Inconvénients Inconvénients ::

Importantes

Importantes charges de travailcharges de travail

Exemple

Exemple : : Conservation de cultures Conservation de cultures de bananes

de bananes Cultures

Cultures in vitro in vitro en conditions de croissance réduite :en conditions de croissance réduite :

Importantes

Importantes charges de travailcharges de travail risque de pertes : contaminations, risque de pertes : contaminations, erreur humaine

erreur humaine variations

variations somaclonalessomaclonales

http://www.biw.kuleuven.be

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Stockage à

Stockage à ––196196°°CC

Meilleure solution : la

Meilleure solution : la cryopréservation cryopréservation

Cryoconservation

Cryopréservation de cultures de tissus (100 espèces)

Cyopréservation de graines récalcitrantes (40 espèces)

Conservation de souches de cellules fortement productrices de métabolites secondaires

Conservation de tissus génétiquement modifiés

(12)

Conservation de matériel vivant à très Conservation de matériel vivant à très basse température

basse température

◦◦ Azote liquide (Azote liquide (--196196°°C)C)

◦◦ Vapeurs d’azote (Vapeurs d’azote (--150150°°C)C)

Cryoconservation Cryoconservation

Cryoconservation

◦◦ Vapeurs d’azote (Vapeurs d’azote (--150150°°C)C)

État de vie suspendue, réversible État de vie suspendue, réversible

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Problématique : Problématique :

Conservation d’espèces en voie de disparition :

Objectif agronomique : réservoir de variabilité utilisable pour des plans de sélection Objectif médical : réservoir de substances actives inconnues

Objectif éthique : préservation d’une richesse de nature non-marchande

Conservation de variétés agronomiques ou horticoles intéressantes

Éviter de perdre les variétés tombées en abondance

Érosion génétique des espèces à multiplication végétative

Graines récalcitrantes Espèces à multiplication végétative (pomme de terre, bananier, manioc)

Souches de culture in vitro Conservation de graines

orthodoxes à basse température

(14)

Applications Applications

La résistance à la congélation a été prouvée pour de nombreux matériels (semences orthodoxes et intermédiaires, bourgeons dormants, pollen, cultures in vitro ).

Cryoconservation

Le développement de la cryoconservation est

beaucoup plus avancé pour les espèces

multipliées végétativement que pour celles à

semences récalcitrantes.

(15)

Principes Principes

Les progrès réalisés récemment dans la mise au point de techniques simples et performantes de cryoconservation et dans la compréhension des phénomènes physiques

Cryoconservation

compréhension des phénomènes physiques

et biochimiques y afférant devraient

accroître son emploi dans les programmes de

conservation des ressources génétiques et de

biotechnologie.

(16)

Principes Principes

Éviter la formation de cristaux dans le cytoplasme

◦ Congélation rapide

◦ Déshydratation des échantillons

Séchage à l’air

Cryoconservation

Séchage à l’air

Déshydratation par congélation lente

(17)

Déshydratation par congélation Déshydratation par congélation

Prérefroidissement (- 40°C)

H2O

Cryoconservation

Formation de cristaux dans le milieu extracellulaire

Le cytoplasme reste en surfusion

Abaissement du potentiel hydrique du

milieu extracellulaire H2O

H2O

Déshydratation de l’échantillon

(18)

Vitrification du milieu intracellulaire Vitrification du milieu intracellulaire

Solidification non-cristalline du cytoplasme

◦ Concentration de solutés osmoprotectants

Cryoconservation

◦ Concentration de solutés osmoprotectants

◦ Congélation rapide

(19)

Substances

Substances cryoprotectrices cryoprotectrices

DMSO, glycérol, proline

Adaptation métabolique:

◦ Froid

◦ Réduction photopériode

◦ ABA

[solutés ]

Sucres, proline,

Cryoconservation

◦ ABA

Sucres, proline,

glycine bétaïne

(20)

Cryoconservation

Exemple de cryoconservation

Exemple de cryoconservation

(21)

Cryoconservation

(22)

Cryoconservation

Récipient d’azote liquide avec des échantillons

végétaux

cryopreservées

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