Exploration du réseau d’interactions impliqué dans la maintenance génomique de l'Archaea hyperthermophile Pyrococcus abyssi

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Submitted on 4 May 2015

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Exploration du réseau d’interactions impliqué dans la maintenance génomique de l’Archaea hyperthermophile

Pyrococcus abyssi

Pierre-François Pluchon

To cite this version:

Pierre-François Pluchon. Exploration du réseau d’interactions impliqué dans la maintenance génomique de l’Archaea hyperthermophile Pyrococcus abyssi. Biologie moléculaire. Université de Bretagne occidentale - Brest, 2012. Français. �NNT : 2012BRES0070�. �tel-01148105�

THÈSE / UNIVERSITÉ DE BRETAGNE OCCIDENTALE

sous le sceau de l’Université européenne de Bretagne pour obtenir le titre de DOCTEUR DE L’UNIVERSITÉ DE BRETAGNE OCCIDENTALE

Mention : Biologie Moléculaire & Cellulaire École Doctorale: EDSM

présentée par

Pierre-François Pluchon

Préparée au Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes - UMR6197

Exploration du réseau d’interactions impliqué dans la maintenance génomique de l'Archaea hyperthermophile Pyrococcus abyssi

Thèse soutenue le 18 décembre 2012 devant le jury composé de :

Docteur Hannu MYLLYKALLIO

Laboratoire d’Optique et Biosciences. Ecole Polytechnique.

Rapporteur.

Docteur Laurent TERRADOT

Biologie structurale des complexes macromoléculaires bactériens, IBCP. Rapporteur

Professeur Mohammed JEBBAR

Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, IUEM. Examinateur.

Professeur Viannet PICHERAU

Laboratoire des Sciences de l’Environnement Marin, IUEM. Examinateur.

Docteur Didier FLAMENT

IFREMER, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes. Directeur de thèse.

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Cytidine Deaminase RPA32 Indéterminé e

Uracile-DNA glycosylase RPA32163–217 29–75, N-terminus cd

Rad52 RPA70169–326 221–280 ac

RPA32224–271 b

SV40 T antigen RPA70181–327 Origin binding domain 131–249 ab

RPA32C c

XPA RPA70183–296 20–46 be

RPA32C a

p53 RPA70N1–120 38–58 ace

ATRIP RPA70N 1–107, other? e

FACT RPA70N Pob3237–477 ade

Rad51 RPA70181–291 1–93 ac

Werner syndrome helicase RPA70168–308 N-terminal acidic region, C-terminus abd Bloom syndrome helicase RPA70168–308 N-terminal acidic region, C-terminus abd

Papillomavirus E1 RPA70181–291 Indeterminé ab

Parvovirus NS1 RPA70, RPA32 Indeterminé b

Pol-prim RPA701–327 Primase p48/58 ab

RPA32/14?

RF-C RPA70 p140, p40, p28 b

Rad9 RPA70, RPA32 Indeterminé a

Rad17 RPA70, RPA32/14 Indeterminé ae

p53BP1 RPA70, RPA32 Indeterminé a

Nucleolin RPA14 645–707 ae

BRCA2 Indeterminé N-terminus ae

XPG Indeterminé Indeterminé ae

XPF–ERCC1 Indeterminé Indeterminé ae

Mre11–Rad50–Nbs1 Indeterminé Indeterminé e

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DNA ligase Stimulation de l’activité ligase OFP

Flap endonuclease (Fen-1) Stimulation de l’activité nucléase OFP

RNase HII Régulation de l’activité OFP/Réparation

DNA polymerase Y1 (Pol Y1) Stimulation de l'activité polymérase Réparation

Radiation-sensitive mutant 2 (RAD2) Réparation

Uracil DNA glycosylase (UDG) Réparation

XPF Stimulation de l’activité nucléase Réparation

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