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Acquisition et gestion du fer par les plantes

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Academic year: 2021

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Texte intégral

(1)

Synthèse

Acquisition et gestion du fer par les plantes

Jean-

Fr

anço

i

s

Briat

Grégory Vert

Biochimie et physiologie moléculaire

des plantes,

Centre national de la recherche scientifique (UMR 5004),

Université Montpellier-11,

Institut national de la recherche agronomique et École nationale supérieure d'agronomie,

Place Viala,

F-34060 Montpellier cedex 1

<briat@ensam.inra.fr>

lirés à part : J.-F. Briat

Résumé

L'homéostasie du fer doit être conLrôlée tant au niveau cellulaire que de l'organisme entier pour fournir suffisamment de ·e métal essentiel à la croissance et au développement des

plantes, tout en évitant un excès qui pourrait être toxique. La carence en fer conduit à la chlorose chez les plantes, caractérisée par un jaunissement interne1vaire. Ce phénotype

révèle l'impact du manque de fer sur le conLenu des feuilles en chlorophylle et en

caroLénoïcles. La diminution de l'abondance en pigments photosynthétiques corrèle avec

la perte des capacités photochimiques des chloroplastes. La carence en fer altère également la respiration miLochonclriale et la fixalion de l'azote atmosphérique clans les

nodules des légumineuses. Ces perturbations méLaboliques sont étroitemenL liées au fait que le fer est un métal de transition indispensable comme cofacteur de nombreuses

réactions reclox cellulaires. Pour assurer l'acquisition du fer à partir du sol, sa distribution

aux différents organes et tissus d'une plante, et sa distribution intracellulaire entre les

différents organites, plusieurs membranes doivent être traversées par ce métal. De

nombreux transp rteurs impliqués clans ces fonctions ont été caractérisé au niveau moléculaire ces dix dernières années. La nécessité d'une régulation inLégrée de ces

différents systèmes de transpon requis pour la circulation du fer clans la plante entière est évidente, et plusieurs mutants altérés clans ces processus de signalisation ont été décrits.

À

l'inverse, les plantes se trouvant confrontées

à

un excès de fer mettent en place des

possibilités de stockage de ce métal pour contrôler sa réactiviLé toxique avec l'oxygène.

À

ce titre, l'apoplasme, les vacuoles et les ferritines des plastes jouent un rôle important.

Mots clés

: Pr

oductions végétales; métabolisme.

Summary

Iron homeostasis in plants

Iron homeostasis at cellular level and in the whole organism must be balanced in orcler to supply enough iron for the plant growth and development, and to avoicl excessive, toxic

levels. Iron cleficiency in plants leads to the chlorosis syndrom, characterized by a leaf

inte1veinal yellowing. Such a phenotype reveals the impact of iron deficiency on

chloropbyll and carotenoid concentrations. This clecrease in pbotosynthetic pigment

abunclance correlates with a I wering of the chloroplast photochemical capacities. Iron cleficiency also alters mitochondrial respiration and nitrogen fixation in the nodule of legumes. These defects are mainly due to the fact that iron is a major cofactor in many cellular reclox processes. In order to perform iron uptake from the environment, iron distribution to various organs and tissues, and iron intracellular compartmentalization, various membranes must be crossed by this metal. Many transporters involved in these

functions have been characterized at molecular level this last decacle. An integrated regulation of these transport systems required for iron t:rafficking in the whole organism is

therefore necessary, and various mutants affected in these signaling processes have already been characterized. On the opposite, in case of iron excess iron must be bufferecl

because of its high reactivity with oxygen. This is achieved through its storage in the apoplasm and vacuoles and by way of the iron storage protein ferritin founcl within the

plastids.

Key

worcls:

Vegetal productions; metabolism.

(2)

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Figure 1. Représentation schématique des centres fer-soufre [2Fe-2S] et [4Fe-4S].

Les atomes de soufre de résidus cystéine sont représentés en vert clair et ceux impliqués dans la formation du centre

fer-soufre en vert foncé. Les deux types de centres fer-soufre sont unis à la protéine par liaison avec les groupements thiols de certains résidus cystéine de la protéine (d'après 13]).

Figure 1. Schematic representation of iron-sulfur clusters [2Fe-2S] and [4Fe-4S].

(3)

A Espace intermembranaire (Fe-S)--+---11,.__

t

FMN

Matrice

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Complexe I

B

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Figure 2. Importance du fer pour la structure et la fonction respiratoire des mitochondries.

Complexe IV

- Fe

A) Organisation des éléments de la chaine de transport d'électrons dans la membrane mitochondriale interne. La chaine respiratoire est formée de quatre complexes de transporteurs

d'électrons et de deux transporteurs (l'ubiquinone et le cytochrome c) dont la localisation est indépendante.

Fe-S: protéine à centre fer-soufre; cyt: cytochrome (d'après 131).

B) Images de microscopie électronique de mitochondries de feuilles de plantes de tabac cultivées en présence I+ Fe) où en absence 1-Fe) de fer. La flèche sur l'image -Fe indique des

inclusions denses aux électrons fréquemment observées dans les mitochondries de plantes carencées en fer. Figure 2. Iron requirements for the structure and respiratory function of mitochondria.

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Cahiers Agricultures 2004

;

13

:

183-201

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(4)

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Figure 3. Importance du fer pour la structure et la fonction photosynthétique des chloroplastes.

A) Organisation de la chaîne photosynthétique de transport d'électrons.

Trois complexes membranaires sont représentés: le photosystème Il, le complexe cytochrome b6f, et le photosystème l. Le chemin suivi par les électrons est indiqué par la flèche verte. b559 : cytochrome b559 ; PO: plastoquinone; PQH2: plastoquinol; RFe-S: protéine de Rieske; b6: cytochrome b6 ; f: cytochrome f; PC: plastocyanine; Fx. accepteur X; FA: accepteur A;

Fe: accepteur B; Fdx: ferredoxine; FNR: ferredoxin-NAD+ reductase. Les protéines de Rieske, Fx, FA, Fe, et Fdx contiennent un centre Fe-S. (d'après 11491). B) Images de microscopie électronique de chloroplastes de feuilles de plantes de tabac cultivées en présence(+ Fe) ou en absence (-Fe) de fer.

Figure 3. Iron requirements for the structure and photosynthetic function of chloroplasts.

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a

in

es co

nditi

o

n

s

,

!'

i

so

-forme

cytosoli

que

d

e l'aco

nita

se

possède

a

u

ss

i un r

ôle

r

ég

ul

ate

ur

de

l

'

h

o

m

éos

ta

s

i

e

du f

e

r

c

h

ez

les

mammif

è

res

.

A

insi,

l

ors

d'une

ca

r

ence e

n f

e

r

, l'aco

nita

se cyto oli

(5)

qu

e

perd

son ce

mr

e

fer-soufre

,

e

ntraînant

l

a

di

s

p

a

riti

o

n d

e

l

'

ac

ti

v

it

é

aconitase.

L

e

c

hang

e

m

e

nt d

e co

nform

a

ti

o

n

a soc

i

é

à

ce

tt

e

p

e

rt

e

du

ce

ntr

e

f

e

r-

so

ufr

e

p

e

rm

e

t la

fi

xa

ti

o

n d

e

J"a

co

nit

ase

au

ni

vea

u d

e sé

-quen

ces s

1

éc

ifiqu

es

cl

'

ARN

,

e

t

m

odifie

a

in

s

i l'

ex

pr

ess

i

o

n d

e

n

o

mbr

e

u

x gè

n

es

im

-pliqu

és

clan

s

!

'

h

o

m

éos

t

as

i

e

du

fer

c

h

ez

l

es

m

a

mmif

è

r

es

[

5

).

n

e ca

r

e

n

ce e

n

fer

e

n-gendre

un

e a

lt

é

rati

o

n imp

o

rt

a

nt

e

d

e

la

s

tru

c

tur

e

des

mit

oc

h

o

ndri

es

(fig

ur

e

2B)

e

l

d

es

ch

l

orop

la

s

t

es (figure

J

B).

Les hémoprotéines

Ces

prot

é

in

es

p

ossède

nt un n

oya

u

t

é

tr

a

p

y

rr

o

liqu

e a

u

ce

ntr

e

duqu

e

l

es

t

e

n

-c

ha

ssé

un

atom

e

de fer.

L

o

r

s

qu

e

l

'

a

t

o

m

e

d

e

f

e

r

es

t

sous

l

a

form

e

r

é

duit

e

,

l

e g

r

o

u

-p

e

m

e

nt

prosLhétique

es

t

a

pp

e

l

é

h

è

m

e,

a

l

o

r

s

qu

'

il

es

t

a

pp

e

l

é

h

é

min

e

l

orsque

l'

ato

m

e

d

e

fer

es

t

so

u

s

l

a

f

o

rm

e

f

e

rriqu

e

.

L

e

f

e

r

est assoc

i

é

p

a

r

quatr li

a

i

so

n

s

d

e

coo

rdin

a

ti

o

n

avec

d

es

atomes

d

'

azote

pr

ése

nt

s

cl

a

n

s

l

e

n

oya

u t

é

tr

a

p

y

rroliqu

e.

Le

g

r

o

up

e

m

e

nt h

è

me

es

t

n

é

r

a

l

ement

li

é

d

e

façon

non

cova

l

e

nt

e

à

l

a

prot

é

in

e.

Néa

nmoin

s

,

clan

s ce

rtain

s cas

,

c'es

t le f

e

r

lui

-même

qui

assu

r

e

l

a

li

a

i

so

n

avec

d

es

acides

a

min

és

d

e

l

a protéine

co

mm

e

l

'

hi

s-tidin

e o

u l

a

m

é

thi

o

nin

e

,

grâce

a

ux ci

e

u

x

o

rbital

es a

t

o

miqu

e

r

esta

nt di

ponfüle

[2]. Le f

e

r

,

é

l

é

m

e

nt

co

n

s

titutif d

e

!

'

h

è

m

e.

es

t

in

co

rp

o

r

é a

u

e

in du n

oya

u p

o

rph

yri-qu

e

p

a

r un

e

r

éac

ti

o

n

ca

taly

sée

par

l

a

f

e

rr

oc

h

é

l

atase.

L

e

f

e

r

es

t

a

u

ss

i dir

ec

t

e-m

e

nt impliqu

é

cl

a

n

s

diff

é

r

e

nt

es éta

p

es

d

e

l

a vo

i

e

d

e

biosynthè

e

d

es

n

oya

u

x

por-ph

y

riqu

es

,

pr

éc

ur

se

ur

s

d

es

g

r

o

up

e

m

e

nt

s

h

è

m

es e

t d

es c

hl

o

rophy

ll

es

.

L

es cy

to

c

hr

o

m

es

,

prin

c

ipal

es

h

é

m

o-prm

é

ine

s

r

e

n

co

ntr

ées c

h

ez

l

es végé

tau

x,

so

m d

es

transporteurs

d

'

é

l

ect

r

o

n

s.

P

o

ur

l

es

m

ê

m

es

rai

so

n

s

qu

e

l

es

prot

é

ines

à

ce

nu·

e

fer-s

o

ufr

e

,

l

es

cytoc

hr

omes

co

n

s

ti

-tu

e

nt un

composa

nt maj

e

ur d

es c

h

aînes

d

e

tran

s

fert d

l

ec

tron

s

de

l

a

mit

oc

h

o

n-drie

(cytoc

hrom

es a

,

b

,

c) et

du

c

hloro

-pla

te

(cytoc

hr

o

m

es

b etf)

(jig11res

2

e

t

]).

D

'

autr

es

cytochromes

so

nt incl

é

p

e

nclant

s

d

es

c

h

aînes

r

es

piratoire

s e

t ph

otosy

nd1

é-tiqu

es

,

co

mm

e

l

es cy

to

c

hrom

es

b du r

é

ti-c

ulum

e

ncl

o

pla

s

miqu

e.

Ainsi,

l

es cy

t

o-c

hr

o

m

es

b

so

nt impliqu

és

n

ota

mment

cl

a

n

s

l

e

m

é

tab

o

li

s

m

e

de

s

acides gras.

Dans

to

u

s

l

es cas

,

l

e

f

e

r pa

sse s

u

ccess

i

ve-m

e

nt d

e

l

t

a

t r

é

duit

à

l'

é

tat

OÀ)'

d

é

a

u

co

ur

s

du tr

a

n

s

f

e

rt d

es é

l

ect

r

o

n

s.

L

es cy

to-c

hr

o

m

es

P450

p

ossè

d

e

nt

,

e

u

x

,

un

e ac

ti-v

it

é

de t

y

p

e

m

o

n

o-oxygé

n

ase e

t

o

nt

im-p

l

iqu

és

cl

a

n

s

un

g

r

a

nd n

o

mbr

e

d

e

pro

cess

u

s

cl

a

n

s

la pl

a

nt

e : sy

nth

è

.

e

d

e

co

mp

osés

t

e

l

s

que

ce

rt

a

in r

ég

ul

ate

ur

s

d

e

c

roi

ssa

n

ce,

d

é

t

ox

i

ca

ti

o

n d

e

div

e

r

s xé

n

o-bi

o

tiqu

es .

..

D

'

a

utr

es

pr

o

t

éi

n

es

à

h

è

m

e

imp

o

rt

a

nt

es

so

nt impliqu

ées

cl

a

n

s

l

'

assimi

l

a

ti

o

n cl

e

l

'

azote.

La

nitr

ate

r

é

du

c

t

ase

p

ossè

d

e

,

o

utr

e

un

g

r up

e

m

e

nt h

è

m

e

,

un

g

r

o

up

e-m

e

nt

FAO

e

t un

atome

d

e

m

o

l

y

bd

è

n

e.

L

es

é

l

ectro

n n

écessa

ir

es

à

l

a

r

é

du

c

ti

o

n du

nitrate

pr

ov

i

e

nn

e

nt du

NA

D

(

P

)

H

e

t

so

nt

tran

s

port

és se

l

o

n le

s

pot

e

nti

e

l

s

r

e

d

ox

c

r

o

i

ssa

nt p

a

r

l

e

FAD

,

l

e

f

e

r

,

pui

s

l

e

m

o

l

y

b

-d

è

ne. L

e

nitrit

e a

in

s

i

produit

se

rt

a

l

ors

cl

e

s

ub

stra

t

à

l

a

nitrit

e

r

é

du

c

ta

se, e

nz

y

m

e

à

cl11S!er

f

e

r-

so

ufr

e

mai

s

auss

i

à

h

è

m

e

qui

r

é

duit

l

es

nitrit

es e

n i

o

n

s

ammonium

.

Co

mm

e

cité

pr

écé

demm

e

nt

,

l

e

·

é

lectron

s

n

éces a

ir

es à

l

a

r

é

du

c

tion d

es

i

o

n

s

nitrit

es

pr

ov

i

e

nn

e

nt d

e

l

a

f

e

rr

é

clo

x

in

e,

une pro

-téine

f

e

r

-so

ufr

e.

L

es

p

é

r

o>.-y

cl

ases e

t

ca

t

a

l

a e so

nt d

es

h

é

m

o

pr

o

t

é

in

e

j

o

u

a

nt un r

ô

l

e

fondamen-tal

c

h

ez

l

es végé

taux.

E

n

effet

,

e

ll

es

parti-c

ip

e

nt

à

l

limin

at

i

on

d

'e

ntit

és c

himiqu

es

danger

e

u

se

·

p

o

ur

l

'

int

ég

rit

é

cle

l

a ce

llul

e

:

l

es es

p

èce

r

éact

i

ve

d

e

l'

ox-ygè

n

e.

Autres protéines à fer

Certe

cla

sse

cl

e

prot

é

in

es se c

aract

é

ri

se

par

l

a

pr

ése

n

ce

cl

'

a

tom

e(s)

d

e

f

e

r dir

ecte-m

e

nt

associé(s)

à

l

a

pr

o

t

é

in

e.

L

a

rib

o-nucléoticle

r

é

du

c

t

ase ca

tal

yse

l

a

r

éd

u

c

ti

o

n

d

'

un

ri

bonucléoside

clipho

s

phate

e

n

d

éso>.')'

rib

o

nucl

éos

id

e

ph

os

phat

e

n

éces-sa

ir

e

l

o

r

s

d

e

la

phase

S

cl

e

l

a

sy

nd1

èse

de

l

'

AD

N [6].

Chez

Escherichia

co

ti

,

l

a

le

v

ur

e

,

e

l

l

es

m

a

mmif

è

r

es

,

la rib

o

nucl

éo

ticle r

é

-ductase

co

nti

e

nt ci

e

u

x

ato

m

es

d

e

f

e

r r

éa-g

i

ssa

nt

avec

un

e

tyro

s

in

e

impliqu

ée

clan

s

l

a

fo

rm

ation

du

s

it

e ac

tif p

o

ur donner

un

radi

ca

l

t

y

r

osy

l

n

écessa

ir

e

à

l

a

réaction

cata

l

yt

iqu

e

[

2

]. L

es

lip

oxygé

n

ases co

nti

e

n-n

e

nt un

atome

d

e

fer d

o

nt

l

'

o>.-y

cl

a

ti

o

n

p

e

rm

e

t

l

e

ur

ac

ti

va

ti

o

n [

7

].

E

ll

es ca

t

a

l

yse

nt

l

'

o>.')'

clati

o

n d

es ac

id

es g

ras

e

t parti

c

ipent

à

l

a sy

nth

èse

d

e

l

'

acide

ja m

o

niqu

e c

h

ez

l

es végé

t

a

u

x

[8]. P

a

rmi

ces

prot

é

in

es

à

f

e

r

,

l

es

f

e

rritin

es

j

ouent

un r

ô

l

e fo

ndam

e

nt

a

l

clan

s

l

e

m

a

inti

e

n d

e

l

'

h

o

m

éos

L

as

i

e

clu f

e

r.

E

n

e

ff

et

,

l

es

ferritin

es so

nt

ca

p

a

bl

es

d

e

stocke

r l

e

f

e

r

so

u

s

un

e

forme

n

on

to

x

ique

e

t r

e

mobili

sa

b

l

e se

l

on

l

es

b

eso

in

s

d

e

l

a

plante [9).

Conséquences

métaboliques

de la carence en fer

Les protéines

à

fer

co

n

s

titu

e

nt

l

a

b

ase

d

e

pr

ocess

us m

é

t

a

b

o

liqu

es

m

a

j

e

ur

s c

h

ez

l

es

végé

tau

x,

n

ota

mm

e

nt l

a

ph

o

t

osy

nth

ès

(cytoc

hrom

es e

t prot

é

in

es

f

e

r

-so

ufr

e

d

e

l

a

c

h

n

e

d

e

tr

a

n

s

p

o

rt d

'

é

l

ect

r

o

n

s

du d1

y

-l

a

k

o

ïcl

e,

f

e

rr

é

d

ox

ine

)

,

l

a

r

es

pir

at

ion

(cyto

-c

hr

o

m

es e

t pr

o

t

é

in

es fe

r

-so

ufr

e

de

l

a

c

h

n

e

de

tr

a

n

spo

rt

de

l

a

membrane

in

-t

e

rn

e

mit

oc

h

o

ndrial

e.

acon

ita

se e

tsu

cc

in

o-d

és

hydr

ogé

na

se

du

cycle

d

e

Krebs

)

,

l

e

m

é

t

a

b

o

l

i

s

m

e

azoté (nimtte

e

t nitri

te

r

é-du

c

t

ase

,

g

lu

tamine

sy

nd1

ase

,

nitrogénase

bactérienne

,

ferrédoxine

,

ril

o

nucl

éo

ticl

e

r

éductase) e

t

so

ufr

é (s

uint

e

r

é

du

c

ta

se).

La

ca

r

e

n

e e

n f

e

r

es

t d

o

n

c s

u

sce

ptibl

e

d

'

affecte

r

d

e

t

e

l

s

pro

cess

us phy

s

iol

og

i

-qu

es

ainsi que

d

'a

utr

es vo

i

e

.

m

é

t

a

b

o

li

-qu

es

p

o

ur

l

esq

u

e

ll

es ce

t

é

l

é

m nt

es

t

n

é-cessa

ir

e,

limitant d

e ce

fai

t l

a

c

r

o

i

ssa

n

ce e

t

l

e

d

éve

l

o

pp

e

m

e

nt d

e

l

'

o

r

ga

ni

s

m

e

dan

s

so

n

e

n

se

mbl

e.

Le

s

plant

e

p

ossé

d

a

nt un

e

co

n

centration

d

e

f

e

r inf

é

ri

e

ure

à

50

pg.

g

-

1

cl

e

m

a

ti

è

r

e sèc

h

e

clans

l

e

ur

s

ti

ss

u

s

ont

co

n

s

id

é

r

ées co

mme

ca

r

e

n

cées

[10]. Il

es

t

t

o

utefoi

s

imp

o

rt

a

nt d

e

n

ote

r

que

l

a

nutri

-tion

optima

l

e

d

es

pl

a

nt

es

d

é

p

e

nd plu

s

d

'

un

rapport

éq

uilibr

é e

mr

e

l

es

diff

é

r

e

nts

é

l

é

m

e

nt

s

min

é

r

a

ux qu

e

cl

e

l

a co

n

ce

ntra

-ti

o

n

a

b

so

lu

e

d

e c

ha

c

un d

e ces é

l

é

m

e

nt

s

co

n

s

id

é

r

és sé

p

a

r

é

m

e

nt.

Impacts de la carence en fer

sur la photosynthèse

L

e c

hl

o

r

o

pl

as

t

e es

t

un li

e

u

m

a

j

e

ur

cl°L1tili-sation

du f

e

r

c

h

ez

l

es végé

t

a

u

x c

hl

o

r

o-ph

y

lli

e

n

s

pui

sq

u

'

il

co

nti

e

nt

80 %

du fer

ce

llul

ai

r

e

[11].

Plu

s

parti

c

uli

è

r

e

m

e

nt

,

l

'

a

p-p

a

r

e

il

phot

osy

nd1

é

tiqu

e co

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Figure 3.  Importance du fer pour  l a structure et  la fonction  photosynthét iqu e  des  ch l oroplastes
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