Algorithmes pour la reconstruction de séquences de marqueurs conservés dans des données de métagénomique
Texte intégral
Figure
![Figure 1.3 – Structure secondaire de l’ARNr 16S chez Escherichia coli [ 103 ]. Les 9 régions hypervariables (V1 à V9) sont indiquées en gras.](https://thumb-eu.123doks.com/thumbv2/123doknet/2494621.51148/27.892.162.666.161.807/figure-structure-secondaire-arnr-escherichia-regions-hypervariables-indiquees.webp)
![Figure 1.5 – Une vision récente de l’arbre du vivant [ 34 ]. La phylogénie présente une grande partie de la diversité connue et mentionne les noms des clades principaux les plus divergés](https://thumb-eu.123doks.com/thumbv2/123doknet/2494621.51148/31.892.54.767.155.1052/figure-recente-phylogenie-presente-diversite-mentionne-principaux-diverges.webp)
![Figure 2.5 – Différences entre un graphe de chevauchement et un graphe de De Bruijn pour l’assemblage [ 80 ]](https://thumb-eu.123doks.com/thumbv2/123doknet/2494621.51148/57.892.89.684.158.576/figure-differences-graphe-chevauchement-graphe-bruijn-l-assemblage.webp)
![Figure 2.7 – Exemple d’un algorithme de partitionnement, tel qu’implémenté dans UPARSE [ 23 ]](https://thumb-eu.123doks.com/thumbv2/123doknet/2494621.51148/63.892.80.743.173.515/figure-exemple-algorithme-partitionnement-qu-implemente-uparse.webp)
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